Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001384341.1

Sequence Length

2696 nt

GC Content

0.5456

GUGGUGCCUGAGGAGAGAGCUCUCUGAAAGCAGCCCACACCACCAGCAAAGCCACUUCCACCUUCUCAGCUUCCUCUGUUUGCUUCAUGUCCUUUCCUUCCCCACUCCCCCGCCAAAAAAAAGAAAGAAAAAGGAGAAAGUAUGGGUGUGGAGAUGGAGUAUGUAUUUAUUUUACAAAAAUAAAUCACCAUCUUCGGACCAUUUGUAGACUGGAACAUUUCGAGCAAUGAGUGCGCCACACGGACGAGUGCCCUGAGCGCCUGGACACCGGAAAAGGCGAUUCCCUGAGCGCCUGGAGUUGGAGACAAUUCCUGGUUCAGAAUUUAAACAUCUUUCUAGGUCUGCGCGGGGCGGCCAUUGGCGGCGGAGUGUCACGUGACCGCGGGGGCGUGCCAAUGUGCGCCCUCACGGGUGUCAAACCCCUGUCAGAGUGUGCGAUCAAGAUCGUGAAACAACGCGAUGCAAAAAGCGACCUACUACGACAGCUCGGCGAUCUACGGUGGCUACCCCUACCAGGCAGCCAACGGGUUCGCUUAUAAUGCCAAUCAGCAGCCGUACCCGGCGUCCGCCGCUUUGGGCGCCGACGGCGAGUACCACCGACCCGCCUGCUCCCUCCAGUCUCCCUCCAGCGCCGGGGGCCACCCCAAGGCACACGAACUGAGUGAGGCGUGCCUGCGCACCCUGAGCGCCCCACCUAGCCAGCCUCCAAGCCUGGGAGAGCCGCCCCUGCACCCGCCGCCGCCCCAGGCCGCGCCCCCUGCCCCACAGCCGCCUCAGCCCGCACCUCAGCCCCCUGCACCUACCCCUGCCGCGCCCCCGCCUCCCUCUUCUGCCUCCCCUCCUCAGAAUGCCAGCAACAACCCUACCCCUGCCAACGCGGCCAAGAGCCCCCUGCUCAACUCACCCACAGUGGCCAAACAAAUCUUCCCCUGGAUGAAAGAGUCUCGACAAAACACAAAGCAGAAAACCAGCAGCUCCAGCUCAGGCGAAAGCUGCGCUGGCGACAAGAGCCCGCCGGGGCAGGCUUCGUCCAAGCGCGCGCGCACGGCCUACACGAGCGCGCAGCUGGUGGAGCUGGAGAAAGAGUUCCACUUCAACCGCUACCUGUGCCGGCCGCGCCGGGUGGAGAUGGCCAAUCUGCUGAACCUCACUGAGCGCCAGAUCAAGAUCUGGUUCCAGAAUCGCCGCAUGAAGUACAAAAAGGAUCAGAAGGGCAAGGGCAUGCUAACGUCAUCGGGGGGCCAGUCUCCAAGUCGCAGCCCCGUGCCCCCCGGAGCCGGUGGCUAUCUGAACUCUAUGCAUUCGCUGGUCAACAGCGUCCCGUAUGAGCCCCAGUCGCCCCCGCCCUUCUCCAAGCCCCCCCAGGGUACCUACGGGCUGCCCCCCGCCUCCUACCCUGCGUCCCUGCCCAGCUGCGCACCCCCGCCACCCCCACAGAAGCGCUACACGGCGGCAGGGGCGGGCGCAGGGGGCACCCCCGACUAUGACCCGCACGCUCAUGGCCUGCAGGGCAACGGCAGCUAUGGGACCCCACACAUACAGGGAAGCCCCGUCUUCGUGGGGGGCAGCUAUGUGGAGCCCAUGAGCAACUCCGGGCCAGCCCUCUUUGGUCUAACUCACCUCCCCCACGCUGCCUCGGGCGCCAUGGACUAUGGGGGUGCCGGGCCGCUGGGCAGCGGCCACCACCACGGGCCGGGGCCUGGGGAGCCGCACCCCACCUACACGGACCUUACCGGCCACCAUCCUUCUCAGGGAAGAAUUCAGGAAGCACCCAAGCUCACCCACCUGUGAUAGUGGGCUUGGGGCUACGCGCCAGGAGAGUCUCCCCCCACCCACCUUUUUUCUUUGGUUGCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAGGUUCUUCCUGCCCUUUCCUUCCUUCCUUUUCUCUCUUCUCCGCCCCGCACUCCGUUUCCCGGUUUCCCCCCUCGUUGGUAAGGCGUUUUUAUAGUUUAUGUGACGUAGCAAUCUUGGUUGCUGGAAUGGCUGUAUCAUAGCGAUAUUUAUCUCUUCCUGCUCCUCGAUAGGCCACUGGCCCUGCACCCUUUACCUUCUCCACUCUUUGAUCAGAAACAGGGUAUAUGAACAAAUUUUCUAGUCGAGUUUUCAAUGUGAAUUUGUUCUUACAUUAUGGCUCCCGAGGGGAAGCGAUUACUUUUUUUAAUUUUAAAUUUUUUUUUUAAUUGCACUUCUUGUAAAGAGUGAGAAAAAAAAUCAAAGGCGCUUUGAAACAGGGGCUCUCUGUGCAAGGAUGACUAAGUGUACGUCUUUCCGUGUGUGUAUGCUGGUGAACAGUCAGAUUUAUUUAUAUUUUUUUGCAAGCAUUGAAUAAUCUAAGUUUUAAAUAUUAUUUAUCCCCAUCCGUUCGUAUUUAUAUUAAAGAAUUCUGUACCCUGAUGGUUCAGAAGGGUUCUUGGGCCUUUUGUUCAAUUGUGUAUUGGCGUACUUAGAAUUUUUUUUAUUUGAAAGAGAAAUAUAAUUCCUUUAAACGGUAACGAUACAAUAAAACCAGAGAAGAUCCAGCUUUUGAAAACAGUGAUUUAGGUUUGUAACAUCCGGCAAAACUGAAAAAAAAAAUCUGUAAACGCGAAAAAUACUAGAUUUGUUUUGAGAGUUCUUCAUUCCUUGCUGCUCACAUUCUGAGAAACAAAAAGAAAUAAAGUUUUUAUUCUGAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-900.