Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001384820.1
Sequence Length
5816 nt
GC Content
0.5339
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCUGCCCCAGCUCCGUCUCGGCGGCGGCGGGCAGUUGCAGUGGUGCAGAAUGGCUGACCUCAGUCUUGCAGAUGCAUUAACAGAACCAUCUCCAGACAUUGAGGGAGAGAUAAAGCGGGACUUCAUUGCCACACUAGAGGCAGAGGCCUUUGAUGAUGUUGUGGGAGAAACUGUUGGAAAAACAGACUAUAUUCCUCUCCUGGAUGUUGAUGAGAAAACCGGGAACUCAGAGUCAAAGAAGAAACCGUGCUCAGAAACUAGCCAGAUUGAAGAUACUCCAUCUUCUAAACCAACACUCCUAGCCAAUGGUGGUCAUGGAGUAGAAGGGAGCGAUACUACAGGGUCUCCAACUGAAUUCCUUGAAGAGAAAAUGGCCUACCAGGAAUACCCAAAUAGCCAGAACUGGCCAGAAGAUACCAACUUUUGUUUCCAACCUGAGCAAGUGGUCGAUCCUAUCCAGACUGAUCCCUUUAAGAUGUACCAUGAUGAUGACCUGGCAGAUUUGGUCUUUCCCUCCAGUGCGACAGCUGAUACUUCAAUAUUUGCAGGACAAAAUGAUCCCUUGAAAGACAGUUACGGUAUGUCUCCCUGCAACACAGCUGUUGUACCUCAGGGGUGGUCUGUGGAAGCCUUAAACUCUCCACACUCAGAGUCCUUUGUUUCCCCAGAGGCUGUUGCAGAACCUCCUCAGCCAACGGCAGUUCCCUUAGAGCUAGCCAAGGAGAUAGAAAUGGCAUCAGAAGAGAGGCCACCAGCACAAGCAUUGGAAAUAAUGAUGGGACUGAAGACUACUGACAUGGCACCAUCUAAAGAAACAGAGAUGGCCCUCGCCAAGGACAUGGCACUAGCUACAAAAACCGAGGUGGCAUUGGCUAAAGAUAUGGAAUCACCCACCAAAUUAGAUGUGACACUGGCCAAGGACAUGCAGCCAUCCAUGGAAUCAGAUAUGGCCCUAGUCAAGGACAUGGAACUACCCACAGAAAAAGAAGUGGCCCUGGUUAAGGAUGUCAGAUGGCCCACAGAAACAGAUGUAUCUUCAGCCAAGAAUGUGGUACUGCCCACAGAAACAGAGGUAGCCCCAGCCAAGGAUGUGACACUGUUGAAAGAAACAGAGAGGGCAUCUCCUAUAAAAAUGGACUUAGCCCCUUCCAAGGACAUGGGACCACCCAAAGAAAACAAGAAAGAAACAGAGAGGGCAUCUCCUAUAAAAAUGGACUUGGCUCCUUCCAAGGACAUGGGACCACCCAAAGAAAACAAGAUAGUCCCAGCCAAGGAUUUGGUAUUACUCUCAGAAAUAGAGGUGGCACAGGCUAAUGACAUUAUAUCAUCCACAGAAAUAUCCUCUGCUGAGAAGGUGGCUUUGUCCUCAGAAACAGAGGUAGCCCUGGCCAGGGACAUGACACUGCCCCCGGAAACCAACGUGAUCUUGACCAAGGAUAAAGCACUACCUUUAGAAGCAGAGGUGGCCCCAGUCAAGGACAUGGCUCAACUCCCAGAAACAGAAAUAGCCCCGGCCAAGGAUGUGGCUCCGUCCACAGUAAAAGAAGUGGGCUUGUUGAAGGACAUGUCUCCACUAUCAGAAACAGAAAUGGCUCUGGGCAAGGAUGUGACUCCACCUCCAGAAACAGAAGUAGUUCUCAUCAAGAACGUAUGUCUGCCUCCAGAAAUGGAGGUGGCCCUGACUGAGGAUCAGGUCCCAGCCCUCAAAACAGAAGCACCCCUGGCUAAGGAUGGGGUUCUGACCCUGGCCAACAAUGUGACUCCAGCCAAAGAUGUUCCACCACUCUCAGAAACAGAGGCAACACCAGUUCCAAUUAAAGACAUGGAAAUUGCACAAACACAAAAAGGAAUAAGUGAGGAUUCCCAUUUAGAAUCUCUGCAGGAUGUGGGGCAGUCAGCUGCACCUACUUUCAUGAUUUCACCAGAAACCGUCACAGGAACGGGGAAAAAGUGCAGCUUGCCGGCCGAGGAGGAUUCUGUGUUAGAAAAACUAGGGGAAAGGAAACCAUGCAACAGUCAACCUUCUGAGCUUUCUUCAGAGACCUCAGGAAUAGCCAGGCCAGAAGAAGGAAGGCCUGUGGUGAGUGGGACAGGAAAUGACAUCACCACCCCACCGAACAAGGAGCUCCCACCAAGCCCAGAGAAGAAAACAAAGCCAGCUCCCACCACCAUUGGUGGGUUGAAUAAAAAACCCAUGAGCCUUGCUUCAGGCUUAGUGCCAGCUGCCCCACCCAAACGCCCUGCCGUCGCCUCUGCCAGGCCUUCCAUCUUACCUUCAAAAGACGUGAAGCCAAAGCCCAUUGCAGAUGCAAAGGCUCCUGAGAAGCGGGCCUCACCAUCCAAGCCAGCUUCUGCCCCAGCCUCCAGAUCUGGGUCCAAGAGCACUCAGACUGUUGCAAAAACCACAACAGCUGCUGCUGUUGCCUCAACUGGCCCAAGCAGUAGGAGCCCCUCCACGCUCCUGCCCAAGAAGCCCACUGCCAUUAAGACUGAGGGAAAACCUGCAGAAGUCAAGAAGAUGACUGCAAAGUCUGUACCAGCUGACUUGAGUCGCCCAAAGAGCACCUCCACCAGUUCCAUGAAGAAAACCACCACUCUCAGUGGGACAGCCCCCGCUGCAGGGGUGGUUCCCAGCCGAGUCAAGGCCACACCCAUGCCCUCCCGGCCCUCCACAACUCCUUUCAUAGACAAGAAGCCCACCUCGGCCAAACCCAGCUCCACCACCCCCCGGCUCAGCCGCCUGGCCACCAAUACUUCUGCUCCUGAUCUGAAGAAUGUCCGCUCCAAGGUUGGCUCCACGGAAAACAUCAAGCAUCAGCCUGGAGGAGGCCGGGCCAAAGUAGAGAAAAAAACAGAGGCAGCUGCUACAACCCGAAAGCCUGAAUCUAAUGCAGUCACUAAAACAGCCGGCCCAAUUGCAAGUGCACAGAAACAACCUGCGGGGAAAGUCCAGAUAGUCUCCAAAAAAGUGAGCUACAGCCAUAUUCAGUCCAAGUGUGGUUCCAAGGACAAUAUUAAGCAUGUCCCUGGAGGUGGUAAUGUUCAGAUUCAGAACAAGAAAGUGGACAUCUCUAAGGUCUCCUCCAAGUGUGGGUCUAAGGCUAACAUCAAGCACAAGCCUGGUGGAGGAGAUGUCAAGAUUGAAAGUCAGAAGUUGAACUUCAAGGAGAAGGCCCAGGCCAAGGUGGGAUCCCUCGAUAAUGUGGGCCACCUACCUGCAGGAGGUGCUGUGAAGACUGAGGGCGGUGGCAGCGAGGCUCCUCUGUGUCCGGGUCCCCCUGCUGGGGAGGAGCCGGCCAUCUCUGAGGCAGCGCCUGAAGCUGGCGCCCCCACUUCAGCCAGUGGCCUCAAUGGCCACCCCACCCUGUCAGGGGGUGGUGACCAAAGGGAGGCCCAGACCUUGGACAGCCAGAUCCAGGAGACAAGCAUCUAAUGAUGACAUUCUGGUCUCGUCUUCCGUCUCCCCCGUGUUCCCCUCUUGUCUCCCCUGUUCCCCUCUCCCUUCCCUCCUCCCAUGUCACUGCAGAUUGAGACCUACAGGCUGACGUUCCGGGCAAAUGCCAGGGCCCGCACCGACCACGGGGCCGACAUUGUCUCCCGCCCCCCACACUUCCCUGGCGGCCCCAACUCGGGCUCCCGGGUCCUUGGCCCCCUUUCCCGGGCUGUCCACUAGACCAGUGAGCGCUUGGGCGCCGUGCUGGGCAGCCCGCUAGGCUCGCCUUCCCUCCUGCUUUGCGUGCCCGGGGCAGCAGCAGCCCUGCCCCACACCUCCUCUCACUCCCCAGCCUGGGCCCAUCUCCCUGCUUUGGUCUUGCCCCAUCACUGCGCCACUGCUCCGUGGAGGAGGUUGGGAGGGGGUUGGGGUGGUUGAGGCUAAGUUGGGAUCUAGGAGAGGAGAACCAGAUUCUAUCCUCAUCUUUUUUUGGUUCUUUGGUCCAAACCCAAAAGAAACUGACAUGCCCUCCCUUCUCCCUGGAUCUACCUGGAGGGAAGAGUGGAGGUGGAUUCCGAGUGGUGACAGGACGCUGACCGUGGAGCUUAAGCCACUGCCUCUCCCUCUGGUCCCACAAAUGGGCGCCCCCCCCUCCCCAUGCAGGUGGUGUCGGGCCCUUCUUGCUGCCCUGCCCCAAGUUGGGGGUCAGUGCUGCCUGUCCCCAUGCUUAACAUACCCGCCUAGCUGCUGUCACAUUUUUCUUGUUUUGUCCUUUUAUUUUUUUCUAAUAACCUAAAAACUGGCAAAAUAGUUCUGCAGGUUGAAGCCAUGUCUACAUGAAAGUCCUCAGUAAGUGUUAGAGGGAACAGGGCGGAGAUAUCCUUAUGCCACCCCCGCUGGAGGAUGUGGGCAGCUUAGGGCCCUGGAGGCGGUGCGGCAGGGAAGAGGGGUGCAGAGGCUGUGGCUGGUGAGCCGGUCAGGCACACAAGGGGCCCUUGGAGCGUGGACUGGUUGGUUUUGCCAUUUUGUUGUGUGUAUGCUGCUUUUCUUUUCUAACCAAGAGGCUGGUUUUGGCAUCUCUGUCCCAUUCCCUGGGAUCUGGUGGUCAGCCCUAGGAUAAAAAGCCAGGGCUGGAGAACAAGAAAGGGCCAGGAGAUGGAAUUCCUUCAGGCCGGCACCCACACCCUAGGACAUGUAAGCCCUCAUGUCCAAGGGAGCCUCAUGCAGAUAGUAGGAAAUCAGGUCUGGAAAUUUAAAAAUAAAAGGCAUGAGACUAAGGCUAUCUGCUUCCCUUAUGCCCUGACUGGAGAGGGGAGGGAGGAGAGGCAAGGCCCACAGAGGGCAUCCCAGCUAGGCCUUGGGAUGGCUGCAGUGAGGAGAAAUCCCGGGAACUGUAUUGACACAAAGAUUCUUAUUGCACUUGUAUUUUUUGUAUUAAAGUUUGCAUGGUUUCUAAUAAAGGAUUCAAACAUAAGUUUGUAGUGAAAUGGCCUGGGAGAUUCCAAGGGCUUCUCUGGAGGG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2080.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2181.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 1502.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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