Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001382813.1
Sequence Length
1067 nt
GC Content
0.5408
GAGCAUGUUGGCCUGGUCCUUUGCUAGGUACUGUAGAGCAGGUGAGAGAGUGAGGGGGAAGGACUCCAAAUUAGACCAGUUCUUAGCCAUGAAGCAGAGACUCUGAAGCCAGACUACCUGGGUCCCAAUCUUGGGCUUGGUAUUUCCUCGCUGUGUGACUCUGGGCUCUUUAAGGGUCACCCAGAGACUCUGGAGAAGUUUGACAAGUUCAAGCACCUGAAGUCAGAGGACGAGAUGAAGGCGUCUGAGGACUUAAAGAAGCAUGGUGCCACCGUGCUCACCGCCCUGGGUGGCAUCCUUAAGAAGAAGGGGCAUCAUGAGGCAGAGAUUAAGCCCCUGGCACAGUCGCAUGCCACCAAGCACAAGAUCCCCGUGAAGUACCUGGAGUUCAUCUCGGAAUGCAUCAUCCAGGUUCUGCAGAGCAAGCAUCCCGGGGACUUUGGUGCUGAUGCCCAGGGGGCCAUGAACAAGGCCCUGGAGCUGUUCCGGAAGGACAUGGCCUCCAACUACAAGGAGCUGGGCUUCCAGGGCUAGGCCCCUGCCGCUCCCACCCCCACCCAUCUGGGCCCCGGGUUCAAGAGAGAGCGGGGUCUGAUCUCGUGUAGCCAUAUAGAGUUUGCUUCUGAGUGUCUGCUUUGUUUAGUAGAGGUGGGCAGGAGGAGCUGAGGGGCUGGGGCUGGGGUGUUGAAGUUGGCUUUGCAUGCCCAGCGAUGCGCCUCCCUGUGGGAUGUCAUCACCCUGGGAACCGGGAGUGGCCCUUGGCUCACUGUGUUCUGCAUGGUUUGGAUCUGAAUUAAUUGUCCUUUCUUCUAAAUCCCAACCGAACUUCUUCCAACCUCCAAACUGGCUGUAACCCCAAAUCCAAGCCAUUAACUACACCUGACAGUAGCAAUUGUCUGAUUAAUCACUGGCCCCUUGAAGACAGCAGAAUGUCCCUUUGCAAUGAGGAGGAGAUCUGGGCUGGGCGGGCCAGCUGGGGAAGCAUUUGACUAUCUGGAACUUGUGUGUGCCUCCUCAGGUAUGGCAGUGACUCACCUGGUUUUAAUAAAACAACCUGCAACAUCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-403.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -423.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 168.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((((((((.....))))))).....(((.((((((((..(.((((((((((((((....((((((..(((.(((.((((((...((((((((..(((.(((((.((((((.(((((((((((((.(((((((.(((((((.(((.((((((((..........)))))))).))).))....))))).((((((.....))))))..((.(((((...(((((.........)))))...)))))..))...(((((((((...((((.((((......))))))))((((......))))))))))))).((((..((((..(((...)))..))))...))))))))))).))))))(((((.((.(((((((((((((......))))......)))))))..(((...))).)).)).))))).....((((.((((((((((((((((((......((((((((((((((((((((.((......)))))........)))))..))).))))))))).(((((((.(.(((((..(.((((((.(((.((((((((..(((....)))..)))))))))))((((.(.(((.(........).))).)))))..((((((......))))))))))))..)..))))).))))))))...((((((((((.((((....)))))))).)))))).))).))))))...)))).))))).)))).)))).))).)).))))...))))))))..)).)))))))))))).))).)))..)))))))))))))))))).................................(((((...............)))))............((((((....))))))(((....)))((((((((((..((....((((.(.(((((((.....)))).))).)))))..))))).)))))))(((((((.((((...((............))..)))).)))))))......)).)..)))))))).)))...............))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((((((((.....)))))))..,.,{((,((((((((.{(.,,((((((((((((....((((((..(((.(((.((((((...((((((((..((,,(((((.((((((,({(((((,(((((.(((((((.{((((((.(((.((((((((..........)))))))).))).))....))))}.((((((.....))))))..{{.(((((...(((((.........)))))...)))))..,}...(((((((((.,,((((.((((......))))))))((({......}}))))))))))).((((..((((..(((...)))..))))...))))))))))).)))))|(((((.((.(,((((((((,,({{....},))}.....))))))).}|((...,,..)).)).))))),....((((.((((((((((((((((((......(((((((((((((((((((,,((......)))))........)))))..))),})))))))).(((((((.(.(((((,.{.((((((.{((.((((((((..(((....)))..)))))))))}}((({.(,({{.{,.,,,,}.,.}}}.}}))),.((((((......))))))))))))..)}.))))).))))))))...((((((((({.((((....)))})))).)))))).))).))),))}},,))).})))).)))).))))}.)),)).))))...))))))))..)).)))))))))))).))).)))..))))))))))))))))))...}}......{,.....,,}...,..,,,.,.(((((...............)))))............((((((....)))))),|,....,,,(((((((((,..,{.{,,(((,,(.(((((((.....)))).))).))))}.}))))).)))))))(((((((.((((...((............))..)))).)))))))}}.)))}),}..)))))))),))},.......,......))))))))).
Back