Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001384673.1
Sequence Length
1599 nt
GC Content
0.5335
ACUACUCCAGACAGACGGCUUUGGAAUCCACCAGCUACAUCCAGCUCCCUGAGGCAGGACUGAGUGGGCGGAGGCUGAAGAGUUGAGAAUGGAGAGAAUGUUACCUCUCCUGGCUCUGGGGCUCUUGGCGGCUGGGUUCUGCCCUGCUGUCCUCUGCCACCCUAACAGCCCACUUGACGAGGAGAAUCUGACCCAGGAGAACCAAGACCGAGGGACACACGUGGACCUCGGAUUAGCCUCCGCCAACGUGGACUUCGCUUUCAGCCUGUACAAGCAGUUAGUCCUGAAGGCCCCUGAUAAGAAUGUCAUCUUCUCCCCACUGAGCAUCUCCACCGCCUUGGCCUUCCUGUCUCUGGGGGCCCAUAAUACCACCCUGACAGAGAUUCUCAAAGGCCUCAAGUUCAACCUCACGGAGACUUCUGAGGCAGAAAUUCACCAGAGCUUCCAGCACCUCCUGCGCACCCUCAAUCAGUCCAGCGAUGAGCUGCAGCUGAGUAUGGGAAAUGCCAUGUUUGUCAAAGAGCAACUCAGUCUGCUGGACAGGUUCACGGAGGAUGCCAAGAGGCUGUAUGGCUCCGAGGCCUUUGCCACUGACUUUCAGGACUCAGCUGCAGCUAAGAAGCUCAUCAACGACUACGUGAAGAAUGGAACUAGGGGGAAAAUCACAGAUCUGAUCAAGGACCUUGACUCGCAGACAAUGAUGGUCCUGGUGAAUUACAUCUUCUUUAAAGCCAAAUGGGAGAUGCCCUUUGACCCCCAAGAUACUCAUCAGUCAAGGUUCUACUUGAGCAAGAAAAAGUGGGUAAUGGUGCCCAUGAUGAGUUUGCAUCACCUGACUAUACCUUACUUCCGGGACGAGGAGCUGUCCUGCACCGUGGUGGAGCUGAAGUACACAGGCAAUGCCAGCGCACUCUUCAUCCUCCCUGAUCAAGACAAGAUGGAGGAAGUGGAAGCCAUGCUGCUCCCAGAGACCCUGAAGCGGUGGAGAGACUCUCUGGAGUUCAGAGAGAUAGGUGAGCUCUACCUGCCAAAGUUUUCCAUCUCGAGGGACUAUAACCUGAACGACAUACUUCUCCAGCUGGGCAUUGAGGAAGCCUUCACCAGCAAGGCUGACCUGUCAGGGAUCACAGGGGCCAGGAACCUAGCAGUCUCCCAGGUGGUCCAUAAGGCUGUGCUUGAUGUAUUUGAGGAGGGCACAGAAGCAUCUGCUGCCACAGCAGUCAAAAUCACCCUCCUUUCUGCAUUAGUGGAGACAAGGACCAUUGUGCGUUUCAACAGGCCCUUCCUGAUGAUCAUUGUCCCUACAGACACCCAGAACAUCUUCUUCAUGAGCAAAGUCACCAAUCCCAAGCAAGCCUAGAGCUUGCCAUCAAGCAGUGGGGCUCUCAGUAAGGAACUUGGAAUGCAAGCUGGAUGCCUGGGUCUCUGGGCACAGCCUGGCCCCUGUGCACCGAGUGGCCAUGGCAUGUGUGGCCCUGUCUGCUUAUCCUUGGAAGGUGACAGCGAUUCCCUGUGUAGCUCUCACAUGCACAGGGGCCCAUGGACUCUUCAGUCUGGAGGGUCCUGGGCCUCCUGACAGCAAUAAAUAAUUUCGUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-585.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -612.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 317.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((........)))))).....(((((..(((.(((...((((...)))).))).)))((((((((((((......(((...((((((........))))))...)))(((..(((((((((((.((((...)))).))))(((((........................))))).........)))))))..)))...((((((..((....))..)))))).))))))))))))...(.(((..(((((.((...((((....))))....((((.((.((((((((.(((.(((((...(((...(((..(((..((((((((((.((((.......((((((((((((.(((....(((((((((.((.......((((((((((...(((..(((((.(((...))))))))..)))........(((((....(((((((.((.(((.((((((((.(((((((((((((.(((...(((.(((((......)))))....)))....))).)))).)).))))))).))))....)))).))))).)))).)))..))))).)))))))))).......)).)))))..((((((.(((((....))))........((((((((......((((.(((((.....