Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001385669.1

Sequence Length

384 nt

GC Content

0.5130

ACUAUAAAUAGCAGCCACCUCUCCCUGGCAGACAGGGACCCGCAGCUCAGCUACAGCACAGAUCAGCACCAUGAAGCUUCUCACGGGCCUGGUUUUCUGCUCCUUGGUCCUGAGUGUCAGCAGCCGAAGCUUCUUUUCGUUCCUUGGCGAGGCUUUUGAUGGGGCUCGGGACAUGUGGAGAGCCUACUCUGACAUGAGAGAAGCCAAUUACAUCGGCUCAGACAAAUACUUCCAUGCUCGGGGGAACUAUGAUGCUGCCAAAAGGGGACCUGGGGGUGCCUGGGCUGCAGAAGUGAUCAGGGAUACAAAGUUAGUGAGGUCUAUGUCCAGAGAAGCUGAGAUAUGGCAUAUAAUAGGCAUCUAAUAAAUGCUUAAGAGGUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-131.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -138.16

Frequency: 0.0000

Diversity: 67.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..............(((((((((((((((((.((((.((((.(((.((.((....))......(((((.(((..((.(((((.(((((..((((((((((......(((((((((.(((.((...((((((((...(((.....))).)))))))))).))).)))))))))..))))))))))..((((......)))).((((.........)))).................))))).)))))))))).)))))((....)).)).))).)))).))))..)))).........)))))................(.((((((((((.....))).))))))))......(((((((.......)))))))))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..............(((((((((((((((((.((((.((((.(((.((.((....}}......(((((.(((,.{(.(((((.(((((.((({{{((((((((...(((((((((.(((.((,..{(((((((...{{{.....,)),)))))))))).))).)))))))))..,.)))),,,,..((({.....,)))).((((.........))))}}}}..,......))).))))),)))),))))).)))))((....}),)).))).)))).))))..)))).........))))),..........,|,..(,((((((((((.....))).)))))))).,....(((((((.......)))))))})))))))..