Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001386303.1

Sequence Length

1633 nt

GC Content

0.4942

AGUUUUCAGGCGGAUUGCCUCAGAUCACACUAUCUCCACUUGCCCAGCCCUGUGGAAGAUUAGCGGCCAUGUAUUCCAAUGUGAUAGGAACUCCUGCCUUCCACAUCUCCCUUGGUGCCGCUGCUUCUCUCCGGCUUUGCACCUCUGUUCUUGAAAGGGCUGCAGAACUGGACUCAGACCACGCAAGAAGGAAGGUUUAUCUUUUGUCCUUGCUGCUCAUUGGCUUCUGGGACUGCGUGACCUGUCACGGGAGCCCUGUGGACAUCUGCACAGCCAAGCCGCGGGACAUUCCCAUGAAUCCCAUGUGCAUUUACCGCUCCCCGGAGAAGAAGGCAACUGAGGAUGAGGGCUCAGAACAGAAGAUCCCGGAGGCCACCAACCGGCGUGUCUGGGAACUGUCCAAGGCCAAUUCCCGCUUUGCUACCACUUUCUAUCAGCACCUGGCAGAUUCCAAGAAUGACAAUGAUAACAUUUUCCUGUCACCCCUGAGUAUCUCCACGGCUUUUGCUAUGACCAAGCUGGGUGCCUGUAAUGACACCCUCCAGCAACUGAUGGAGGUAUUUAAGUUUGACACCAUAUCUGAGAAAACAUCUGAUCAGAUCCACUUCUUCUUUGCCAAACUGAACUGCCGACUCUAUCGAAAAGCCAACAAAUCCUCCAAGUUAGUAUCAGCCAAUCGCCUUUUUGGAGACAAAUCCCUUACCUUCAAUGAGACCUACCAGGACAUCAGUGAGUUGGUAUAUGGAGCCAAGCUCCAGCCCCUGGACUUCAAGGAAAAUGCAGAGCAAUCCAGAGCGGCCAUCAACAAAUGGGUGUCCAAUAAGACCGAAGGCCGAAUCACCGAUGUCAUUCCCUCGGAAGCCAUCAAUGAGCUCACUGUUCUGGUGCUGGUUAACACCAUUUACUUCAAGGGCCUGUGGAAGUCAAAGUUCAGCCCUGAGAACACAAGGAAGGAACUGUUCUACAAGGCUGAUGGAGAGUCGUGUUCAGCAUCUAUGAUGUACCAGGAAGGCAAGUUCCGUUAUCGGCGCGUGGCUGAAGGCACCCAGGUGCUUGAGUUGCCCUUCAAAGGUGAUGACAUCACCAUGGUCCUCAUCUUGCCCAAGCCUGAGAAGAGCCUGGCCAAGGUAGAGAAGGAACUCACCCCAGAGGUGCUGCAAGAGUGGCUGGAUGAAUUGGAGGAGAUGAUGCUGGUGGUCCACAUGCCCCGCUUCCGCAUUGAGGACGGCUUCAGUUUGAAGGAGCAGCUGCAAGACAUGGGCCUUGUCGAUCUGUUCAGCCCUGAAAAGUCCAAACUCCCAGGUAUUGUUGCAGAAGGCCGAGAUGACCUCUAUGUCUCAGAUGCAUUCCAUAAGGCAUUUCUUGAGGUAAAUGAAGAAGGCAGUGAAGCAGCUGCAAGUACCGCUGUUGUGAUUGCUGGCCGUUCGCUAAACCCCAACAGGGUGACUUUCAAGGCCAACAGGCCUUUCCUGGUUUUUAUAAGAGAAGUUCCUCUGAACACUAUUAUCUUCAUGGGCAGAGUAGCCAACCCUUGUGUUAAGUAAAAUGUUCUUAUUCUUUGCACCUCUUCCUAUUUUUGGUUUGUGAACAGAAGUAAAAAUAAAUACAAACUACUUCCAUCUCACAUUAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-515.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -545.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 314.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((.(((((((.(((...(((((((..((((((((..((...))...)))).))))((((((.......((((.........)))).((((((((((..(((...(((((((((((((((((((.(((((.((((((.((((.........)))).)))))).)))))..(((..((((((.((((((.......))))))(((((.(..(((....)))..).)))))))))))..)))....((((((...(((((....((((((.......((.((((...)))).)).......))))))))))).))))))(((((((((((....(((((((((....((((((((((....(((((((.((..((....)).)).))))))).)))).((((((........)))))).........(((.((((...)))).)))..........((.((((....)))).)).(((((..(.(((((((((((((((...(((((........(..(((((.(......).)))))..))))))))).)))))))))))).)..))))).....))))))....)))))..)))).....))))))))))).(((((((((..((((.(((.((((..((((((.((..((((((((....((.(((((((.