Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001375287.1
Sequence Length
3465 nt
GC Content
0.3962
GGCGACGACCAGAAGGGGCCCAAGAGAGGGGGCGAGCGACCGAGCGCCGCGACGCGGAAGUGAGGUGCGUGCGGGCUGCAGCGCAGACCCCGGCCCGGCCCCUCCGAGAGCGUCCUGGGCGCUCCCUCACGCCUUGCCUUCAAGCCUUCUGCCUUUCCACCCUCGUGAGCGGAGAACUGGGAGUGGCCAUUCGACGACAGGUUAGCGGGUUUGCCUCCCACUCCCCCAGCCUCGCGUCGCCGGCUCACAGCGGCCUCCUCUGGGGACAGUCCCCCCCGGGUGCCGCCUCCGCCCUUCCUGUGCGCUCCUUUUCCUUCUUCUUUCCUAUUAAAUAUUAUUUGGGAAUUGUUUAAAUUUUUUUUUUAAAAAAAGAGAGAGGCGGGGAGGAGUCGGAGUUGUGGAGAAGCAGAGGGACUCAGGGCUGAGAGAUUAGGCUGCUUCUCCGGGAUCCGCUUUUCCCCGGGAAACGCGAGGAUGCUCCAUGGAGCUGUGGUGUAAAGGAAUUCAUUAGCCAUGGAUGUAUUCAUGAAAGGACUUUCAAAGGCCAAGGAGGGAGUUGUGGCUGCUGCUGAGAAAACCAAACAGGGUGUGGCAGAAGCAGCAGGAAAGACAAAAGAGGGUGUUCUCUAUGUAGGCUCCAAAACCAAGGAGGGAGUGGUGCAUGGUGUGGCAACAGUGGCUGAGAAGACCAAAGAGCAAGUGACAAAUGUUGGAGGAGCAGUGGUGACGGGUGUGACAGCAGUAGCCCAGAAGACAGUGGAGGGAGCAGGGAGCAUUGCAGCAGCCACUGGCUUUGUCAAAAAGGACCAGUUGGGCAAGAAUGAAGAAGGAGCCCCACAGGAAGGAAUUCUGGAAGAUAUGCCUGUGGAUCCUGACAAUGAGGCUUAUGAAAUGCCUUCUGAGGAAGGGUAUCAAGACUACGAACCUGAAGCCUAAGAAAUAUCUUUGCUCCCAGUUUCUUGAGAUCUGCUGACAGAUGUUCCAUCCUGUACAAGUGCUCAGUUCCAAUGUGCCCAGUCAUGACAUUUCUCAAAGUUUUUACAGUGUAUCUCGAAGUCUUCCAUCAGCAGUGAUUGAAGUAUCUGUACCUGCCCCCACUCAGCAUUUCGGUGCUUCCCUUUCACUGAAGUGAAUACAUGGUAGCAGGGUCUUUGUGUGCUGUGGAUUUUGUGGCUUCAAUCUACGAUGUUAAAACAAAUUAAAAACACCUAAGUGACUACCACUUAUUUCUAAAUCCUCACUAUUUUUUUGUUGCUGUUGUUCAGAAGUUGUUAGUGAUUUGCUAUCAUAUAUUAUAAGAUUUUUAGGUGUCUUUUAAUGAUACUGUCUAAGAAUAAUGACGUAUUGUGAAAUUUGUUAAUAUAUAUAAUACUUAAAAAUAUGUGAGCAUGAAACUAUGCACCUAUAAAUACUAAAUAUGAAAUUUUACCAUUUUGCGAUGUGUUUUAUUCACUUGUGUUUGUAUAUAAAUGGUGAGAAUUAAAAUAAAACGUUAUCUCAUUGCAAAAAUAUUUUAUUUUUAUCCCAUCUCACUUUAAUAAUAAAAAUCAUGCUUAUAAGCAACAUGAAUUAAGAACUGACACAAAGGACAAAAAUAUAAAGUUAUUAAUAGCCAUUUGAAGAAGGAGGAAUUUUAGAAGAGGUAGAGAAAAUGGAACAUUAACCCUACACUCGGAAUUCCCUGAAGCAACACUGCCAGAAGUGUGUUUUGGUAUGCACUGGUUCCUUAAGUGGCUGUGAUUAAUUAUUGAAAGUGGGGUGUUGAAGACCCCAACUACUAUUGUAGAGUGGUCUAUUUCUCCCUUCAAUCCUGUCAAUGUUUGCUUUACGUAUUUUGGGGAACUGUUGUUUGAUGUGUAUGUGUUUAUAAUUGUUAUACAUUUUUAAUUGAGCCUUUUAUUAACAUAUAUUGUUAUUUUUGUCUCGAAAUAAUUUUUUAGUUAAAAUCUAUUUUGUCUGAUAUUGGUGUGAAUGCUGUACCUUUCUGACAAUAAAUAAUAUUCGACCAUGAAUAAAAAAAAAAAAAAAGUGGGUUCCCGGGAACUAAGCAGUGUAGAAGAUGAUUUUGACUACACCCUCCUUAGAGAGCCAUAAGACACAUUAGCACAUAUUAGCACAUUCAAGGCUCUGAGAGAAUGUGGUUAACUUUGUUUAACUCAGCAUUCCUCACUUUUUUUUUUUAAUCAUCAGAAAUUCUCUCUCUCUCUCUCUCUUUUUCUCUCGCUCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUACAGGAAAUGCCUUUAAACAUCGUUGGAACUACCAGAGUCACCUUAAAGGAGAUCAAUUCUCUAGACUGAUAAAAAUUUCAUGGCCUCCUUUAAAUGUUGCCAAAUAUAUGAAUUCUAGGAUUUUUCCUUAGGAAAGGUUUUUCUCUUUCAGGGAAGAUCUAUUAACUCCCCAUGGGUGCUGAAAAUAAACUUGAUGGUGAAAAACUCUGUAUAAAUUAAUUUAAAAAUUAUUUGGUUUCUCUUUUUAAUUAUUCUGGGGCAUAGUCAUUUCUAAAAGUCACUAGUAGAAAGUAUAAUUUCAAGACAGAAUAUUCUAGACAUGCUAGCAGUUUAUAUGUAUUCAUGAGUAAUGUGAUAUAUAUUGGGCGCUGGUGAGGAAGGAAGGAGGAAUGAGUGACUAUAAGGAUGGUUACCAUAGAAACUUCCUUUUUUACCUAAUUGAAGAGAGACUACUACAGAGUGCUAAGCUGCAUGUGUCAUCUUACACUAGAGAGAAAUGGUAAGUUUCUUGUUUUAUUUAAGUUAUGUUUAAGCAAGGAAAGGAUUUGUUAUUGAACAGUAUAUUUCAGGAAGGUUAGAAAGUGGCGGUUAGGAUAUAUUUUAAAUCUACCUAAAGCAGCAUAUUUUAAAAAUUUAAAAGUAUUGGUAUUAAAUUAAGAAAUAGAGGACAGAACUAGACUGAUAGCAGUGACCUAGAACAAUUUGAGAUUAGGAAAGUUGUGACCAUGAAUUUAAGGAUUUAUGUGGAUACAAAUUCUCCUUUAAAGUGUUUCUUCCCUUAAUAUUUAUCUGACGGUAAUUUUUGAGCAGUGAAUUACUUUAUAUAUCUUAAUAGUUUAUUUGGGACCAAACACUUAAACAAAAAGUUCUUUAAGUCAUAUAAGCCUUUUCAGGAAGCUUGUCUCAUAUUCACUCCCGAGACAUUCACCUGCCAAGUGGCCUGAGGAUCAAUCCAGUCCUAGGUUUAUUUUGCAGACUUACAUUCUCCCAAGUUAUUCAGCCUCAUAUGACUCCACGGUCGGCUUUACCAAAACAGUUCAGAGUGCACUUUGGCACACAAUUGGGAACAGAACAAUCUAAUGUGUGGUUUGGUAUUCCAAGUGGGGUCUUUUUCAGAAUCUCUGCACUAGUGUGAGAUGCAAACAUGUUUCCUCAUCUUUCUGGCUUAUCCAGUAUGUAGCUAUUUGUGACAUAAUAAAUAUAUACAUAUAUGAAAAUA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-966.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1035.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 805.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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