Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001375991.1
Sequence Length
1437 nt
GC Content
0.5372
ACAGCGAGCGGAGCCGCGGUCCGGACGGCAGCGCGUGCCCCGAGCUCUCCGCCUCCCCCCGCCCGCCAGCCGAGGCAGCUCGAGCCCAGUCCGCGGCCCCAGCAGCAGCGCCGAGAGCAGCCCCAGUAGCAGCGCCAUGGCCGGGUGGAACGCCUACAUCGACAACCUCAUGGCGGACGGGACCUGUCAGGACGCGGCCAUCGUGGGCUACAAGGACUCGCCCUCCGUCUGGGCCGCCGUCCCCGGGAAAACGUUCGUCAACAUCACGCCAGCUGAGGUGGGUGUCCUGGUUGGCAAAGACCGGUCAAGUUUUUACGUGAAUGGGCUGACACUUGGGGGCCAGAAAUGUUCGGUGAUCCGGGACUCACUGCUGCAGGAUGGGGAAUUUAGCAUGGAUCUUCGUACCAAGAGCACCGGUGGGGCCCCCACCUUCAAUGUCACUGUCACCAAGACUGACAAGAGUGAGUUCCUGAGUCUUACCCUUCCUUUAGCUCCAAGAUCUCUAAUGUACCGCCUUCUGGUAAUCUUGAGGGUGCUUUUUUGUGUGAUUCCCCAACAUGAAGGGAGUCAGACCAGUAUUGUGUUCCUUGUCUGCUGGAUGCUGGAACACGGGAUAGUCCCUCCAUUCUGUCUCAGUUCCUCAUCUUGUAAUUCGAAGUUGCUGAACUGCAUUACCUCUUAAAUUACUUACUGCCUUGAGCUCGGAUUAGAAACUGUUUUCUAGGAGUAUAGGUAGAUUGUUGGGGUCUUGAAUCAUCGAGUUCAUCGUUUGAGUUCUUUUGUUAGAACCUGGAGGUGGCAUGCACAUCCACAGCCCUUUCUAGCCUGAACACAUGAAUCAACAGUCUAUGAGCCUUUGACCCCUAAGUUUUUAGUCUGUUCCUCUCCAGCGUUUAAGCUUGAUUUUCCUCUUUUGAAAAGCCUUAUUGUUUCAGGGUGACUGACAGCCUGCCUGUGUGUGGUGGGGGGGCGGGUUGGGAGAGAUGAGGUUGGGUUACAGCCCCCAGGGCUGGACAGCUGCUGAACAGCUGGCAGGGGGUGGAAUUGUGACACCUGGAUCCUAGCCUCCUUUCUCUUUCCUCCUCCUCCAGCGCUAGUCCUGCUGAUGGGCAAAGAAGGUGUCCACGGUGGUUUGAUCAACAAGAAAUGUUAUGAAAUGGCCUCCCACCUUCGGCGUUCCCAGUACUGACCUCGUCUGUCCCUUCCCCUUCACCGCUCCCCACAGCUUUGCACCCCUUUCCUCCCCAUACACACACAAACCAUUUUAUUUUUUGGGCCAUUACCCCAUACCCCUUAUUGCUGCCAAAACCACAUGGGCUGGGGGCCAGGGCUGGAUGGACAGACACCUCCCCCUACCCAUAUCCCUCCCGUGUGUGGUUGGAAAACUUUUGUUUUUUGGGGUUUUUUUUUUCUGAAUAAAAAAGAUUCUACUAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-523.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -543.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 228.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.(((((((.(.((..((((.....)))).((((((....(((((.....((......)).)))))))))))...)).).))))))).)).)).((((.((.(..((..((((((((((..((((((..((((((....((((((.........(((((((((((((((...((((...((((((((((..((.((((...........))))..))....))))).))))).))))....))))))))).............))))))))))))))))))))))(((((..((((((((((..(((((((((((((((.(((((((((.((((...((((..(((((((((.((((..(((((((((((((((((((((.(((((..........(((((((((((((((...)))))).....(((((..(((.....))))))))((.(((((.........))))).))........(((.(((((........(((((.....))))))))))))))))))))))..((.((((((((.........)))))))).)).......(((((((.(((((...)))))..)))))))((((...))))))))).)))....))))))))))))))))....((.(((((......)))..)).))..............))..)))))))))))))....((((.(((...))).))))((((((((((((..((.((..(((.(((.....)))..)))((((....(((((((...((..((((.((....))))))..))..)))))))..)))).)).)).)))))))))))))))).)))).)))))))))..))))))))))).......))))..))))))))))....)))))......)).)))))).....))))..))..).)))))).(((((((((((((((((.(((..((((.((((((((((((....((((((...))))))..((((.((((....(((((.((((((.((((..(.((.....(((........)))..)).).)))).)))))))))))..))))...)))).((((....(((((((.....(((.((((.((.((((.....)))))).)))).)))...)))))))......))))...)))))))))))).))))..))).......(((......))).............))))))))).))))))))...............((((.......)))).........))))))((((...((((((((..(((((...(((..((..(((........))).))..)))...)))))))))))))...)))).......(((((...(((((((((((((........)))))))))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((.(((((((.(.((..((((.....)))).((((((....(((((.....{,......),.))))))))))).,.)).).))))))).)).)).((((.((.(..((..((((,,{,(({,{{((((..((((((....(((((({,.......,{{{{{(((((((((...((((...((((((((((..((.((((...........))))..))....)))))},)))).))))....)))))))))......,,,,...}))))))))))))))))))))){{(((..((((((((((..(((((((((((((((.(((((((((.((((.....((((((((.((((((((.,.{{(((((((((((((((({((,(((((..........(((((((((((((((...)))))).....{((((..(((.....)))))))}{(.(((((.........))))).}}........{{,{(((((..,.....(((({.....})))))))))))))))))))))..((.((((((((.........)))))))).)).......(((((((.{((((...))))}..)))))))((((...))))))))).})).,,.))))))))))))))))....{{.({(((......)))..}}.}}............((((((.,.((((...(((((({....}))))))))))..))))))...}}.})))))))).))))))))((((((.{.{((.((((...((((((...(((((((.(((.((........))))).))))))).}}})))).,.)))),,,))}.}.)))))).)))).)))))))))..))))))))))).......))))..)))))))))}....})}}}.,,...}}..,,}))}}.,.))))..))..).)))))).(((((((((((((((((.(((..((((.((((((((((((,...((((((...)))))),,((((.(,,{....(((((.((((((.((((..{.((.....(({........}}}..)).,.)))).))))))))))),,},)),,.}}}}.{{{(,...(((((((.....(((.((((.((.((((.....)))))).)))).)))...)))))))...,}.)))),,.)))))))))))).))))..))).......(((......)))...,.........))))))))).))))))))...............{(((.......))}}.........))))))((({..{((((((((..(((((...(((.,((..(({......,,))),)),.)))...}))).)))))))),},)))).......,{{||,..(((((((((((((........)))))))))))))..}))}.
Back