Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001385666.1
Sequence Length
637 nt
GC Content
0.5306
ACUAUAAAUAGCAGCCACCUCUCCCUGGCAGACAGGGACCCGCAGCUCAGCUACAGCACAGAUCAGUUAUCCUGGGGCAUACAGCCAUACCAUUCUGAAGGUGUCUUAUCUCCUCUGAUCUAGAGAGCACCAUGAAGCUUCUCACGGGCCUGGUUUUCUGCUCCUUGGUCCUGAGUGUCAGCAGCCGAAGCUUCUUUUCGUUCCUUGGCGAGGCUUUUGAUGGGGCUCGGGACAUGUGGAGAGCCUACUCUGACAUGAGAGAAGCCAAUUACAUCGGCUCAGACAAAUACUUCCAUGCUCGGGGGAACUAUGAUGCUGCCAAAAGGGGACCUGGGGGUGCCUGGGCUGCAGAAGUGAUCAGCAAUGCCAGAGAGAAUAUCCAGAGACUCACAGGCCGUGGUGCGGAGGACUCGCUGGCCGAUCAGGCUGCCAAUAAAUGGGGCAGGAGUGGCAGAGACCCCAAUCACUUCCGACCUGCUGGCCUGCCUGAGAAAUACUGAGCUUCCUCUUCACUCUGCUCUCAGGAGACCUGGCUAUGAGGCCCUCGGGGCAGGGAUACAAAGUUAGUGAGGUCUAUGUCCAGAGAAGCUGAGAUAUGGCAUAUAAUAGGCAUCUAAUAAAUGCUUAAGAGGUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-220.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -233.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 156.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..............(((((((((((((.....)))))((((.(((.((..((.(((((((....((((.((((.((((((......(((((........)))))........(((((...))))).((.((.(((......))).))))..((((((((((......(((((((((.(((.((...((((((((...(((.....))).)))))))))).))).)))))))))..))))))))))..((((......)))).((((.........))))...............)))))).)))))))).)).))))).....))..)).))).)))).((((((..(((((.((((...........((((.(((..((.((...(((((((((((((((.((((((..((.(((.(((.((..(((.(((.....))))))..)).)))))).))..)).......))))))).)).))))))..)))).....))))..)))))))))))))))).))))))((((((.((((((...((((......))))...))....)))).))))))((((((((.....))).)))))(((((.((.(((....))).)).)))))..))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..............(((((((((((((.....))))){(((.(((,((..{,.{{(((,,.,{,((((.((((.((((((...,..,{{{{..,,,,..|||||{,,,{{..,{{{|,,.,})))|{|}||.,,..,.{{{|||{||||..((((((((((......(((((((((.(((.((,..{(((((({...{{{.....,)),)))))))))).))).)))))))))..))))))))))..{|||,...,})))).{(((.........))))}}}}...........)))))).)))))))).)}.)))))|,...,)},)}.))).)))).((((((..((((,,((((........,,.((((.(((..{{{((,..(((((((((((((((.((((((..((.(({{(({.((..(((.(({.....})})))..)).}))))).)}..}}.....}}))))))).)).))))))..))))...,.)))}..)))))))))))))))).))))))((((((.(((({,..,((({...,,,})))...},....)))).)))))){(((((((.....))).)))))|||{{.,,.((({{{{,,,.,,.)))))},))))))))..
Back