((((((((((((........................((((((((((((((...((((((.(((...((((((...))))))))).(((((.(((............)))...)))))..(((((.((......(((....)))........)).)))))..(((..((((.(.((((...))))).))))..)))))))))))))))))))..))))(((((.(((..(((((..(((((((((((.....(((((...(((.........)))...))))).)))))).)))))..)))))))).)))))..(((((...))))).)))))))))).(((((((((.(((((.....))))).)))..(((((((..((.((((((.......))))))..)).)))).)))..(((((((((.(((.((((....)).)).))).)))))).)))..))))))((((.....))))......)).)))))))))...))))))))..)).))..((.(((......))))))))).)).)).)))..))))))))))))).)))))))))((((((((((((((((......(((((.(((.((((...(((....)))..))))..)))..))))))))))(((.....))))))))))....))))........))))))....))))...)))..)))))))).)).((....)).....)))))).)))))))...))).)))))))..((((.....))))((((...((((((....))))))....))))......((((......))))))).))).........(((((.((((............((((.(((...............))).)))))))).))))).((((...(((((...((((((...............))))))....)))))...))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,({.{({{(((((({.||(,..{{{{{{,,,{{((({((..({...||,,,||||,,}}|,{(((({{{.{{{,(((.........))}}.((((((((((..(((.,.(((((((((((((((((((.(((((.((((((.((((.........)))).)))))).)))))..(((..((((((.{{{(((,,.....})))))(((((.{..(((....)))..).)))))))))))..)))....((((((...(((((....((((((.......((.((((...}))).)).......))))))))))).))))))(((((((((((,...(((((((((....((((((,{{(.,,.(((((((.((,.((....)).)).))))))).))}}.((((((........)))))).........{((.(({(,..}}}),})),....,|,,,({.{{{(....)))).)}.(((((..{.(((((((((((((((...(((((..,.....{..(((((.(......).))))),,,)))))))).)))))))))))).)..))))).....))))))....)))))..))))...,.))))))))))).(((((((((..((((.(((.,{((..,(((,,.((..((((((((.{{,,{.(((((((.((((((((((((..,.......,,,.........},|{{{{((((((((,..{((((((((((...((((((...))))))}}}.(((((,{{{..,,....,,|.}})...)))))..(((((.((......,{({,.,},,.....,},)).)))))..,{,..((((.,.((((...))))}.))))..},))))))))))))))))|,,|}},{((((.(({..(((((..(((((((((({.....(((((...(((.......,.)))...))))),)))))),,))))..)))))})).))))),,|{{{{...))))).)))))))))).{(({((,...{{(((,....}}}}},{((((,,.,|}|}}|{|{{|||{,{||...((((({...))))))..,,..(((((((((.(((.((((....)).)).))).)))))).))),,)))))){{{{.....)))),,....)).)))))))}),,.))))))))..)).})},((.(((......)))))))}}.}).}}.)))..))))))))))))).))))))))){(((((((((((((((......(((((.(((.((((...(((....)))..))))..}))..))))))))))(((.....))))))))))....)))}........))))))....))))...)))..)))))))).)),(((((.|,.....}.)))))))}))}),,,))),)))})))..{{{{,..,,))))((((...((((((....))))))....)))}......{{{{..,.,.})))}}}.}},.........,||||,||||,||{,,......((({.{((,,,,,,,....}}},})).))))}}}}.}}}},..,||,..(((((...((((((...............))))))....)))))...,,,.