Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001384961.1
Sequence Length
4486 nt
GC Content
0.5867
AGUUUCGUGCAGAGCGCGGAGGAGCCGCGAGCGCUGAGGGUGAGUGCCGGGAGCUCUGAGGGAGUCUGCACUAUGGAAACAACCUGUCAAUCCAGCUCAAGGCACACAUAGCCCAGACACCCAUGAGACCCUCUCCGUGGGGACCCUAGAGCACCUAUCAUGAACGAGGAGACCAAGGCUGGCUCCUCAUGGACCCCGUUGGCCUCCAGCUCGGCAACAAGAACCUGUGGAGCUGUCUUGUGAGGCUGCUCACCAAAGACCCAGAAUGGCUGAACGCCAAGAUGAAGUUCUUCCUCCCCAACACGGACCUGGAUUCCAGGAACGAGACCUUGGACCCUGAACAGAGAGUCAUCCUGCAACUCAACAAGCUGCAUGUCCAGGGUUCGGACACCUGGCAGUCUUUCAUUCAUUGUGUGUGCAUGCAGCUGGAGGUGCCUCUGGACCUGGAGGUGCUGCUGCUGAGUACUUUUGGCUAUGAUGAUGGGUUCACCAGCCAGCUGGGAGCUGAGGGGAAAAGCCAACCUGAAUCUCAGCUCCACCAUGGCCUGAAGCGCCCACAUCAGAGCUGUGGGUCCUCACCCCGCCGGAAGCAGUGCAAGAAGCAGCAGCUAGAGUUGGCCAAGAAGUACCUGCAGCUCCUGCGGACCUCUGCCCAGCAGCGCUACAGGAGCCAAAUCCCUGGGUCAGGGCAGCCCCACGCCUUCCACCAGGUCUAUGUCCCUCCAAUCCUGCGCCGGGCCACAGCAUCCUUAGACACUCCGGAGGGGGCCAUUAUGGGGGACGUCAAGGUGGAAGAUGGUGCUGACGUGAGCAUCUCGGACCUCUUCAACACCAGGGUUAACAAGGGCCCGAGGGUGACCGUGCUUUUGGGGAAGGCUGGCAUGGGCAAGACCACGCUGGCCCACCGGCUCUGCCAGAAGUGGGCAGAGGGCCAUCUGAACUGUUUCCAGGCCCUGUUCCUUUUUGAAUUCCGCCAGCUCAACUUGAUCACGAGGUUCCUGACACCGUCCGAGCUCCUUUUUGAUCUGUACCUGAGCCCUGAAUCGGACCACGACACUGUCUUCCAGUACCUGGAGAAGAACGCUGACCAAGUCCUGCUGAUCUUUGAUGGGCUAGAUGAGGCCCUCCAGCCUAUGGGUCCUGAUGGCCCAGGCCCAGUCCUCACCCUUUUCUCCCAUCUCUGCAAUGGGACCCUCCUGCCUGGCUGCCGGGUGAUGGCUACCUCCCGUCCAGGGAAGCUGCCUGCCUGCCUGCCUGCAGAGGCAGCCAUGGUCCACAUGUUGGGCUUUGAUGGGCCACGGGUGGAAGAAUAUGUGAAUCACUUCUUCAGCGCCCAGCCAUCGCGGGAGGGGGCCCUGGUGGAGUUACAGACAAAUGGACGUCUCCGAAGCCUGUGUGCGGUGCCCGCACUGUGCCAAGUCGCCUGUCUCUGCCUCCACCAUCUGCUUCCUGACCACGCCCCAGGCCAGUCUGUGGCCCUCCUGCCCAACAUGACUCAGCUCUAUAUGCAGAUGGUGCUCGCCCUCAGCCCCCCUGGGCACUUGCCCACCUCGUCCCUACUGGACCUGGGGGAGGUGGCCCUGAGGGGCCUGGAGACAGGGAAGGUUAUCUUCUAUGCAAAAGAUAUUGCUCCACCCUUGAUAGCUUUUGGGGCCACUCACAGCCUGCUGACUUCCUUCUGCGUCUGCACAGGCCCUGGGCACCAGCAGACAGGCUAUGCUUUCACCCACCUCAGCCUGCAGGAGUUUCUUGCUGCCCUGCACCUGAUGGCCAGCCCCAAGGUGAACAAAGACACACUUACCCAGUAUGUUACCCUCCAUUCCCGCUGGGUACAGCGGACCAAAGCUAGACUGGGCCUCUCAGACCACCUCCCCACCUUCCUGGCGGGCCUGGCAUCCUGCACCUGCCGCCCCUUCCUUAGCCACCUGGCGCAGGGCAAUGAGGACUGUGUGGGUGCCAAGCAGGCUGCUGUAGUGCAGGUGUUGAAGAAGUUGGCCACCCGCAAGCUCACAGGGCCAAAGGUUGUAGAGCUGUGUCACUGUGUGGAUGAGACACAGGAGCCUGAGCUGGCCAGUCUCACCGCACAAAGCCUCCCCUAUCAACUGCCCUUCCACAAUUUCCCACUGACCUGCACCGACCUGGCCACCCUGACCAACAUCCUAGAGCACAGGGAGGCCCCCAUCCACCUGGAUUUUGAUGGCUGUCCCCUGGAGCCCCACUGCCCUGAGGCUCUGGUAGGCUGUGGGCAGAUAGAGAAUCUCAGCUUUAAGAGCAGGAAGUGUGGGGAUGCCUUUGCAGAAGCCCUCUCCAGGAGCUUGCCGACAAUGGGGAGGCUGCAGAUGCUGGGGUUAGCAGGAAGUAAAAUCACUGCCCGAGGCAUCAGCCACCUGGUGAAAGCUUUGCCUCUCUGUCCACAGCUGAAAGAAGUCAGUUUUCGGGACAACCAGCUCAGUGACCAGGUGGUGCUGAACAUUGUGGAGGUUCUCCCUCACCUACCACGGCUCCGGAAGCUUGACCUGAGCAGCAACAGCAUCUGCGUGUCAACCCUACUCUGCUUGGCAAGGGUGGCAGUCACGUGUCCUACCGUCAGGAUGCUUCAGGCCAGGGAGGCGGACCUCAUCUUCCUUCUUUCCCCGCCCACAGAGACAACUGCAGAGCUACAAAGAGCUCCAGACCUGCAGGAAAGUGACGGCCAGAGGAAAGGGGCUCAGAGCAGAAGCUUGACGCUCAGGCUGCAGAAGUGUCAGCUCCAGGUCCACGAUGCGGAGGCCCUCAUAGCCCUGCUCCAGGAAGGCCCUCACCUGGAGGAAGUGGACCUCUCAGGGAACCAGCUGGAAGAUGAAGGCUGUCGGCUGAUGGCAGAGGCUGCAUCCCAGCUGCACAUCGCCAGGAAGCUGGACCUCAGUAACAACGGGCUUUCUGUGGCCGGGGUGCAUUGUGUGCUGAGGGCCGUGAGUGCGUGCUGGACCCUGGCAGAGCUGCACAUCAGCCUGCAGCACAAAACUGUGAUCUUCAUGUUUGCCCAGGAGCCAGAGGAGCAGAAGGGGCCCCAGGAGAGGGCUGCAUUUCUUGACAGCCUCAUGCUCCAGAUGCCCUCUGAGCUGCCUCUGAGCUCCCGAAGGAUGAGGCUGACACAUUGUGGCCUCCAAGAAAAGCACCUAGAGCAGCUCUGCAAGGCUCUGGGAGGAAGCUGCCACCUCGGUCACCUCCACCUCGACUUCUCAGGCAAUGCUCUGGGGGAUGAAGGUGCAGCCCGGCUGGCUCAGCUGCUCCCAGGGCUGGGAGCUCUGCAGUCCUUGAACCUCAGUGAGAACGGUUUGUCCCUGGAUGCCGUGUUGGGUUUGGUUCGGUGCUUCUCCACUCUGCAGUGGCUCUUCCGCUUGGACAUCAGCUUUGAAAGCCAACACAUCCUCCUGAGAGGGGACAAGACAAGCAGGGAUAUGUGGGCCACUGGAUCUUUGCCAGACUUCCCAGCUGCAGCCAAGUUCUUAGGGUUCCGUCAGCGCUGCAUCCCCAGGAGCCUCUGCCUCAGUGAGUGUCCUCUGGAGCCCCCAAGCCUCACCCGCCUCUGUGCCACUCUGAAGGACUGCCCGGGACCCCUGGAACUGCAAUUGUCCUGUGAGUUCCUGAGUGACCAGAGCCUGGAGACUCUACUGGACUGCUUACCUCAACUCCCUCAGCUGAGCCUGCUGCAGCUGAGCCAGACGGGACUGUCCCCGAAAAGCCCCUUCCUGCUGGCCAACACCUUAAGCCUGUGUCCACGGGUUAAAAAGGUGGAUCUCAGGUCCCUGCACCAUGCAACUUUGCACUUCAGAUCCAACGAGGAGGAGGAAGGCGUGUGCUGUGGCAGGUUCACAGGCUGCAGCCUCAGCCAGGAGCACGUAGAGUCACUCUGCUGGUUGCUGAGCAAGUGUAAAGACCUCAGCCAGGUGGAUCUCUCAGCAAACCUGCUGGGCGACAGCGGACUCAGAUGCCUUCUGGAAUGUCUGCCGCAGGUGCCCAUCUCCGGUUUGCUUGAUCUGAGUCACAACAGCAUUUCUCAGGAAAGUGCCCUGUACCUGCUGGAGACACUGCCCUCCUGCCCACGUGUCCGGGAGGCCUCAGUGAACCUGGGCUCUGAGCAGAGCUUCCGGAUUCACUUCUCCAGAGAGGACCAGGCUGGGAAGACACUCAGGCUAAGUGAGUGCAGCUUCCGGCCAGAGCACGUGUCCAGGCUGGCCACCGGCUUGAGCAAGUCCCUGCAGCUGACGGAGCUCACGCUGACCCAGUGCUGCCUGGGCCAGAAGCAGCUGGCCAUCCUCCUGAGCUUGGUGGGGCGACCCGCAGGGCUGUUCAGCCUCAGAGACUCCACAAGGCACACAGAGAAACUGUCCUUCCCCACACUGGAGGCCUGUGCUUUGGGAUUUAAGAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGGUUUCAGAGGAUACUGAACUGAGGACAAAAAUAAACUGAAACGAAGUUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1838.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1916.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 949.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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