Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001375286.1
Sequence Length
3041 nt
GC Content
0.3673
GGCGACGACCAGAAGGGGCCCAAGAGAGGGGGCGAGCGACCGAGCGCCGCGACGCGGAAGUGAGUGUGGUGUAAAGGAAUUCAUUAGCCAUGGAUGUAUUCAUGAAAGGACUUUCAAAGGCCAAGGAGGGAGUUGUGGCUGCUGCUGAGAAAACCAAACAGGGUGUGGCAGAAGCAGCAGGAAAGACAAAAGAGGGUGUUCUCUAUGUAGGCUCCAAAACCAAGGAGGGAGUGGUGCAUGGUGUGGCAACAGUGGCUGAGAAGACCAAAGAGCAAGUGACAAAUGUUGGAGGAGCAGUGGUGACGGGUGUGACAGCAGUAGCCCAGAAGACAGUGGAGGGAGCAGGGAGCAUUGCAGCAGCCACUGGCUUUGUCAAAAAGGACCAGUUGGGCAAGAAUGAAGAAGGAGCCCCACAGGAAGGAAUUCUGGAAGAUAUGCCUGUGGAUCCUGACAAUGAGGCUUAUGAAAUGCCUUCUGAGGAAGGGUAUCAAGACUACGAACCUGAAGCCUAAGAAAUAUCUUUGCUCCCAGUUUCUUGAGAUCUGCUGACAGAUGUUCCAUCCUGUACAAGUGCUCAGUUCCAAUGUGCCCAGUCAUGACAUUUCUCAAAGUUUUUACAGUGUAUCUCGAAGUCUUCCAUCAGCAGUGAUUGAAGUAUCUGUACCUGCCCCCACUCAGCAUUUCGGUGCUUCCCUUUCACUGAAGUGAAUACAUGGUAGCAGGGUCUUUGUGUGCUGUGGAUUUUGUGGCUUCAAUCUACGAUGUUAAAACAAAUUAAAAACACCUAAGUGACUACCACUUAUUUCUAAAUCCUCACUAUUUUUUUGUUGCUGUUGUUCAGAAGUUGUUAGUGAUUUGCUAUCAUAUAUUAUAAGAUUUUUAGGUGUCUUUUAAUGAUACUGUCUAAGAAUAAUGACGUAUUGUGAAAUUUGUUAAUAUAUAUAAUACUUAAAAAUAUGUGAGCAUGAAACUAUGCACCUAUAAAUACUAAAUAUGAAAUUUUACCAUUUUGCGAUGUGUUUUAUUCACUUGUGUUUGUAUAUAAAUGGUGAGAAUUAAAAUAAAACGUUAUCUCAUUGCAAAAAUAUUUUAUUUUUAUCCCAUCUCACUUUAAUAAUAAAAAUCAUGCUUAUAAGCAACAUGAAUUAAGAACUGACACAAAGGACAAAAAUAUAAAGUUAUUAAUAGCCAUUUGAAGAAGGAGGAAUUUUAGAAGAGGUAGAGAAAAUGGAACAUUAACCCUACACUCGGAAUUCCCUGAAGCAACACUGCCAGAAGUGUGUUUUGGUAUGCACUGGUUCCUUAAGUGGCUGUGAUUAAUUAUUGAAAGUGGGGUGUUGAAGACCCCAACUACUAUUGUAGAGUGGUCUAUUUCUCCCUUCAAUCCUGUCAAUGUUUGCUUUACGUAUUUUGGGGAACUGUUGUUUGAUGUGUAUGUGUUUAUAAUUGUUAUACAUUUUUAAUUGAGCCUUUUAUUAACAUAUAUUGUUAUUUUUGUCUCGAAAUAAUUUUUUAGUUAAAAUCUAUUUUGUCUGAUAUUGGUGUGAAUGCUGUACCUUUCUGACAAUAAAUAAUAUUCGACCAUGAAUAAAAAAAAAAAAAAAGUGGGUUCCCGGGAACUAAGCAGUGUAGAAGAUGAUUUUGACUACACCCUCCUUAGAGAGCCAUAAGACACAUUAGCACAUAUUAGCACAUUCAAGGCUCUGAGAGAAUGUGGUUAACUUUGUUUAACUCAGCAUUCCUCACUUUUUUUUUUUAAUCAUCAGAAAUUCUCUCUCUCUCUCUCUCUUUUUCUCUCGCUCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUACAGGAAAUGCCUUUAAACAUCGUUGGAACUACCAGAGUCACCUUAAAGGAGAUCAAUUCUCUAGACUGAUAAAAAUUUCAUGGCCUCCUUUAAAUGUUGCCAAAUAUAUGAAUUCUAGGAUUUUUCCUUAGGAAAGGUUUUUCUCUUUCAGGGAAGAUCUAUUAACUCCCCAUGGGUGCUGAAAAUAAACUUGAUGGUGAAAAACUCUGUAUAAAUUAAUUUAAAAAUUAUUUGGUUUCUCUUUUUAAUUAUUCUGGGGCAUAGUCAUUUCUAAAAGUCACUAGUAGAAAGUAUAAUUUCAAGACAGAAUAUUCUAGACAUGCUAGCAGUUUAUAUGUAUUCAUGAGUAAUGUGAUAUAUAUUGGGCGCUGGUGAGGAAGGAAGGAGGAAUGAGUGACUAUAAGGAUGGUUACCAUAGAAACUUCCUUUUUUACCUAAUUGAAGAGAGACUACUACAGAGUGCUAAGCUGCAUGUGUCAUCUUACACUAGAGAGAAAUGGUAAGUUUCUUGUUUUAUUUAAGUUAUGUUUAAGCAAGGAAAGGAUUUGUUAUUGAACAGUAUAUUUCAGGAAGGUUAGAAAGUGGCGGUUAGGAUAUAUUUUAAAUCUACCUAAAGCAGCAUAUUUUAAAAAUUUAAAAGUAUUGGUAUUAAAUUAAGAAAUAGAGGACAGAACUAGACUGAUAGCAGUGACCUAGAACAAUUUGAGAUUAGGAAAGUUGUGACCAUGAAUUUAAGGAUUUAUGUGGAUACAAAUUCUCCUUUAAAGUGUUUCUUCCCUUAAUAUUUAUCUGACGGUAAUUUUUGAGCAGUGAAUUACUUUAUAUAUCUUAAUAGUUUAUUUGGGACCAAACACUUAAACAAAAAGUUCUUUAAGUCAUAUAAGCCUUUUCAGGAAGCUUGUCUCAUAUUCACUCCCGAGACAUUCACCUGCCAAGUGGCCUGAGGAUCAAUCCAGUCCUAGGUUUAUUUUGCAGACUUACAUUCUCCCAAGUUAUUCAGCCUCAUAUGACUCCACGGUCGGCUUUACCAAAACAGUUCAGAGUGCACUUUGGCACACAAUUGGGAACAGAACAAUCUAAUGUGUGGUUUGGUAUUCCAAGUGGGGUCUUUUUCAGAAUCUCUGCACUAGUGUGAGAUGCAAACAUGUUUCCUCAUCUUUCUGGCUUAUCCAGUAUGUAGCUAUUUGUGACAUAAUAAAUAUAUACAUAUAUGAAAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-778.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -840.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 695.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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