Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001376277.1
Sequence Length
3602 nt
GC Content
0.5117
GUACAAUAGCGCGGCUGUGGGCGGGGGAGGCUGCCCUCCCGCGGCUGCAGCCGGAGCCGAAGGUGGUGGCUGCACAGUAGACGCCCCCUCACGGCUUCCCCCACACGCUCCCGCCCCCUCGCUCGCCCAUCGCGCUUCCCUCACAGGCUCUGCAGUCCUCCCCCACAGACGCCUUCCCCCUUGGACUCUCAUUCCCUUUUCCACGGAGCCCCGCGCUUUCGUGAGCCCCCUCGAGGAACCUGGUCUCCGCAUCCAGUUACCACCUCCUGCCUCAGAGGCCAUCUGAGCCCUUCGCACCUCGCCCCUCAGUCCCCCCUUCCCCCCCCGCCCGCGUCGCCUCGCUCCCUCCCGCCCCCCCAUCAUCCCUUCCCUCGCAGUUCCCCUGUCCUGAGGGGAGCCCCGCCACGGGCAGCGCGGCGGCGGCGGCAGGAGGGAGAAAGUGAAGCGGUAGCUCGCGCACACUCGCGCCCUCACUCCCGGCUAGGCGGCACCCACCGCCGGGAGGAGGAGGAGGAGCCGAGAGGAGCUGAGCGAGCGCGGAAGGUGAGAGCGGGCCUACCGCCCAGUACCCCUCGCGUCCCGGGCUGCCAGGGCUGGGGCGCGGGGGUGGGGACGGGUGGAGUGGGGGUCUGGGCCCAUUUAUUUCGCGUUGCGGGGCCGGGCGCCUGGGCGGGAGGAGGCGCCAGUAGCUGCUGCUGGUGGUGACAAUGUCAAAUAACGGCCUAGACAUUCAAGACAAACCCCCAGCCCCUCCGAUGAGAAAUACCAGCACUAUGAUUGGAGCCGGCAGCAAAGAUGCUGGAACCCUAAACCAUGGUUCUAAACCUCUGCCUCCAAACCCAGAGGAGAAGAAAAAGAAGGACCGAUUUUACCGAUCCAUUUUACCUGGAGAUAAAACAAAUAAAAAGAAAGAGAAAGAGCGGCCAGAGAUUUCUCUCCCUUCAGAUUUUGAACACACAAUUCAUGUCGGUUUUGAUGCUGUCACAGGGGAGUUUACGGGAAUGCCAGAGCAGUGGGCCCGCUUGCUUCAGACAUCAAAUAUCACUAAGUCGGAGCAGAAGAAAAACCCGCAGGCUGUUCUGGAUGUGUUGGAGUUUUACAACUCGAAGAAGACAUCCAACAGCCAGAAAUACAUGAGCUUUACAGAUAAGUCAGCUGAGGAUUACAAUUCUUCUAAUGCCUUGAAUGUGAAGGCUGUGUCUGAGACUCCUGCAGUGCCACCAGUUUCAGAAGAUGAGGAUGAUGAUGAUGAUGAUGCUACCCCACCACCAGUGAUUGCUCCACGCCCAGAGCACACAAAAUCUGUAUACACACGGUCUGUGAUUGAACCACUUCCUGUCACUCCAACUCGGGACGUGGCUACAUCUCCCAUUUCACCUACUGAAAAUAACACCACUCCACCAGAUGCUUUGACCCGGAAUACUGAGAAGCAGAAGAAGAAGCCUAAAAUGUCUGAUGAGGAGAUCUUGGAGAAAUUACGAAGCAUAGUGAGUGUGGGCGAUCCUAAGAAGAAAUAUACACGGUUUGAGAAGAUUGGACAAGGUGCUUCAGGCACCGUGUACACAGCAAUGGAUGUGGCCACAGGACAGGAGGUGGCCAUUAAGCAGAUGAAUCUUCAGCAGCAGCCCAAGAAAGAGCUGAUUAUUAAUGAGAUCCUGGUCAUGAGGGAAAACAAGAACCCAAACAUUGUGAAUUACUUGGACAGUUACCUCGUGGGAGAUGAGCUGUGGGUUGUUAUGGAAUACUUGGCUGGAGGCUCCUUGACAGAUGUGGUGACAGAAACUUGCAUGGAUGAAGGCCAAAUUGCAGCUGUGUGCCGUGAGUGUCUGCAGGCUCUGGAGUUCUUGCAUUCGAACCAGGUCAUUCACAGAGACAUCAAGAGUGACAAUAUUCUGUUGGGAAUGGAUGGCUCUGUCAAGCUAACUGACUUUGGAUUCUGUGCACAGAUAACCCCAGAGCAGAGCAAACGGAGCACCAUGGUAGGAACCCCAUACUGGAUGGCACCAGAGGUUGUGACACGAAAGGCCUAUGGGCCCAAGGUUGACAUCUGGUCCCUGGGCAUCAUGGCCAUCGAAAUGAUUGAAGGGGAGCCUCCAUACCUCAAUGAAAACCCUCUGAGAGCCUUGUACCUCAUUGCCACCAAUGGGACCCCAGAACUUCAGAACCCAGAGAAGCUGUCAGCUAUCUUCCGGGACUUUCUGAACCGCUGUCUCGAGAUGGAUGUGGAGAAGAGAGGUUCAGCUAAAGAGCUGCUACAGCAUCAAUUCCUGAAGAUUGCCAAGCCCCUCUCCAGCCUCACUCCACUGAUUGCUGCAGCUAAGGAGGCAACAAAGAACAAUCACUAAAACCACACUCACCCCAGCCUCAUUGUGCCAAGCCUUCUGUGAGAUAAAUGCACAUUUCAGAAAUUCCAACUCCUGAUGCCCUCUUCUCCUUGCCUUGCUUCUCCCAUUUCCUGAUCUAGCACUCCUCAAGACUUUGAUCCUUGGAAACCGUGUGUCCAGCAUUGAAGAGAACUGCAACUGAAUGACUAAUCAGAUGAUGGCCAUUUCUAAAUAAGGAAUUUCCUCCCAAUUCAUGGAUAUGAGGGUGGUUUAUGAUUAAGGGUUUAUAUAAAUAAAUGUUUCUAGUCUUCCGUGUGUCAAAAUCCUCACCUCCUUCAUAACCAUCUCCCACAAUUAAUUCUUGACUAUAUAAAUUUAUGGUUUGAUAAUAUUAUCAAUUUGUAAUCAAUUGAGAUUUCUUUAGUGCUUGCUUUUCUGUGACUCAACUGCCCAGACACCUCAUUGUACUUGAAAACUGGAACAGCUUGGGAAUGCCAUGGGGUUUGAUAAUCUGCCAGGGACAUGAAGAGGCUCAGCUUCCUGGACCAUGACUUUGGCUCAGCUGAUCCUGACAUGGGAGAACAACCACAUUUUUCUUUGUGUGUGCUUCUAGCAGCUGUUCGGGAGGACCUUGACCCAAUAGUGUUCCCAUGCUGUUUCUUGUGAAAUGCUCUCGGCUAUGUAGCAGCUUUUGAUUCCCUGCAUACCCUAGGCUGCUGCCCCUAUCCUGUCCCUUGUUUAUAACAUUGAGAGGUUUUCUAGGGCACAUACUGAGUGAGAGCAGUGUUGAGAAGUCGGGGAAAAUGGUGACUACUUUUAGAGCAAGGCUGGGCAUCAGCACCUGUCCAGCUCUACUUGUGUGAUGUUUCAGGAACUCAGCCCCUUUUUCUGCCUAGGAUAAGGAGCUGAAAGAUUAACUUGGAUCUUCUAAUGGUCCAAAUCUUUUGGUCACAAUAAAGAGUCUCCAAAUUAGAGACUGCAUGUUAGUUCUGGAUGGAUUUGGUGGCCUGACAUGAUACCCUGCCAGCUGUGAGGGGACCCCGUUUUUAAGAUGCAUGGCCAAGCUCUCUGCAAAUGGAAAUGCUUACACUGGGUGUUGGGGAUGUUUGCUACCUCCUGCUAUUUUUGUGGUUUUGGUUCUCCCACUAUGGUAGGACCCCUGGCCAGCAUUGUGGCUUGUCAUGUCAGCCCCAUUGACUACCUUCUCAUGCUCUGAGGUACUACUGCCUCUGCAGCACAAAUUUCUAUUUCUGUCAAUAAAAGGAGAUGAAAAUAUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1224.64 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1291.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 1003.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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