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -949.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 792.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((.(..(((((....)))))..).)))..))))..((((((((..(((((((.(((((((.(((...(((((((((......((.(((((((((((((..((....((((.................((((((.(((.((((((((((((((....((.(((((((((...))))))))))))))))))).(((((.((((..((.(..((((...((((.(((((.(((((..((.((((((.((((((.(((((((((....((((.......))))((((..(((.(((((((....))))))).)))))))..............)))))))..)).))))))((..(((((.((((((((((...(((...(.((((((((((....)))))))))).)((((.....))))(((((..(((((((.......((((((......)))))).......)))...))))..)))))..(((((((...((.(((((.((.......)).))))).))(((...........)))..(((((((((((...(((((((((......)))))))))..((((.((.......)).)))).((((.((((((.((((..((((((((((((....))))..))).(((.......)))(((.((((....)))))))(((.((............)))))...(((((((.(.((.((..........)).)))..))))))).((((..((((((((...((.(.(((.....((......)).....(((........))).(((....))).......(((((...........))))).((((((.............((((......(((((.((((.....)))).............))))).......((.(((...))).))......................)))).......((((((...((....))...)))))))))))).....))).).)).))))))))..........))))((((((.((.......)).)))))).))))).))))))))))...))))(((((......(((.....)))(((((...)))))))))).))))).....))))))......(((.(.(((((((....))))))).)))).)))))))...((((....(((((((...((((((.((((((..............((((((..(.(((((..(.((((((((((.((((...)).))))).))))..((((((((.((((...(((((.....)))))....)))))))((((((..(((((.((((........((((.....)))).....((((......)))).......(((((((.(((.((((.(((((.......(((.............))).......)))))..))))))))))))))((((((((((.(((((.((((....((((((((.(((.(.....).))))))))))).((((((....((.(((....)))))....))))))((((((...((((.((((..(((...))).)))).((.((.....)).))............)))))))))).))))...)))))....)))))))))).(((((((....)))))))........)))).))))))))))).((((.......((.....)).......)))).......(((((...)))))..)))))..(((.(((((((((((............))))))))))))))..))))..))))).)..))))))....(((..........))).......................(((.....)))))))))))))))..)))))))....))))..)))...))))))))))..)))))..))...)))))).))..))))).))))).))))))))..))).))))...)))))((.((((.((..(((((.....)))))....)).)))).)).........((((...))))..))))))..))).))))))....((((((.(((((....((......))....))))).)))))).....(((((((........))))))).))))....))))))))).))...................(((((((((((.....(((((........))))))))))))))))..)))))).....)))))))))....))).).)))).))...)))))((((......)))).))...)))))))).....(((((....(((((.((((((((..((((..((((.................(((((((((.....(((((............((((((((((((((.(((((((..(((((((.((...)).)))))))..).......)))))).))))..)))))))))).......((((.(((......))))))).)))))....)))).))))).......(((((....((((((.(((((.....(((((..((((........))))..))))).....