Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001386501.1
Sequence Length
8612 nt
GC Content
0.5230
GCUCCCGGCUUAGAGGACAGCGGGGAAGGCGGGCGGUGGGGCAGGGGGCCUGAAGCGGCGGUACCGGUGCUGGCGGCGGCAGCUGAGGCCUUGGCCGAAGCCGCGCGAACCUCAGGGCAAGAUGCUUGGAACCGGACCUGCCGCCGCCACCACCGCUGCCACCACAUCUAGCAAUGUGAGCGUCCUGCAGCAGUUUGCCAGUGGCCUAAAGAGCCGGAAUGAGGAAACCAGGGCCAAAGCCGCCAAGGAGCUCCAGCACUAUGUCACCAUGGAACUCCGAGAGAUGAGUCAAGAGGAGUCUACUCGCUUCUAUGACCAACUGAACCAUCACAUUUUUGAAUUGGUUUCCAGCUCAGAUGCCAAUGAGAGGAAAGGUGGCAUCUUGGCCAUAGCUAGCCUCAUAGGAGUGGAAGGUGGGAAUGCCACCCGAAUUGGCAGAUUUGCCAACUAUCUUCGGAACCUCCUCCCCUCCAAUGACCCAGUUGUCAUGGAAAUGGCAUCCAAGGCCAUUGGCCGUCUUGCCAUGGCAGGGGACACUUUUACCGCUGAGUACGUGGAAUUUGAGGUGAAGCGAGCCCUGGAAUGGCUGGGUGCUGACCGCAAUGAGGGCCGGAGACAUGCAGCUGUCCUGGUUCUCCGUGAGCUGGCCAUCAGCGUCCCUACCUUCUUCUUCCAGCAAGUGCAACCCUUCUUUGACAACAUUUUUGUGGCCGUGUGGGACCCCAAACAGGCCAUCCGUGAGGGAGCUGUAGCCGCCCUUCGUGCCUGUCUGAUUCUCACAACCCAGCGUGAGCCGAAGGAGAUGCAGAAGCCUCAGUGGUACAGGCACACAUUUGAAGAAGCAGAGAAGGGAUUUGAUGAGACCUUGGCCAAAGAGAAGGGCAUGAAUCGGGAUGAUCGGAUCCAUGGAGCCUUGUUGAUCCUUAACGAGCUGGUCCGAAUCAGCAGCAUGGAGGGAGAGCGUCUGAGAGAAGAAAUGGAAGAAAUCACACAGCAGCAGCUGGUACACGACAAGUACUGCAAAGAUCUCAUGGGCUUCGGAACAAAACCUCGUCACAUUACCCCCUUCACCAGUUUCCAGGCUGUACAGCCCCAGCAGUCAAAUGCCUUGGUGGGGCUGCUGGGGUACAGCUCUCACCAAGGCCUCAUGGGAUUUGGGACCUCCCCCAGUCCAGCUAAGUCCACCCUGGUGGAGAGCCGGUGUUGCAGAGACUUGAUGGAGGAGAAAUUUGAUCAGAUACCCAGUAUCUCCAAGAUACCAUGAACCAUGUCCUAAGCUGUGUCAAGAAGGAGAAGGAACGUACAGCGGCCUUCCAAGCCCUGGGGCUACUUUCUGUGGCUGUGAGGUCUGAGUUUAAGGUCUAUUUGCCUCGCGUGCUGGACAUCAUCCGAGCGGCCCUGCCCCCAAAGGACUUCGCCCAUAAGAGGCAGAAGGCAAUGCAGGUGGAUGCCACAGUCUUCACUUGCAUCAGCAUGCUGGCUCGAGCAAUGGGGCCAGGCAUCCAGCAGGAUAUCAAGGAGCUGCUGGAGCCCAUGCUGGCAGUGGGACUAAGCCCUGCCCUCACUGCAGUGCUCUACGACCUGAGCCGUCAGAUUCCACAGCUAAAGAAGGACAUUCAAGAUGGGCUACUGAAAAUGCUGUCCCUGGUCCUUAUGCACAAACCCCUUCGCCACCCAGGCAUGCCCAAGGGCCUGGCCCAUCAGCUGGCCUCUCCUGGCCUCACGACCCUCCCUGAGGCCAGCGAUGUGGGCAGCAUCACUCUUGCCCUCCGAACGCUUGGCAGCUUUGAAUUUGAAGGCCACUCUCUGACCCAAUUUGUUCGCCACUGUGCGGAUCAUUUCCUGAACAGUGAGCACAAGGAGAUCCGCAUGGAGGCUGCCCGCACCUGCUCCCGCCUGCUCACACCCUCCAUCCACCUCAUCAGUGGCCAUGCUCAUGUGGUUAGCCAGACCGCAGUGCAAGUGGUGGCAGAUGUGCUUAGCAAACUGCUCGUAGUUGGGAUAACAGAUCCUGACCCUGACAUUCGCUACUGUGUCUUGGCGUCCCUGGACGAGCGCUUUGAUGCACACCUGGCCCAGGCGGAGAACUUGCAGGCCUUGUUUGUGGCUCUGAAUGACCAGGUGUUUGAGAUCCGGGAGCUGGCCAUCUGCACUGUGGGCCGACUCAGUAGCAUGAACCCUGCCUUUGUCAUGCCUUUCCUGCGCAAGAUGCUCAUCCAGAUUUUGACAGAGUUGGAGCACAGUGGGAUUGGAAGAAUCAAAGAGCAGAGUGCCCGCAUGCUGGGGCACCUGGUCUCCAAUGCCCCCCGACUCAUCCGCCCCUACAUGGAGCCUAUUCUGAAGGCAUUAAUUUUGAAACUGAAAGAUCCAGACCCUGAUCCAAACCCAGGUGUGAUCAAUAAUGUCCUGGCAACAAUAGGAGAAUUGGCACAGGUUAGUGGCCUGGAAAUGAGGAAAUGGGUUGAUGAACUUUUUAUUAUCAUCAUGGACAUGCUCCAGGAUUCCUCUUUGUUGGCCAAAAGGCAGGUGGCUCUGUGGACCCUGGGACAGUUGGUGGCCAGCACUGGCUAUGUAGUAGAGCCCUACAGGAAGUACCCUACUUUGCUUGAGGUGCUACUGAAUUUUCUGAAGACUGAGCAGAACCAGGGUACACGCAGAGAGGCCAUCCGUGUGUUAGGGCUUUUAGGGGCUUUGGAUCCUUACAAGCACAAAGUGAACAUUGGCAUGAUAGACCAGUCCCGGGAUGCCUCUGCUGUCAGCCUGUCAGAAUCCAAGUCAAGUCAGGAUUCCUCUGACUAUAGCACUAGUGAAAUGCUGGUCAACAUGGGAAACUUGCCUCUGGAUGAGUUCUACCCAGCUGUGUCCAUGGUGGCCCUGAUGCGGAUCUUCCGAGACCAGUCACUCUCUCAUCAUCACACCAUGGUUGUCCAGGCCAUCACCUUCAUCUUCAAGUCCCUGGGACUCAAAUGUGUGCAGUUCCUGCCCCAGGUCAUGCCCACGUUCCUUAACGUCAUUCGAGUCUGUGAUGGGGCCAUCCGGGAAUUUUUGUUCCAGCAGCUGGGAAUGUUGGUGUCCUUUGUGAAGAGCCACAUCAGACCUUAUAUGGAUGAAAUAGUCACCCUCAUGAGAGAAUUCUGGGUCAUGAACACCUCAAUUCAGAGCACGAUCAUUCUUCUCAUUGAGCAAAUUGUGGUAGCUCUUGGGGGUGAAUUUAAGCUCUACCUGCCCCAGCUGAUCCCACACAUGCUGCGUGUCUUCAUGCAUGACAACAGCCCAGGCCGCAUUGUCUCUAUCAAGUUACUGGCUGCAAUCCAGCUGUUUGGCGCCAACCUGGAUGACUACCUGCAUUUACUGCUGCCUCCUAUUGUUAAGUUGUUUGAUGCCCCUGAAGCUCCACUGCCAUCUCGAAAGGCAGCGCUAGAGACUGUGGACCGCCUGACGGAGUCCCUGGAUUUCACUGACUAUGCCUCCCGGAUCAUUCACCCUAUUGUUCGAACACUGGACCAGAGCCCAGAACUGCGCUCCACAGCCAUGGACACGCUGUCUUCACUUGUUUUUCAGCUGGGGAAGAAGUACCAAAUUUUCAUUCCAAUGGUGAAUAAAGUUCUGGUGCGACACCGAAUCAAUCAUCAGCGCUAUGAUGUGCUCAUCUGCAGAAUUGUCAAGGGAUACACACUUGCUGAUGAAGAGGAGGAUCCUUUGAUUUACCAGCAUCGGAUGCUUAGGAGUGGCCAAGGGGAUGCAUUGGCUAGUGGACCAGUGGAAACAGGACCCAUGAAGAAACUGCACGUCAGCACCAUCAACCUCCAAAAGGCCUGGGGCGCUGCCAGGAGGGUCUCCAAAGAUGACUGGCUGGAAUGGCUGAGACGGCUGAGCCUGGAGCUGCUGAAGGACUCAUCAUCGCCCUCCCUGCGCUCCUGCUGGGCCCUGGCACAGGCCUACAACCCGAUGGCCAGGGAUCUCUUCAAUGCUGCAUUUGUGUCCUGCUGGUCUGAACUGAAUGAAGAUCAACAGGAUGAGCUCAUCAGAAGCAUCGAGUUGGCCCUCACCUCACAAGACAUCGCUGAAGUCACACAGACCCUCUUAAACUUGGCUGAAUUCAUGGAACACAGUGACAAGGGCCCCCUGCCACUGAGAGAUGACAAUGGCAUUGUUCUGCUGGGUGAGAGAGCUGCCAAGUGCCGAGCAUAUGCCAAAGCACUACACUACAAAGAACUGGAGUUCCAGAAAGGCCCCACCCCUGCCAUUCUAGAAUCUCUCAUCAGCAUUAAUAAUAAGCUACAGCAGCCGGAGGCAGCGGCCGGAGUGUUAGAAUAUGCCAUGAAACACUUUGGAGAGCUGGAGAUCCAGGCUACCUGGUAUGAGAAACUGCACGAGUGGGAGGAUGCCCUUGUGGCCUAUGACAAGAAAAUGGACACCAACAAGGACGACCCAGAGCUGAUGCUGGGCCGCAUGCGCUGCCUCGAGGCCUUGGGGGAAUGGGGUCAACUCCACCAGCAGUGCUGUGAAAAGUGGACCCUGGUUAAUGAUGAGACCCAAGCCAAGAUGGCCCGGAUGGCUGCUGCAGCUGCAUGGGGUUUAGGUCAGUGGGACAGCAUGGAAGAAUACACCUGUAUGAUCCCUCGGGACACCCAUGAUGGGGCAUUUUAUAGAGCUGUGCUGGCACUGCAUCAGGACCUCUUCUCCUUGGCACAACAGUGCAUUGACAAGGCCAGGGACCUGCUGGAUGCUGAAUUAACUGCGAUGGCAGGAGAGAGUUACAGUCGGGCAUAUGGGGCCAUGGUUUCUUGCCACAUGCUGUCCGAGCUGGAGGAGGUUAUCCAGUACAAACUUGUCCCCGAGCGACGAGAGAUCAUCCGCCAGAUCUGGUGGGAGAGACUGCAGGGCUGCCAGCGUAUCGUAGAGGACUGGCAGAAAAUCCUUAUGGUGCGGUCCCUUGUGGUCAGCCCUCAUGAAGACAUGAGAACCUGGCUCAAGUAUGCAAGCCUGUGCGGCAAGAG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-3013.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3171.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 1851.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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