Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001376468.1

Sequence Length

2843 nt

GC Content

0.4070

GGUCUGCAGUCGGAGACUUGCAGGCAGCAAACACGGUGCGAGCGAACAGGAGUGGGGGGGAAAUUAAAAAAAGCUAAACGUGGAGCAGCCGAUCGGGGACCGAGAAGGGGAAUCGAUGCAAGGAGCACAAUAAAACAAAAGCUACUUCGGAACAAACAGCAUUUAAAAAUCCACGACUCAAGAUAACUGAAACCUAAAAUAAAACCUGCUCAUGCACCAUGGUUUUUCAAACUCGGUACCCUUCAUGGAUUAUUUUAUGCUACAUCUGGCUGCUCCGCUUUGCACACACAGGGGAGGCGCAGGCUGCGAAGGAAGUACUACUGCUGGAUUCUAAAGCACAACAAACAGAGUUGGAGUGGAUUUCCUCUCCACCCAAUGGGUGGGAAGAAAUUAGUGGUUUGGAUGAGAACUAUACCCCGAUACGAACAUACCAGGUGUGCCAAGUCAUGGAGCCCAACCAAAACAACUGGCUGCGGACUAACUGGAUUUCCAAAGGCAAUGCACAAAGGAUUUUUGUAGAAUUGAAAUUCACCCUGAGGGAUUGUAACAGUCUUCCUGGAGUACUGGGAACUUGCAAGGAAACAUUUAAUUUGUACUAUUAUGAAACAGACUAUGACACUGGCAGGAAUAUAAGAGAAAACCUCUAUGUAAAAAUAGACACCAUUGCUGCAGAUGAAAGUUUUACCCAAGGUGACCUUGGUGAAAGAAAGAUGAAGCUUAACACUGAGGUGAGAGAGAUUGGACCUUUGUCCAAAAAGGGAUUCUAUCUUGCCUUUCAGGAUGUAGGGGCUUGCAUAGCUUUGGUUUCUGUCAAAGUGUACUACAAGAAGUGCUGGUCCAUUAUUGAGAACUUAGCUAUCUUUCCAGAUACAGUGACUGGUUCAGAAUUUUCCUCUUUAGUCGAGGUUCGAGGGACAUGUGUCAGCAGUGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAGGAUGCACUGCAGUGCAGAAGGAGAAUGGUUAGUGCCCAUUGGAAAAUGUAUCUGCAAAGCAGGCUACCAGCAAAAAGGAGACACUUGUGAACCCUGUGGCCGUGGGUUCUACAAGUCUUCCUCUCAAGAUCUUCAGUGCUCUCGUUGUCCAACUCACAGUUUUUCUGAUAAAGAAGGCUCCUCCAGAUGUGAAUGUGAAGAUGGGUAUUACAGGGCUCCAUCUGACCCACCAUACGUUGCGUGCACAAGGCCUCCAUCUGCACCACAGAACCUCAUUUUCAACAUCAACCAAACCACAGUAAGUUUGGAAUGGAGUCCUCCUGCAGACAAUGGGGGAAGAAACGAUGUGACCUACAGAAUAUUGUGUAAGCGGUGCAGUUGGGAGCAGGGCGAAUGUGUUCCCUGUGGGAGUAACAUUGGAUACAUGCCCCAGCAGACUGGAUUAGAGGAUAACUAUGUCACUGUCAUGGACCUGCUAGCCCACGCUAAUUAUACUUUUGAAGUUGAAGCUGUAAAUGGAGUUUCUGACUUAAGCCGAUCCCAGAGGCUCUUUGCUGCUGUCAGUAUCACCACUGGUCAAGCAGCUCCCUCGCAAGUGAGUGGAGUAAUGAAGGAGAGAGUACUGCAGCGGAGUGUCGAGCUUUCCUGGCAGGAACCAGAGCAUCCCAAUGGAGUCAUCACAGAAUAUGAAAUCAAGUAUUACGAGAAAGAUCAAAGGGAACGGACCUACUCAACAGUAAAAACCAAGUCUACUUCAGCCUCCAUUAAUAAUCUGAAACCAGGAACAGUGUAUGUUUUCCAGAUUCGGGCUUUUACUGCUGCUGGUUAUGGAAAUUACAGUCCCAGACUUGAUGUUGCUACACUAGAGGAAGCUACAGGUAAAAUGUUUGAAGCUACAGCUGUCUCCAGUGAACAGAAUCCUGUUAUUAUCAUUGCUGUGGUUGCUGUAGCUGGGACCAUCAUUUUGGUGUUCAUGGUCUUUGGCUUCAUCAUUGGGAGAAGGCACUGUGGUUAUAGCAAAGCUGACCAAGAAGGCGAUGAAGAGCUUUACUUUCAUUCUUUAGUAACAAAUGAGCAUCUGUCAGUUUUAUAAACUGCAACAAUAAUUGUUUAAGACAAUCAAUUUUGGAUAAACAAUCAACUACAGCAGAAUAAAUCAAGAUUUUUAAAUCCCAUUUUCCUUUAUACAUUUUGCUUCUUUUUGUUAUGUGUUUACUUUUAAAAUAUAGUUUUAAUGUGAUGACAUAAGCACAGUUAGGCUGCAGUGUAAUAUAUAAAGAAAUAUAUUGUUCUCCAAAUAGUAAGAUUUGAUGAAAAGAUUGUUCAGUGGCUUUGUUAAAACAAUAAAGUUUUUUUGAGGAUAUAGUGUAAUUUUUAUUGCAUUAAUAUAACCAAAUAUAUGCCUAUCUAUCUUAUCUUUGUCUUUUACCAAAUAGAUUUGGAAUACAUUAUUGUAAUUGAAUUUUAUUUAAAGUUGACAUAGUAUUAUCUGUUACCUGCAUGCUUCUGGGUGCAUUUUAAGAAGAUUUUAACUUUUAAGAUUAUUCUAUGUUGUUUGCAUUUUGACUACCUUUUGUGAGGCAUAUUGGCUACCUCCUCAGCAGUUAAGAUCUUCCAGAGCCUUAUAAUUGAAAGUUCAUAUAAACCAUUCCUCUUUCAAAUCGCUGUCAUACUUGGUUAACAGAUCCCAGGAAUAUUGUAAAUUUUCUAACUUUACUCUGCAUUUUGUAUAUCUGGCCUCUAUUGCCCUUGAAGGUGAAGAUGAAACUGUCUUUAGAAGAUAUCUCUUUGAUUCUGUGAUAGAAGUCCCUCACAUCUUGUAUUAAUUUUAUGUAUAUAUCAACGGUGGUUGGUCUUUAAAAAAAUAAAUCAAAAGAAUAAGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-768.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -825.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 618.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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