Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001375607.1

Sequence Length

1888 nt

GC Content

0.6096

AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAUCUCCACGACCCGCCCCUGCAGAGCAGCAGCGGGGGUAGGCACUGCCCGGAGCUCAGAAGUCCUCCUCAGACAGGUGCCAGUGCCUCCAGAAUGUGGCAGCUCACAAGCCUCCUGCUGUUCGUGGCCACCUGGGGAAUUUCCGGCACACCAGCUCCUCUUGGUGCUGCGGAUCCGCAAACGUGCCAACUCCUUCCUGGAGGAGCUCCGUCACAGCAGCCUGGAGCGGGAGUGCAUAGAGGAGAUCUGUGACUUCGAGGAGGCCAAGGAAAUUUUCCAAAAUGUGGAUGACACACUGGCCUUCUGGUCCAAGCACGUCGACGGUGACCAGUGCUUGGUCUUGCCCUUGGAGCACCCGUGCGCCAGCCUGUGCUGCGGGCACGGCACGUGCAUCGACGGCAUCGGCAGCUUCAGCUGCGACUGCCGCAGCGGCUGGGAGGGCCGCUUCUGCCAGCGCGGUGAGGGGGAGAGGUGGAUGCUGGCGGGCGGCGGGGCGGGGCUGGGGCCGGGUUGGGGGCGCGGCACCAGCACCAGCUGCCCGCGCCCUCCCCUGCCCGCAGAGGUGAGCUUCCUCAAUUGCUCGCUGGACAACGGCGGCUGCACGCAUUACUGCCUAGAGGAGGUGGGCUGGCGGCGCUGUAGCUGUGCGCCUGGCUACAAGCUGGGGGACGACCUCCUGCAGUGUCACCCCGCAGUGAAGUUCCCUUGUGGGAGGCCCUGGAAGCGGAUGGAGAAGAAGCGCAGUCACCUGAAACGAGACACAGAAGACCAAGAAGACCAAGUAGAUCCGCGGCUCAUUGAUGGGAAGAUGACCAGGCGGGGAGACAGCCCCUGGCAGGUGGUCCUGCUGGACUCAAAGAAGAAGCUGGCCUGCGGGGCAGUGCUCAUCCACCCCUCCUGGGUGCUGACAGCGGCCCACUGCAUGGAUGAGUCCAAGAAGCUCCUUGUCAGGCUUGGAGAGUAUGACCUGCGGCGCUGGGAGAAGUGGGAGCUGGACCUGGACAUCAAGGAGGUCUUCGUCCACCCCAACUACAGCAAGAGCACCACCGACAAUGACAUCGCACUGCUGCACCUGGCCCAGCCCGCCACCCUCUCGCAGACCAUAGUGCCCAUCUGCCUCCCGGACAGCGGCCUUGCAGAGCGCGAGCUCAAUCAGGCCGGCCAGGAGACCCUCGUGACGGGCUGGGGCUACCACAGCAGCCGAGAGAAGGAGGCCAAGAGAAACCGCACCUUCGUCCUCAACUUCAUCAAGAUUCCCGUGGUCCCGCACAAUGAGUGCAGCGAGGUCAUGAGCAACAUGGUGUCUGAGAACAUGCUGUGUGCGGGCAUCCUCGGGGACCGGCAGGAUGCCUGCGAGGGCGACAGUGGGGGGCCCAUGGUCGCCUCCUUCCACGGCACCUGGUUCCUGGUGGGCCUGGUGAGCUGGGGUGAGGGCUGUGGGCUCCUUCACAACUACGGCGUUUACACCAAAGUCAGCCGCUACCUCGACUGGAUCCAUGGGCACAUCAGAGACAAGGAAGCCCCCCAGAAGAGCUGGGCACCUUAGCGACCCUCCCUGCAGGGCUGGGCUUUUGCAUGGCAAUGGAUGGGACAUUAAAGGGACAUGUAACAAGCACACCGGCCUGCUGUUCUGUCCUUCCAUCCCUCUUUUGGGCUCUUCUGGAGGGAAGUAACAUUUACUGAGCACCUGUUGUAUGUCACAUGCCUUAUGAAUAGAAUCUUAACUCCUAGAGCAACUCUGUGGGGUGGGGAGGAGCAGAUCCAAGUUUUGCGGGGUCUAAAGCUGUGUGUGUUGAGGGGGAUACUCUGUUUAUGAAAAAGAAUAAAAAACACAACCACGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-824.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -854.90

Frequency: 0.0000

Diversity: 396.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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