((((......))))..((((((((((((.(..((..((..(((....(((.((...((((((((............))))))))....)).))).)))..))..))..)))))))))))))...((((((((.....(((((((....)))))))......))))).)))..........))))).))))((((((......)))))).)).))))))).))))))(((.(.(.(((...))).).).))).....((((((...(((.......))))))))).)))).....)))..)))))))))))).)))).))))))))))..)))..)))(((((...(((((.((.(((((...........))))).)))))))...))))).......))).))))).))).).)))..)))).)).))))(((((((....).)))))).((((.((((((((.((((((((((((..(((((.((...((((((((((((......((.((((.((((((...((((((((...........((((((...)))))).........))))))))..)))))))))).))....)))))....((((((((((.(((.....)))((((.((..((((......))))....)).))))(((((..((((...((((.(((.......((((((.....))))))..........)))))))))))..)))))..))))))))))........))))))).))))))).....))))))))))))(((...((.(((((((.....)))))))))...)))..)))))))).)))))).))))).))))((((.......))))(((.((((((((((.((((((((((...)))))))))))))))).))))...)))............))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((......,.}}}}|}..,,,{,{{{{...,,{{({{.,{((.,{|{||.{||,{{.((((((((((((.,,,,.({{...((((((........))))))..,))){((..(((((((((((.((((...)))).))))(((((.,...................,..))))).........)))))))..))}...((((((..((....))..)))))).)))))))))))).}}{|||..,}})),.||}}}{({{....})))....((((.({.((((((({.(((.(((((...,,,...(((..(((..((((((((((.{{((.......((((((((((((.,,,....,,,,(((((.((.......((((((((((...(((..(((((.(({...})))))))..)))........(((((..{{((,((((.((.(((.((((((((.(((((((((((((.(((..,((({(((((......))))),,,.}},....))).)))).)).))))))).))))....)))).))))).))))})),..))))).)))))))))).......)).))))){{((((((.(({((....}|||{.,{..({,,,,||||}.},..((((.(((((.....,{{{..,...|}}|{,((((((((((((.,..{{..{{..(((,...(((.((...((((((((............))))))))....)).))).)))..}}..}).,})))))))))))}...|||(((({.....(((((((....)))))))..,...))))).))}..,,......))))).))))((((({......})))))}}.,}}))))).)))))}|}}.....(((...))).|,|,,,{{{.{.((((((...{{{.......))))))))).)})),,},.,)),,))))))))))))}).}}.))))))))))..)))..))){((((...(((((.((.(((((...........))))).)))))))...))))}.......}},.))))).))).}.}))..)))).}).))))(((((({....}.))))))...(((((((((..(((((((((((((..(((((.((...((((((((((((.....,((.((({{((((((...((((((((...........((((((...)))))).........))))))))..)))))))))).)).,..))))),...(((((((((..((..((({.((((,{{....{(((,,.,,.}}}}...{({.....||||,..{((,....,||,,,,.......((((((.....)))))).........,)))))))))))).))))..))))))))))).,...,..))))))).))))))).....))))))))))))).....,{.(((((((.....)))))))||{{(.{(({.,{,,..,,)))}))})),,,..{((((((((.........))))))))|(((((.((((((((({...}))))))))))))))},))))))))..............))))),
Back