Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001375604.1
Sequence Length
1765 nt
GC Content
0.5966
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-733.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -765.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 364.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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