Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001385725.1
Sequence Length
560 nt
GC Content
0.6196
AAGAGGCCUCAAAGAAAGAGCUGCGGUGCAGGAAUUCGUGUGCCGGAUUUGGUUAGCUGAGCCCACCGAGAGGGGCAGGGCUGAUCCAGCUGUGGGUCUCUUGGUUCCCUCUUUCAGCGCCUGCAGGAUGAAAGCUCUCUGUCUCCUCCUCCUCCCUGUCCUGGGGCUGUUGGUGUCUAGCAAGACCCUGUGCUCCAUGGAAGAAGCCAUCAAUGAGAGGAUCCAGGAGGUCGCCGGCUCCCUAAUAUUUAGGGCAAUAAGCAGCAUUGGCCUGGAGUGCCAGAGCGUCACCUCCAGGGGGGACCUGGCUACUUGCCCCCGAGGCUUCGCCGUCACCGGCUGCACUUGUGGCUCCGCCUGUGGCUCGUGGGAUGUGCGCGCCGAGACCACAUGUCACUGCCAGUGCGCGGGCAUGGACUGGACCGGAGCGCGCUGCUGUCGUGUGCAGCCCUGAGGUCGCGCGCAGCGCGUGCACAGCGCGGGCGGAGGCGGCUCCAGGUCCGGAGGGGUUGCGGGGGAGCUGGAAAUAAACCUGGAGAUGAUGAUGAUGAUGAUGAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-239.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -248.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 177.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((...(..((.(((((((((((.(....).))))))......((((((((..((((........))))..)))))))).(((((.(.(((((((((.((((((.....((....))((((.((..((.....)).)).)))).....((.(((((((((....((.((((....))))))...)))))).)))))...........))).))).)))))))).).))))))((((((...))))))......))))).))..)...))).)))....(((((.(((((((.(((....(((.....))))))(((((...))).)).((((((.(.((((((((((((((((((((..((((.(((((..(.....)..))))).)))).))).....)))))).....((((((((((((.((((.(((((((((((.(((....))).))))))..(((((.....)))))))))).))))))))).))))))).)))))))))))).)))))).......))))))).)))))................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,((((({...,..({,(((((((((((.(....).)))))),.....((((((((..((((........))))..)))))))))||||{.||||||||{((.({{{((.,,{,,{,.,,||((((.{{.{((,,,,,|},}|,}|||||..,{{,(((((((((....((.((((....))))))...)))))).))).|..||,.,....)}),))).)))))}}||}.|}}|||(((((,...})))))......))})).))..}|},))).)))....{{{{{.{|||{((((((.,..(,,..,..)))))){{{((,,,|||,|}.((({((,(.(({{((((((({(((((((({{((({,,,{{{,.|,..},).))))),|}|,}.|||,,,,,,}})))}.,},|,((((((((((.((((.(((((((((((.(((....))).)))))).,((({{.....)))))))))).))))))))).))))))),))))}})))))),))))}}.......))))})).))}))|..,............
Back