Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001378805.1

Sequence Length

1312 nt

GC Content

0.4901

AAUAUCUUGCAUGUUACAGAUUUCACUGCUCCCACCAGCUUGGAGACAACAUGUGGUUCUUGACAACUCUGCUCCUUUGGGACACCACAAAGGCAGUGAUCACUUUGCAGCCUCCAUGGGUCAGCGUGUUCCAAGAGGAAACCGUAACCUUGCACUGUGAGGUGCUCCAUCUGCCUGGGAGCAGCUCUACACAGUGGUUUCUCAAUGGCACAGCCACUCAGACCUCGACCCCCAGCUACAGAAUCACCUCUGCCAGUGUCAAUGACAGUGGUGAAUACAGGUGCCAGAGAGGUCUCUCAGGGCGAAGUGACCCCAUACAGCUGGAAAUCCACAGAGGCUGGCUACUACUGCAGGUCUCCAGCAGAGUCUUCACGGAAGGAGAACCUCUGGCCUUGAGGUGUCAUGCGUGGAAGGAUAAGCUGGUGUACAAUGUGCUUUACUAUCGAAAUGGCAAAGCCUUUAAGUUUUUCCACUGGAAUUCUAACCUCACCAUUCUGAAAACCAACAUAAGUCACAAUGGCACCUACCAUUGCUCAGGCAUGGGAAAGCAUCGCUACACAUCAGCAGGAAUAUCUGUCACUGUGAAAGAGCUAUUUCCAGCUCCAGUGCUGAAUGCAUCUGUGACAUCCCCACUCCUGGAGGGGAAUCUGGUCACCCUGAGCUGUGAAACAAAGUUGCUCUUGCAGAGGCCUGGUUUGCAGCUUUACUUCUCCUUCUACAUGGGCAGCAAGACCCUGCGAGGCAGGAACACAUCCUCUGAAUACCAAAUACUAACUGCUAGAAGAGAAGACUCUGGGUUAUACUGGUGCGAGGCUGCCACAGAGGAUGGAAAUGUCCUUAAGCGCAGCCCUGAGUUGGAGCUUCAAGUGCUUGGCCUCCAGUUACCAACUCCUGUCUGGUUUCAUGUCCUUUUCUAUCUGGCAGUGGGAAUAAUGUUUUUAGUGAACACUGUUCUCUGGGUGACAAUACGUAAAGAACUGAAAAGAAAGAAAAAGUGGGAUUUAGAAAUCUCUUUGGAUUCUGGUCAUGAGAAGAAGGUAAUUUCCAGCCUUCAAGAAGACAGACAUUUAGAAGAAGAGCUGAAAUGUCAGGAACAAAAAGAAGAACAGCUGCAGGAAGGGGUGCACCGGAAGGAGCCCCAGGGGGCCACGUAGCAGCGGCUCAGUGGGUGGCCAUCGAUCUGGACCGUCCCCUGCCCACUUGCUCCCCGUGAGCACUGCGUACAAACAUCCAAAAGUUCAACAACACCAGAACUGUGUGUCUCAUGGUAUGUAACUCUUAAAGCAAAUAAAUGAACUGACUUCAACUGGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-409.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -432.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 430.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((((((........(((((((((.........)))).))....)))((((((((((..((.((((......(((.(((...((((.((((.....)))).))))...)))))).(((..((((....))))..))).......(((((((((.((((((.........)))))).)))...)))))).(((((.((((((((.(((.((.(((((((......((.((......(((((.(((.((.......)).))).)))))....)).)).....)))))))...)))))...(((((((......((((((.(((..(((((........)).)))..))).))))))(((((((((.((((.(((.....(((.(((((((((.(((.((((((((((((.(((..(((((.((.(((((((...........(((.(((((......))))).))).(((..(((...............)))..)))....))).)))).)))))))...(((.(((((((..(((((((((.((....((((...((((......))))...))))...))))).))))))......((((.....))))..(((((.(((((.(....)..))))).....)))))))))))).)))....((((((((.....(((....)))....)))))))).))).))))))))).......))).)))))).)))))).))).....)))))))...........(((.....)))....))))))))))))))))....))))..((((((....(((((((....)))))))....))))))..(((((((((((...((.((...))))..)))).)))))))((((((..(((((((.((((((((.(((..(((((((((((.(((((.....))))).)))))))((.(((....))).))....))))...))).))))))...((((((((((......)))))))))))).))))))).((((((........))))))....)))))).)))).)))))..)))).))..)))))))))).........))))..)))))))(((((((..(((((..((((((((..(((((.(......).)))))..)))..)))..))..)))))..)).))))).((((.((((...((((((((((..................(((((..........)))))..))).)))))))...)))).................((((.....))))..)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

........,.(((((((((({.....{(((({({.(((,,(((((.{....{(({({,,,{,|||...,,{{{{{{{(({{...}),}},|||{||||{.{{{{{{((((,,,.,,.((((..(((.{((((....))}}}}))).}}}}}}.,||)))))))|||||,.}}),,}})))))|{{{{{.{{(((((|,,|||...{(((,,.|||,,,.{({((({.....,({,((......{(((({({({((.{{{{..,)})),})))},....}},}|,,.,,|}}}}}),,,,|||}...}}}.}}},,,.,,|||||..,{{||{.(((|||.{{..,,.,,)}.}))}))}}||{{{,,(((({.({..{(({...)))).,)),))))),,}}.}}}}})}|,||,..,({{(((((.....(((((({.,,,,.....{((.{{{||,.....}}}}|,}}}.,||,...,........{{{{{,{||...,........}},.{{{(((......)))))},}}}}),))))}}}))))},..,.,})},}}||{{,....,))}))))))))..)))))}.,,,.{{{|,,..,.))))...},))))))))))},(((,(((((((.((....((((((((((((...((((.......(((((.((((.......(((((,{{.(((((((.(((((.{((((.(((((.(((.,.,..{{{{{.,,))))).......,,|{{(((,.(({.......((((((((((((((((((.,((({....{||||.{{{.((((((....(((((({....}))))))....)))))),.(((((((((((...{{.{{...))}}..)))).))))))).,}}}))))}})}.)}}})))))).)))))))))(((((((.(((((.....))))).))))))){{.((,....,}}.},....,|{....,,..,,......}||,|||}}}},||||..,,)))))))).))))))))}((((((........)))))).............,,,))))).))))))),,},,))))).........)))).)))))))))...)))))).)))))).....)))))))))((({((.(((((.((,.(((.(((((((((......))).))).)))))),)).}}})))...}}}),))..{((((((..,,,..,,..(((((..........))))).,)}).....,.))))))).........,........{{{{.....}))}..)))).