Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001378330.1

Sequence Length

2545 nt

GC Content

0.5768

GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCGCUGCAGGGGACGCGGGGGAAGUGGCGGCGCCGGCAGCGGACAGCUCGGACAGCGCCCAGGGCCGGAGCCCGAGCCCUUGGAGGUUGAUUGACUUAUGUGCAAUUUGGGACGCUGGAGUUUACCUUCCCUCCGCAGCCUGGAACAGAGCCUCCUCUGGUGUUGCAAGGAAGAGGCUGAAUGAGGCAGAGAAGCUGAGUGCUGUCCAGGAGGCCCAGUUAAAGCGGCUCGAGGUGACAAGACCCCGAGUGCUGGGGAGCAGGGAGCAGGGCCAGGUGCCGAGGAUGGCCAGGCAGCCACCGCCGCCCUGGGUCCAUGCAGCCUUCCUCCUCUGCCUCCUCAGUCUUGGCGGAGCCAUCGAAAUUCCUAUGGAUCUGACGCAGCCGCCAACCAUCACCAAGCAGUCAGCGAAGGAUCACAUCGUGGACCCCCGUGAUAACAUCCUGAUUGAGUGUGAAGCAAAAGGGAACCCUGCCCCCAGCUUCCACUGGACACGAAACAGCAGAUUCUUCAACAUCGCCAAGGACCCCCGGGUGUCCAUGAGGAGGAGGUCUGGGACCCUGGUGAUUGACUUCCGCAGUGGCGGGCGGCCGGAGGAAUAUGAGGGGGAAUAUCAGUGCUUCGCCCGCAACAAAUUUGGCACGGCCCUGUCCAAUAGGAUCCGCCUGCAGGUGUCUAAAUCUCCUCUGUGGCCCAAGGAAAACCUAGACCCUGUCGUGGUCCAAGAGGGCGCUCCUUUGACGCUCCAGUGCAACCCCCCGCCUGGACUUCCAUCCCCGGUCAUCUUCUGGAUGAGCAGCUCCAUGGAGCCCAUCACCCAAGACAAACGUGUCUCUCAGGGCCAUAACGGAGACCUAUACUUCUCCAACGUGAUGCUGCAGGACAUGCAGACCGACUACAGUUGUAACGCCCGCUUCCACUUCACCCACACCAUCCAGCAGAAGAACCCUUUCACCCUCAAGGUCCUCACCAACCACCCUUAUAAUGACUCGUCCUUAAGAAACCACCCUGACAUGUACAGUGCCCGAGGAGUUGCAGAAAGAACACCAAGCUUCAUGUAUCCCCAGGGCACCGCGAGCAGCCAGAUGGUGCUUCGUGGCAUGGACCUCCUGCUGGAAUGCAUCGCCUCCGGGGUCCCAACACCAGACAUCGCAUGGUACAAGAAAGGUGGGGACCUCCCAUCUGAUAAGGCCAAGUUUGAGAACUUUAAUAAGGCCCUGCGUAUCACAAAUGUCUCUGAGGAAGACUCCGGGGAGUAUUUCUGCCUGGCCUCCAACAAGAUGGGCAGCAUCCGGCACACGAUCUCGGUGAGAGUAAAGGCUGCUCCCUACUGGCUGGACGAACCCAAGAACCUUAUUCUGGCUCCUGGCGAGGAUGGGAGACUGGUGUGUCGAGCCAAUGGAAACCCCAAACCCACUGUCCAGUGGAUGGUGAAUGGGGAACCUUUGCAAUCGGCACCACCUAACCCAAACCGUGAGGUGGCCGGAGACACCAUCAUCUUCCGGGACACCCAGAUCAGCAGCAGGGCUGUGUACCAGUGCAACACCUCCAACGAGCAUGGCUACCUGCUGGCCAACGCCUUUGUCAGUGUGCUGGAUGUGCCGCCUCGGAUGCUGUCGCCCCGGAACCAGCUCAUUCGAGUGAUUCUUUACAACCGGACGCGGCUGGACUGCCCUUUCUUUGGGUCUCCCAUCCCCACACUGCGAUGGUUUAAGAAUGGGCAAGGAAGCAACCUGGAUGGUGGCAACUACCAUGUUUAUGAGAACGGCAGUCUGGAAAUUAAGAUGAUCCGCAAAGAGGACCAGGGCAUCUACACCUGUGUCGCCACCAACAUCCUGGGCAAAGCUGAAAACCAAGUCCGCCUGGAGGUCAAAGACCCCACCAGGAUCUACCGGAUGCCCGAGGACCAGGUGGCCAGAAGGGGCACCACGGUGCAGCUGGAGUGUCGGGUGAAGCACGACCCCUCCCUGAAACUCACCGUCUCCUGGCUGAAGGAUGACGAGCCGCUCUAUAUUGGAAACAGGAUGAAGAAGGAAGACGACUCCCUGACCAUCUUUGGGGUGGCAGAGCGGGACCAGGGCAGUUACACGUGUGUCGCCAGCACCGAGCUAGACCAAGACCUGGCCAAGGCCUACCUCACCGUGCUAGGUAACUGCCCAUGCUCACCCUGGCACUGACCAGCCCCACCCCCUCCCCAGCAGCCAGAGAAGCAGUGGCCCGGGGCAGUUCCGAGGGCAGUGCCUGCAGUCAAGUGGCCGGGUCAGGCGUGGUGAUCUCUUCUUGCCUCGUGAUGUCAGGGUUAGGGAGCUGCCAGUUUCAGAACAAGCUGUGCUGGACAGGUUACCUCCUGAGUGGAGUCAUUAACUUCCCCACGUCUCAACUGAAAGGGGCCUGAGUGAUAUAGAGAAAGUGGAGAGGGGUUUCUCGUUGUGAUCAUUUUACCUUUCUUACAGCUAACUCCACCACUAAGUCAAUUAAAACAAUCCAUCCUUAAAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-964.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1007.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 560.94

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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