Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001382796.1
Sequence Length
4470 nt
GC Content
0.6022
CCCCUCCAUUGGGACCGGAGAAACCAGGGGAGCCCCCCGGGCAGCCGCGCGCCCCUUCCCACGGGGCCCUUUACUGCGCCGCGCGCCCGGCCCCCACCCCUCGCAGCACCCCGCGCCCCGCGCCCUCCCAGCCGGGUCCAGCCGGAGCCAUGGGGCCGGAGCCGCAGUGAGCACCAUGGAGCUGGCGGCCUUGUGCCGCUGGGGGCUCCUCCUCGCCCUCUUGCCCCCCGGAGCCGCGAGCACCCAAGUGUGCACCGGCACAGACAUGAAGCUGCGGCUCCCUGCCAGUCCCGAGACCCACCUGGACAUGCUCCGCCACCUCUACCAGGGCUGCCAGGUGGUGCAGGGAAACCUGGAACUCACCUACCUGCCCACCAAUGCCAGCCUGUCCUUCCUGCAGGAUAUCCAGGAGGUGCAGGGCUACGUGCUCAUCGCUCACAACCAAGUGAGGCAGGUCCCACUGCAGAGGCUGCGGAUUGUGCGAGGCACCCAGCUCUUUGAGGACAACUAUGCCCUGGCCGUGCUAGACAAUGGAGACCCGCUGAACAAUACCACCCCUGUCACAGGGGCCUCCCCAGGAGGCCUGCGGGAGCUGCAGCUUCGAAGCCUCACAGAGAUCUUGAAAGGAGGGGUCUUGAUCCAGCGGAACCCCCAGCUCUGCUACCAGGACACGAUUUUGUGGAAGGACAUCUUCCACAAGAACAACCAGCUGGCUCUCACACUGAUAGACACCAACCGCUCUCGGGCCUGCCACCCCUGUUCUCCGAUGUGUAAGGGCUCCCGCUGCUGGGGAGAGAGUUCUGAGGAUUGUCAGAGCCUGACGCGCACUGUCUGUGCCGGUGGCUGUGCCCGCUGCAAGGGGCCACUGCCCACUGACUGCUGCCAUGAGCAGUGUGCUGCCGGCUGCACGGGCCCCAAGCACUCUGACUGCCUGGCCUGCCUCCACUUCAACCACAGUGGCAUCUGUGAGCUGCACUGCCCAGCCCUGGUCACCUACAACACAGACACGUUUGAGUCCAUGCCCAAUCCCGAGGGCCGGUAUACAUUCGGCGCCAGCUGUGUGACUGCCUGUCCCUACAACUACCUUUCUACGGACGUGGGAUCCUGCACCCUCGUCUGCCCCCUGCACAACCAAGAGGUGACAGCAGAGGAUGGAACACAGCGGUGUGAGAAGUGCAGCAAGCCCUGUGCCCGAGUGUGCUAUGGUCUGGGCAUGGAGCACUUGCGAGAGGUGAGGGCAGUUACCAGUGCCAAUAUCCAGGAGUUUGCUGGCUGCAAGAAGAUCUUUGGGAGCCUGGCAUUUCUGCCGGAGAGCUUUGAUGGGGACCCAGCCUCCAACACUGCCCCGCUCCAGCCAGAGCAGCUCCAAGUGUUUGAGACUCUGGAAGAGAUCACAGGUUACCUAUACAUCUCAGCAUGGCCGGACAGCCUGCCUGACCUCAGCGUCUUCCAGAACCUGCAAGUAAUCCGGGGACGAAUUCUGCACAAUGGCGCCUACUCGCUGACCCUGCAAGGGCUGGGCAUCAGCUGGCUGGGGCUGCGCUCACUGAGGGAACUGGGCAGUGGACUGGCCCUCAUCCACCAUAACACCCACCUCUGCUUCGUGCACACGGUGCCCUGGGACCAGCUCUUUCGGAACCCGCACCAAGCUCUGCUCCACACUGCCAACCGGCCAGAGGACGAGUGUGUGGGCGAGGGCCUGGCCUGCCACCAGCUGUGCGCCCGAGGGCACUGCUGGGGUCCAGGGCCCACCCAGUGUGUCAACUGCAGCCAGUUCCUUCGGGGCCAGGAGUGCGUGGAGGAAUGCCGAGUACUGCAGGGGCUCCCCAGGGAGUAUGUGAAUGCCAGGCACUGUUUGCCGUGCCACCCUGAGUGUCAGCCCCAGAAUGGCUCAGUGACCUGUUUUGGACCGGAGGCUGACCAGUGUGUGGCCUGUGCCCACUAUAAGGACCCUCCCUUCUGCGUGGCCCGCUGCCCCAGCGGUGUGAAACCUGACCUCUCCUACAUGCCCAUCUGGAAGUUUCCAGAUGAGGAGGGCGCAUGCCAGCCUUGCCCCAUCAACUGCACCCACUCCUGUGUGGACCUGGAUGACAAGGGCUGCCCCGCCGAGCAGAGAGCCAGCCCUCUGACGUCCAUCAUCUCUGCGGUGGUUGGCAUUCUGCUGGUCGUGGUCUUGGGGGUGGUCUUUGGGAUCCUCAUCAAGCGACGGCAGCAGAAGAUCCGGAAGUACACGAUGCGGAGACUGCUGCAGGAAACGGAGCUGGUGGAGCCGCUGACACCUAGCGGAGCGAUGCCCAACCAGGCGCAGAUGCGGAUCCUGAAAGAGACGGAGCUGAGGAAGGUGAAGGUGCUUGGAUCUGGCGCUUUUGGCACAGUCUACAAGGGCAUCUGGAUCCCUGAUGGGGAGAAUGUGAAAAUUCCAGUGGCCAUCAAAGUGUUGAGGGAAAACACAUCCCCCAAAGCCAACAAAGAAAUCUUAGACGAAGCAUACGUGAUGGCUGGUGUGGGCUCCCCAUAUGUCUCCCGCCUUCUGGGCAUCUGCCUGACAUCCACGGUGCAGCUGGUGACACAGCUUAUGCCCUAUGGCUGCCUCUUAGACCAUGUCCGGGAAAACCGCGGACGCCUGGGCUCCCAGGACCUGCUGAACUGGUGUAUGCAGAUUGCCAAGGGGAUGAGCUACCUGGAGGAUGUGCGGCUCGUACACAGGGACUUGGCCGCUCGGAACGUGCUGGUCAAGAGUCCCAACCAUGUCAAAAUUACAGACUUCGGGCUGGCUCGGCUGCUGGACAUUGACGAGACAGAGUACCAUGCAGAUGGGGGCAAGGUGCCCAUCAAGUGGAUGGCGCUGGAGUCCAUUCUCCGCCGGCGGUUCACCCACCAGAGUGAUGUGUGGAGUUAUGGUGUGACUGUGUGGGAGCUGAUGACUUUUGGGGCCAAACCUUACGAUGGGAUCCCAGCCCGGGAGAUCCCUGACCUGCUGGAAAAGGGGGAGCGGCUGCCCCAGCCCCCCAUCUGCACCAUUGAUGUCUACAUGAUCAUGGUCAAAUGUUGGAUGAUUGACUCUGAAUGUCGGCCAAGAUUCCGGGAGUUGGUGUCUGAAUUCUCCCGCAUGGCCAGGGACCCCCAGCGCUUUGUGGUCAUCCAGAAUGAGGACUUGGGCCCAGCCAGUCCCUUGGACAGCACCUUCUACCGCUCACUGCUGGAGGACGAUGACAUGGGGGACCUGGUGGAUGCUGAGGAGUAUCUGAGUGGCGGUGGGGACCUGACACUAGGGCUGGAGCCCUCUGAAGAGGAGGCCCCCAGGUCUCCACUGGCACCCUCCGAAGGGGCUGGCUCCGAUGUAUUUGAUGGUGACCUGGGAAUGGGGGCAGCCAAGGGGCUGCAAAGCCUCCCCACACAUGACCCCAGCCCUCUACAGCGGUACAGUGAGGACCCCACAGUACCCCUGCCCUCUGAGACUGAUGGCUACGUUGCCCCCCUGACCUGCAGCCCCCAGCCUGAAUAUGUGAACCAGCCAGAUGUUCGGCCCCAGCCCCCUUCGCCCCGAGAGGGCCCUCUGCCUGCUGCCCGACCUGCUGGUGCCACUCUGGAAAGGCCCAAGACUCUCUCCCCAGGGAAGAAUGGGGUCGUCAAAGACGUUUUUGCCUUUGGGGGUGCCGUGGAGAACCCCGAGUACUUGACACCCCAGGGAGGAGCUGCCCCUCAGCCCCACCCUCCUCCUGCCUUCAGCCCAGCCUUCGACAACCUCUAUUACUGGGACCAGGACCCACCAGAGCGGGGGGCUCCACCCAGCACCUUCAAAGGGACACCUACGGCAGAGAACCCAGAGUACCUGGGUCUGGACGUGCCAGUGUGAACCAGAAGGCCAAGUCCGCAGAAGCCCUGAUGUGUCCUCAGGGAGCAGGGAAGGCCUGACUUCUGCUGGCAUCAAGAGGUGGGAGGGCCCUCCGACCACUUCCAGGGGAACCUGCCAUGCCAGGAACCUGUCCUAAGGAACCUUCCUUCCUGCUUGAGUUCCCAGAUGGCUGGAAGGGGUCCAGCCUCGUUGGAAGAGGAACAGCACUGGGGAGUCUUUGUGGAUUCUGAGGCCCUGCCCAAUGAGACUCUAGGGUCCAGUGGAUGCCACAGCCCAGCUUGGCCCUUUCCUUCCAGAUCCUGGGUACUGAAAGCCUUAGGGAAGCUGGCCUGAGAGGGGAAGCGGCCCUAAGGGAGUGUCUAAGAACAAAAGCGACCCAUUCAGAGACUGUCCCUGAAACCUAGUACUGCCCCCCAUGAGGAAGGAACAGCAAUGGUGUCAGUAUCCAGGCUUUGUACAGAGUGCUUUUCUGUUUAGUUUUUACUUUUUUUGUUUUGUUUUUUUAAAGAUGAAAUAAAGACCCAGGGGGAGAAUGGGUGUUGUAUGGGGAGGCAAGUGUGGGGGGUCCUUCUCCACACCCACUUUGUCCAUUUGCAAAUAUAUUUUGGAAAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1870.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1945.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 1429.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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