Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001375272.1
Sequence Length
5542 nt
GC Content
0.4621
CACUACUAAUCCGGACCGAACCGAUCCGGAUUAAGGGGCCGGAGGCGGGUCCUGGGCACCAGCGGUUCCGACCCCCCCGCCCUCCGCGCCGCACCCGAGUGGCCCCCAGCCGAGCGGGCCCCCACCUCCUGGCCCGGCCUGGGCCCUCCUGCGCCUCCCUUGGCCUUUGUCCGGCGCCAGGAGGCCGGUCCCGCGCCCCCCGCGGCCGCCCGGGCCCGGGCCCGCGUCGGGCGCCUGGCUCUGUACGCGAGCCCGGGGAUCUGCGGCCUUCGUGCCCCCCCUCCCCCGCCCGCCCUCUCGUGGAGCCCGGCGCCGGCGGCGGCUGCCCGGGCGGGGGGUUGCGGCGCUCAGGAGAGGCCCCGGCUCCGCCCCGGGCCUGCCCAGGGGGAGAGCGGAGCGGUCCGCAGCCGGGUCGGGUCGGGGCCCCUCCCGGGAGGAGCGUGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAAAUGAUGGAAGAAUUGCAUAGCCUGGACCCACGACGGCAGGAAUUAUUGGAGGCCAGGUUUACUGGAGUAGGUGUUAGUAAGGGACCACUUAAUAGUGAGUCUUCCAACCAGAGCUUGUGCAGCGUCGGAUCCUUGAGUGAUAAAGAAGUAGAGACUCCCGAGAAAAAGCAGAAUGACCAGCGAAAUCGGAAAAGAAAAGCUGAACCAUAUGAAACUAGCCAAGGGAAAGGCACUCCUAGGGGACAUAAAAUUAGUGAUUACUUUGAGCGACGAGUAGAACAGCCCCUCUAUGGUUUAGAUGGCAGUGCUGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGUCUGCUCUGCCAACCCUCAUGUCAGUGAUGCUAGCAAAACCUCGGCUUGACACAGAGCAGCUGGCGCAAAGGGGAGCUGGCCUCUGCUUCACUUUUGUUUCAGCUCAGCAAAACAGUCCCUCAUCUACGGGAUCUGGCAACACAGAGCAUUCCUGCAGCUCCCAAAAACAGAUCUCCAUCCAGCACAGACAGACCCAGUCCGACCUCACAAUAGAAAAAAUAUCUGCACUAGAAAACAGUAAGAAUUCUGACUUAGAGAAGAAGGAGGGAAGAAUAGAUGAUUUAUUAAGAGCCAACUGUGAUUUGAGACGGCAGAUUGAUGAACAGCAAAAGAUGCUAGAGAAAUACAAGGAACGAUUAAAUAGAUGUGUGACAAUGAGCAAGAAACUCCUUAUAGAAAAGUCAAAACAAGAGAAGAUGGCGUGUAGAGAUAAGAGCAUGCAAGACCGCUUGAGACUGGGCCACUUUACUACUGUCCGACACGGAGCCUCAUUUACUGAACAGUGGACAGAUGGUUAUGCUUUUCAGAAUCUUAUCAAGCAACAGGAAAGGAUAAAUUCACAGAGGGAAGAGAUAGAAAGACAACGGAAAAUGUUAGCAAAGCGGAAACCUCCUGCCAUGGGUCAGGCCCCUCCUGCAACCAAUGAGCAGAAACAGCGGAAAAGCAAGACCAAUGGAGCUGAAAAUGAAACGUUAACGUUAGCAGAAUACCAUGAACAAGAAGAAAUCUUCAAACUCAGAUUAGGUCAUCUUAAAAAGGAGGAAGCAGAGAUCCAGGCAGAGCUGGAGAGACUAGAAAGGGUUAGAAAUCUACAUAUCAGGGAACUAAAAAGGAUACAUAAUGAAGAUAAUUCACAAUUUAAAGAUCAUCCAACGCUAAAUGACAGAUAUUUGUUGUUACAUCUUUUGGGUAGAGGAGGUUUCAGUGAAGUUUACAAGGCAUUUGAUCUAACAGAGCAAAGAUACGUAGCUGUGAAAAUUCACCAGUUAAAUAAAAACUGGAGAGAUGAGAAAAAGGAGAAUUACCACAAGCAUGCAUGUAGGGAAUACCGGAUUCAUAAAGAGCUGGAUCAUCCCAGAAUAGUUAAGCUGUAUGAUUACUUUUCACUGGAUACUGACUCGUUUUGUACAGUAUUAGAAUACUGUGAGGGAAAUGAUCUGGACUUCUACCUGAAACAGCACAAAUUAAUGUCGGAGAAAGAGGCCCGGUCCAUUAUCAUGCAGAUUGUGAAUGCUUUAAAGUACUUAAAUGAAAUAAAACCUCCCAUCAUACACUAUGACCUCAAACCAGGUAAUAUUCUUUUAGUAAAUGGUACAGCGUGUGGAGAGAUAAAAAUUACAGAUUUUGGUCUUUCGAAGAUCAUGGAUGAUGAUAGCUACAAUUCAGUGGAUGGCAUGGAGCUAACAUCACAAGGUGCUGGUACUUAUUGGUAUUUACCACCAGAGUGUUUUGUGGUUGGGAAAGAACCACCAAAGAUCUCAAAUAAAGUUGAUGUGUGGUCGGUGGGUGUGAUCUUCUAUCAGUGUCUUUAUGGAAGGAAGCCUUUUGGCCAUAACCAGUCUCAGCAAGACAUCCUACAAGAGAAUACGAUUCUUAAAGCUACUGAAGUGCAGUUCCCGCCAAAGCCAGUAGUAACACCUGAAGCAAAGGCGUUUAUUCGACGAUGCUUGGCCUACCGAAAGGAGGACCGCAUUGAUGUCCAGCAGCUGGCCUGUGAUCCCUACUUGUUGCCUCACAUCCGAAAGUCAGUCUCUACAAGUAGCCCUGCUGGAGCUGCUAUUGCAUCAACCUCUGGGGCGUCCAAUAACAGUUCUUCUAAUUGAGACUGACUCCAAGGCCACAAACUGUUCAACACACACAAAGUGGACAAAUGGCGUUCAGCAGCGGGUUUGGAACAUAGCGAAUCCGAAUGGAUCUGAUGAAACCUGUACCAGGUGCUUUUAUUUUCUUGCUUUUUUCCCAUCCAUAGAGCAUGACAGCAUCGAUUCUCAUUGAGGAGAAACCUUGGGCAGCUCCGGCCAGGCCUUGUAGGAAAAGGCCCCGCCCGAGGUUCCAGCGUCAACGGCCACUGUGUGUGGCUGCUCUGAGUGAGGAAAAAAUUAAAAAGAAAAACUGGUUCCAUGUACUGUGAACUUGAAAACUUGCAGACUCAGGGGGGUCCCUGAUGCAGUGCUUCAGAUGAAGAAUGUGGACUUGAAAAUACAGACUGGGCUAGUCCAGUGUCUAUAUUUAAACUUGUUCUUUUCUUUUAAUAAAGUUUAGGUAACAUCUCCUGAAAAGCUUGUAGCACAAAGGCUCAGCUGGGGAUGGUGUUUGACUUCGGAGGAAAAAAGUUGCUAUUGCCCGUUAAAGGCACUAGAGUUAGUGUUUUAUCCCUAAAUAAUUUCAAUUUUUAAAAACAUGCAGCUUCCCUCUCCCCUUUUUUAUUUUUGAAAGAAUACAUUUGGUCAUAAAGUGAAACCCGUAUUAGCAAGUACGUGGCAAUGUUCAUUCCAAUCAGAUGCAGCUUUCUCCUCCGUCUGGUCUCCUGUUUGCAAUUGCUUCCCUCAUCUCAGUAGGGAAAAAAUUGAGUGGGAGUACUGAGAUGUGUGGGUUUUUGCCAUUGGACAAAGAAUGAGGUUAGAAGACUGCAGCUUGGAGUCUCUCUAGGUUUUCAACUAUUUCUUCACAAUUUGAACACUUGACGGUUGUCCCUUUUAAUUUAUUUGAAGUGCUAUUUUUUUAAAUAAAGGUUCAUCUGUCCAUGCAGUCCUCUUGGAUUCUCUGAAUGUAGUAACUAUGAAGCUAUGCCAAAGGUAGGCAGAAAAUGGGCUUGGGAGCCAGACACUCCAGGGAUCAGUAGUUCCUACCCAUAGUCUUUGUGUGCUUGCUAAAUGGUGUACAUUUCUUGUUAACCACGUUAUUAAAACUUGAUCAGCACAUAAGCUUUCUUCUGUUAGAUCUUUUGGCAGCAAACAACCUUCCCCCCAAGCCUCUGAAUUUUGUGGGUGUGUGGUGGUGUGUGUCUGUGUGUGCAUGUACACACACACUUUGUCUAGCUCACUUUAAAAGAUUCAUCAAAUGGAAUUUUAAAAAUAAUCUGAAAAGAAAUAGAUAUUUCAGGCCGGGCCUGGUGGUUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGUGGAUCACGAGGUCGGGAGUUCGAGAUCAGUCUGGUCAACAUGGUGAAACGCCAUCUCUACUAAAAAUAUAAAAAUUAGCCUGGCGUGGUGGCGUGUGCCUCUAGUCCCAGCUACCCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUUCUGGAACCCAGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUGGCACCACUGCAAUCCAGCCUAGGCAACAGAAUGAGACUCUGUCUCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAUAGAUGUUUCAAAUAUGAACAUUCUUUUGGCACCAAUUUUCUUUUUUAAUUUGGUUGUUUCUGAGAUGUAUGAUCAACUGAAGAUGGAGCUGAAAUGGGAGACGGGUGGCCCCACCGUGCCCUUGAAACAGCAGAGCACUCCUCAGUAGAGAGGGAGGGAGCCAAGAGCCUGAACAUGUGGUCGCCAGCUUGGAAUGUUACUGACAUAUGUGGCGAGGGCUUAGCCAGAAAUAUUUAAAGAUGUAGUAUUCCGGCCUGUGAGUUGUCUGGGCAGGGAGGGGGAGUCAGAAAGGGUAGAGAGCUCUCAAAUAACUCAUGACUCUAGUGUUCCUUUCACAUGUGAACAGUGUCACUGAUGACACAUUUUCUAGGACCUUCGUUUGUUUUGUGGACCUGCCUCAGUCUCCUCAGUAUCAGGCGAUCUUAAGGGAAGAUGGAGUGUUUCAAAUUGGAGAGAAGUUCAUGGGUAGGUAUCGUCCUGUGGAAUUCUGAAUGCAAGGAAGUCAACCCCAGAGGCCUUGGUACCCCCAGCUUUCUAAAACUACUUUAUUACAAUUUAUAUGUAUAUACACAUGCACAUAUAAACGUGUGCAUUUAUGUAUGUGUGUAUAGUACCUUUUUUAAAAAAACAUUUCCUCCAAGCUGCUAAGCAAAGGGUCUCACAGGUCGAGCACAGUGCUGAGAGGAUGGUGUCUGCAUAAUGAAGACAUGGAUGAAGCUGAGACCGUGUUCAAACUCACUGAAAACAAUGAAGUUCUAUUCCUUUUUUCUUCCUCUCCAAUGAUCU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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1749.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1854.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 1329.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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