(((((((((...........))).))))))))))))))))))))))))))..)))).((((.....))))...)))))))).)))))........)))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.((.,(((((((((((((((.,(((((,({{{,...((((((((..(({{{{,....{{{,.,,{.{{((,,,((((((,.,{(({{((((((((,,.,..{{...............,...,...,})))}},.|||,|(((.(((((((((....((.(((((((({...}))))))))))))))))))).))}....}}}}}}.))}},,,...})),.,,|||||{||((((((((,((((((.(((((((,(((({,,{{(({,,,(({(.{{,.(((({||{|.(((((((....))))))).}))))))..........,,|,,,,,||},,({(,(((((((((...((((((((.({(((....))},({((((((({((....||||||||||,(((((.....}}}}(((((..(((((((.......((((((......)))))).......))).,.))))..)))))...{|{{,.,,.{({(((((.,,,,...,{||{|||},.||||,|||}}.....(((......)))(((((...(((((((({......}))))))))))))){{{{{....,},,,})..,)))}....{(((.....((..(.(((((((....))))..))).)..))}))),)}}||||||||..{{{{.,...,.))))........}|,.|||||...)}})))},),))))))}}}))}}})}))))))}}...))))}},})}},})}....}}),})}}))})...)}}},}}.,...,.(((((...((((((,.((({,..|||.,.....,,,{((.{{{{{{{..,,||..{((({{{,,.........,,{(({{{{({((((..((((.....))))........{{(((((((........{{.,,{...}|}|}|..,,{{,,,.............{{,{....,,,||,|{|,..(((..((((((..((((.((((((.........)))))).))))..))))))..))){{((((((.((.......)).)))))).)),|{{(((({(,,,.....))))))))).,...,)))}},))))..))))))|{.(((((((({{(((...{{((,,{{,,{...{{{||,{{{{{{|,...}}}}))),))))).,.)))},..{{{{....(((((((...((((((.(((((({.{,....,.....((((((..(.(((((..(.((((((((((.((((...)).))))).))))..(((({(((,((((...(((((.....)))))....)))})))((((((..(((((.((((........(({(.....}|||..,..{{{({{{{{{||||{,.....(((((((,(((.((((.(((((.......(((..........,..))).......)))))..))))))))))))))((((((((((.(((((.((((....((((((({,(((.{,....).))))))))))).((((((....{{.(((...,)))}}....))))))((((((...({((.(.{{.{(((....,|.((({{((,......,))}}}..,,,}.}..,.}}}})))))).)))).,.)))))....))))))))))}{|{{{{{,,,,))))))}........)))).))))))))))).((((.......((.....)).......)))).....{{(({...,}))),}..}))))|.(((.(((((((((((.{,....,}...))))))))))))))..))))..))))).)..))))))....(((..........))).,.....................{((.....)))))))))))))))..)))))))....}}))))))))).))...{{{.....)))...........)))))),.))|||,.,|{{,,,,,,}}}}}})},}},,....})))||}||,({,({(((,,,}}}}},)).....,|..}}}}.}}.,,..},,.((((...)))},||,||||,.,...||||,,.,,,..,},..}},,.,)))))....(((((((({{.{..{{.{{....}}.}},.)))))))))).,,.....}))),...))))))).)}),...................{{(((((((((.....((({{,{,...,})))))))))))))))}..,})))))..,)...))))))......)))))|||{{{((.....)).)))))})))))))),.,.)))))))).......((({{{{((((..,,,,,.,,..,|...}||||}||}}..,,..{,,{{{|.|,,,,....,....|,,.}}},,,,.....,{{||{((({.{((,....))}.))}}}}}))}}}}}))){(({,(({..(((((((.(((.(((..,,{((((({(((((......}}))))}}...,,})}.},,..))).)))..)))))))..))).})))}}}..,..}))))}}..........{((((.,((((........)))),.))))},,,,.{((((((({...........))).))))))}))))))))))))))...)))))),.))}))){{((.,(((({{..,,,........})))),.,)),))}}..