Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001379408.1
Sequence Length
5671 nt
GC Content
0.3765
GCCAAUCCUGCAGCGCCUUCAACAGGUUUCGGGCGGCGAAUUCCAGUUCUCCGGGUUUUGGGGCUCCCUGCGGGAGGCAGUGCUGGAUCUGGGAAUCUCUAGGAAAGGAAAGAGCAAAGGAGGGGAAAGAUGGGGGGCUGCAGUCUCCACGUACGUCCCUCAAAGCGCGUCCUAAAACCCGGAUAACCGGAGCGCUCCCCAUGGACCACACGGAGGGCUCGCCCGCGGAGGAGCCGCCUGCGCAUGCUCCAUCGCCUGGGAAAUUUGGUGAGCGGCCUCCACCUAAACGACUUACUAGGGAAGCUAUGCGAAAUUAUUUAAAAGAGCGAGGGGAUCAAACAGUACUUAUUCUUCAUGCAAAAGUUGCACAGAAGUCAUAUGGAAAUGAAAAAAGGUUUUUUUGCCCACCUCCUUGUGUAUAUCUUAUGGGCAGUGGAUGGAAGAAAAAAAAAGAACAAAUGGAACGCGAUGGUUGUUCUGAACAAGAGUCUCAACCGUGUGCAUUUAUUGGGAUAGGAAAUAGUGACCAAGAAAUGCAGCAGCUAAACUUGGAAGGAAAGAACUAUUGCACAGCCAAAACAUUGUAUAUAUCUGACUCAGACAAGCGAAAGCACUUCAUGUUGUCUGUAAAGAUGUUCUAUGGCAACAGUGAUGACAUUGGUGUGUUCCUCAGCAAGCGGAUAAAAGUCAUCUCCAAACCUUCCAAAAAGAAGCAGUCAUUGAAAAAUGCUGACUUAUGCAUUGCCUCAGGAACAAAGGUGGCUCUGUUUAAUCGACUACGAUCCCAGACAGUUAGUACCAGAUACUUGCAUGUAGAAGGAGGUAAUUUUCAUGCCAGUUCACAGCAGUGGGGAGCCUUUUUUAUUCAUCUCUUGGAUGAUGAUGAAUCAGAAGGAGAAGAAUUCACAGUCCGAGAUGGCUACAUCCAUUAUGGACAAACAGUCAAACUUGUGUGCUCAGUUACUGGCAUGGCACUCCCAAGAUUGAUAAUUAGGAAAGUUGAUAAGCAGACCGCAUUAUUGGAUGCAGAUGAUCCUGUGUCACAACUCCAUAAAUGUGCAUUUUACCUUAAGGAUACAGAAAGAAUGUAUUUGUGCCUUUCUCAAGAAAGAAUAAUUCAAUUUCAGUUGAAUGGCGGUGGGGACGUAGCAAUGCUUGAACUUACAGGACAGAAUUUCACUCCAAAUUUACGAGUGUGGUUUGGGGAUGUAGAAGCUGAAACUAUGUACAGGUGUGGAGAGAGUAUGCUCUGUGUCGUCCCAGACAUUUCUGCAUUCCGAGAAGGUUGGAGAUGGGUCCGGCAACCAGUCCAGGUUCCAGUAACUUUGGUCCGAAAUGAUGGAAUCAUUUAUUCCACCAGCCUUACCUUUACCUACACACCAGAACCAGGGCCGCGGCCACAUUGCAGUGCAGCAGGAGCAAUCCUUCGAGCCAAUUCAAGCCAGGUGCCCCCUAACGAAUCAAACACAAACAGCGAGGGAAGUUACACAAACGCCAGCACAAAUUCAACCAGUGUCACAUCAUCUACAGCCACAGUGGUAUCCUAACUACCGUCUUUUUGCUAGGACUUAAACUGACUUGAGUGUGGCAAAAAGUUAACAAAAAAGGAGAAAAAAUGAACAAUCGUUUGUGGUUUCUUGGGAAAACUUUUCAUACCAGGUGAUACUAUUCAAAAACCCCGUUGUCUCCCUGCAAGUGCUGAUUUGAAAUGCAGAAGCCACAGUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAUCAAAAUGUAUAAAUAUUGGAAAUCAAGUUUUUCAGCUGUUUUGUUGGUUGGUUGGUUGGUUUUUGUUUGGUUUUGUUUAAAUGGGCAAGAAGUAAAUAAUGUGGCUGGAAUACAAGUUGAACAAACUAGAAGACACAAAUCUAACAUAGUUUUUAUGGACCAAGGAACUUGUAUAUUGUAUAAGCUUUAGUAAAAGGUACAUUUUCACCAUACCUUUUUUUAUAUCACGGUAUUAUAGUACACCUUGUUACCAAAUAGGUUGUUCUCUUCCCCACCCACCUUUGAGCUUUUGCUCUAAAAUACAUUCAGGUUCCAAGCCUGACCAUCCUUGUUUAAUCUAUCAUACUCUUCCAGGUUUUUUUUUUUUGGUCUAAGGCUGGAACUUUUUUCUUUUUUUUCAGCUGAAGUCUUAUGACUUUUCAUGAGUCAAAAUUGUUUGGAUUUCAGCAAGUCAAAUCUUGCAAAGGCCUGCAUAUUUUUUUUAAGAUUAUAUGAAGUCUGUGCAAAAGCUUUAAAAAAAUGCCUCUGCCUUGCCUGCAAUACAUGCAAUGUAUGUUAACUUAGUCUCUCUUCUCAGACACUGUUGGUAGUUAUUUCUGUGUUUUCCUUUUUUUAAAAAAAAAUAUGGACUUAUUGUGGUUAUCUGAGAGGUUCUAACAUUCACAUGCAAUUUGGUGUGGCCAUUUAGCUAUUAAUGAGUUAAUGGCGCAGAACUUGUUGAUAUUUGAAGUGUUCUCUCCCCUUUUCCCAUGACGUAAAUACAUAGGUGUGUUCCAGGAUUUGUUCAGGUUUUUCCCCCCUCCUAAUCUUGUACAUAACUUGUAUUAUGUGUAAGUUAAACAUUUUAUUUUGAACUUGGAAUGUUCCCAGUGAUUUCAUUCAGCAGGGUAUUUUCUGCCUUGUUGGCAAGUGACAAAAAAUAUGGGAAGUAUUUGCUACCAGUUGGUAGAUGGUGCCCUUAAUGGUAGAAUGAGGAAAAUGUCCGCAAAAGCAUGUUUUAUUAUCUUUACUUUUUUGGGGGGUUGGAGGGGGUAGCCUAGCCAGAACAUCAUUGUAAUCUUAAAACAUAAGAUGCUUUUAUUAGAUGAUCAACUAAAAUAGCUGGAAGACAGUACUUUAGAAACAGAUAGUUGUAAGAUUAUAAAAUGCAAAUGUAACUUAUGUUUUCAUUUUUUUCUCUGCCUUUUUUGUUUGUUUGUUUUCUCUUUUCCAGUACUGAGCAUCUCCACAAAUGUCUCCUAACUCAGAAAAUGUUUCUUUUCUUUUCAGUUGAGAUUUGGUUGCAUUCAGGGUUGUAGGUUGGCCUUGCUUGCUAACCCCGCCGGUUUUACCGUGCUUUCAUUCCUGAACUUUGUUUAUGCCUUUGUUUGGUUUCUUCGAAAUUGCAGCAGACUCAUUGGGCUACAUUUAGUACAGGAACCACGUGUGUAAUGUUAUACAACACAGUCUAGUAAUACAAUCAUCCCUCUUAGAGUAAAAACUACCUCUAGAUUGUGGUAAGCUUUUACUGUCCCAUAAAACAGGAGCCACAGUACCUUAUGAAUGCAAAACUGUAACUUCCUACAGUGUUUCCCUACAGAACAUUGUCUUUCUGGUGUCCUGGGCUGUUUUGAAAAAGUUUCCAUUAAUAGACUUUUUAGAAAUUAUUAUUAGUAGCAUUUUUUUUCCAGCUUUGCUGUCUUCAUCACUCACUCUAUGCUCAGACUAUGCCACUGUAAAUAUUCUUCCUAACAUCUUUAAAUCGCCUUUUCCUCAGUUUUCAAGGGGAAGGUCAUUUGUAAAGCACGUUAGGUGGUUAAAUCAGUUAUUGCGGUUUUCUCUUACUGCAAGCCUUUUUAAUCACCCCCAGGCUGCAUUUUAUUCUAUAUCGCCUUUUUUCUUCAAAUCUGCUCCAAUCACUCACUUCUCUCUUAUAAGCUAAUCCUGCCUCACACCUUAAAUCUGUUUCAGUGAUCAAGGGCAGAACUCAUUGUGGCCUUAUCUUUCUUUGUUGUAAUUGUUCACUGUCUCUUUCUUACAGACCACUUAUUUCUGAGUAGUAGUUAUUCCUCUCUAUGGAGUCAUGGCAGGAAUCAUUACACAGUGCUUUUGUUCAGAGCAUGGACAUGUUCCUAGUGCUGCUUUGCUUUAACGGCCACAAGUUUCCUCCACUUCCUAGGUUUGGUAUUUAGUUAAGGAAUCAUAUUAAAUUAACCAAUAACAAAAGAGAUACUUUUGAAGAACAAACUAUUCCUUACCCAUUUUUGUAGCUCAAAAAUAAUUUUUCAAGUUCAUGACCUUAUUAAAAUGAACUUGUGUUUUUUUAACAAACAUGUAUGUUUUAUUUUGAUAGUUUCUUUCCGUAAGAUAAUUGAAAUAUUAUACUGUAAACCCUUUUCUUUUCUUUUUUUGAAAAGUCCAAGAAUGUACUUAUACAGGCAUUUUUCCCCACCUAUUUUUGGCCAUUCUCAUACCACAGACUAAAGAGUGAAAUGAUUUGUCCAUUGUAGCUUAUUGUUUAUCAGUAGUUCUUUUGUCAGCUGCUUACAUUUUUUCUUUCAUGGUUUUGUGAAUCAUUUUCAGUAUGUAAUUUAUAGGAACCUUGUCCUCUGGUUAUAGUAGACUGUGUGCCCUCCUCCAGUGAUGGCAUUAUUAGACAUGCUGGUCAUUUACCCUCAGAAAGACUCUCUUAUUAGAAUGGUGAGUGCUUCAGUUAUAGUAUGUUUGAAUUUUUAAAAAAUUCUGUUUUAGAAAUGUAUCUUAUGCUCUCAUGACUAUGCAGUUUCUAAACAUACACAUAGAAGCUGAGUCUCUGAUCCAAUAUGUUUUUAUUUGUUCCAUUUAAUUUAUCACAUAGAUUGGGAAGGCAAGCUAAAAGCCUUAAAAAUGCCCUUUAUAUUUUGAGUGAUUUCAGCGUUGAACACUAGUAUACUAUCUAAAUUUGCUGCUCACUUUCUUUAAACUGUGGCAAUUAAAGGCAUGUUUAUACAUGACUUAAUCGUGAAAUGUUUGUCACUCUUACUGCACAGACUUAUCUGCAAUCAUAACUGGUUAGUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUAUUGUUUUUAAUGAAACUGGUACCAUCUGUGCUUUCACAAAAAACUUCCAAUGCCAUUUUUGAGAACUAACCUAACUAGUCAUGCUAACCAGAAAAUCCACUGGGGAGGAGGUUCCUUUUGAAACAAAAUGCUGUUCAGUUAGUAACCAAGUUACUUUGAUUGCAAAAGCAGCUGUGUUUCU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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1443.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1555.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 1383.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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