Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001385671.1
Sequence Length
481 nt
GC Content
0.5385
ACUAUAAAUAGCAGCCACCUCUCCCUGGCAGACAGGGACCCGCAGCUCAGCUACAGCACAGAUCAGGGGCUCGGGACAUGUGGAGAGCCUACUCUGACAUGAGAGAAGCCAAUUACAUCGGCUCAGACAAAUACUUCCAUGCUCGGGGGAACUAUGAUGCUGCCAAAAGGGGACCUGGGGGUGCCUGGGCUGCAGAAGUGAUCAGCAAUGCCAGAGAGAAUAUCCAGAGACUCACAGGCCGUGGUGCGGAGGACUCGCUGGCCGAUCAGGCUGCCAAUAAAUGGGGCAGGAGUGGCAGAGACCCCAAUCACUUCCGACCUGCUGGCCUGCCUGAGAAAUACUGAGCUUCCUCUUCACUCUGCUCUCAGGAGACCUGGCUAUGAGGCCCUCGGGGCAGGGAUACAAAGUUAGUGAGGUCUAUGUCCAGAGAAGCUGAGAUAUGGCAUAUAAUAGGCAUCUAAUAAAUGCUUAAGAGGUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-164.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 138.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..............(((((((((((((.....)))))((((.(((.((..((.(((((((.........((((((.((((.((((......((((......)))).((((.........))))..........)))))))))))))).......)).))))).....))..)).))).)))).((((((..(((((.((((...........((((.(((..((.((...(((((((((((((((.((((((..((.(((.(((.((..(((.(((.....))))))..)).)))))).))..)).......))))))).)).))))))..)))).....))))..)))))))))))))))).))))))((((((.((((((...((((......))))...))....)))).))))))((((((((.....))).)))))(((((.((.(((....))).)).)))))..))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..............(((((((((((((.....)))))|((({{(({((.,,,.,.{{{,...{{{,|||(((|||.((((,{{{(||.,..||||.|}}}},},|.{(((.........)))),.........|||||}}},}})))},..||.}},}}})}{{....}}|},|))),|})).((((((..((((,,((((...,....,,,((((.(((..{{{((,..(((((((((((((((.((((((..((.(({{(({.((..(((.(({.....})})))..)).}))))).)}..}}.....}}))))))).)).))))))..))))...,.)))}..)))))))))))))))).))))))((((((.(((({,..,((({...,,,))})...}}....)))).)))))}{{{{||{|.,..,))),)}}})}}|||....(((((((.......))))))}))))))))..
Back