Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001386939.1
Sequence Length
6976 nt
GC Content
0.3799
AAAGUUAUUUGAUGUACCUUUUGAAAUAGAAAACCAACAACUAAAUCUUCUCUAACACCAUGAUUUUCUAAUCUGUAUUAAAGCGUUCCAGAAGUAAGACAUAUCAAGAUUUAAAACAUAAAUAGCUUGGAACACCCUGAAGAGCAACAUGGGAGAAACUGAGAAAAGAAUUGAAACCCAUAGAAUAAGAUGUCUUUCCAAGUUGAAGAUGUUUCUGUUGGCAAUAACAUGUGCAUUUGUAUCCAAAACACUGUCUGGAUCUUAUAUGAAUUCCAUGCUCACACAAAUAGAGAGACAAUUCAACAUCCCAACAUCUCUAGUUGGAUUCAUUAAUGGAAGCUUUGAGAUUGAUAUGAAUAUGAAUCUACAGUUUCAGUUUCAGGCAACUUGUCCUCAAACAGUUUCUUGUGUAUGGAAAAUGGAACCCAGAUUUUAAGACCAACGCAGGAUCCAUCAGAGUGUACAAAGGAAGUUAAAUCAUUAAUGUGGGUGUACGUCCUAGUAGGCAAUAUUGUACGUGGAAUGGGUGAAACUCCCAUCCUGCCUUUGGGUAUUUCCUAUAUAGAAGAUUUUGCCAAAUUUGAAAAUUCUCCUUUAUAUAUUGGGCUUGUAGAAACAGGAGCUAUUAUUGGUCCUUUGAUUGGACUUUUGUUGGCAUCAUUCUGUGCAAAUGUUUAUGUUGACACUGGAUUUGUGAACACAGAUGAUCUGAUCAUAACUCCCACUGACACUCGUUGGGUCGGUGCAUGGUGGUUUGGCUUUCUGAUUUGUGCAGGAGUUAACGUGCUCACUGCCAUUCCUUUUUUCUUUUUGCCCAACACACUUCCAAAGGAAGGACUAGAGACUAAUGCUGACAUCAUUAAAAAUGAAAAUGAAGACAAACAAAAAGAAGAGGUCAAGAAGGAAAAAUAUGGAAUCACUAAAGAUUUUCUACCUUUCAUGAAAAGUCUUUCCUGCAAUCCAAUUUAUAUGCUUUUCAUACUUGUAAGUGUGAUACAGUUCAAUGCAUUCGUUAACAUGAUCUCCUUCAUGCCUAAAUACCUAGAACAGCAAUAUGGAAUAUCAUCUUCAGAUGCAAUCUUUCUAAUGGGUAUUUAUAACUUACCUCCAAUAUGUAUUGGAUAUAUAAUUGGUGGUUUAAUUAUGAAGAAGUUCAAGAUUACUGUCAAACAAGCUGCCCACAUAGGAUGUUGGUUAUCCUUACUUGAGUAUCUUCUCUAUUUUUUAUCUUUUCUCAUGACUUGUGAAAAUUCUUCAGUUGUUGGAAUAAAUACCUCUUAUGAAGGAAUUCCACAAGAUUUAUAUGUGGAAAAUGACAUCUUUGCUGAUUGCAAUGUGGAUUGCAACUGUCCAUCUAAAAUAUGGGAUCCUGUGUGUGGAAACAAUGGCUUGUCAUAUCUGUCAGCUUGUCUUGCUGGUUGUGAGACAUCCAUUGGAACGGGAAUAAACAUGGUGUUCCAAAAUUGCAGCUGUAUUCAAACAUCAGGAAAUUCAUCUGCAGUUCUUGGGCUGUGCGACAAAGGACCUGACUGUUCCUUGAUGCUCCAGUACUUCCUAAUCUUGUCAGCGAUGAGCAGUUUCAUUUAUUCUUUGGCUGCCAUACCUGGAUAUAUGGUUCUCUUGAGGUGUAUGAAAUCUGAAGAGAAGUCCCUUGGUGUGGGAUUACAUACAUUUUGCACAAGAGUAUUUGCUGGCAUUCCUGCACCUAUAUAUUUUGGCGCUUUAAUGGAUUCCACAUGUUUACACUGGGGAACUUUGAAAUGUGGUGAGUCAGGGGCAUGCAGGAUAUAUGAUUCCACCACCUUCAGAUACAUCUACCUCGGAUUGCCGGCAGCACUAAGAGGAUCAAGCUUUGUUCCAGCCUUAAUCAUCUUAAUUCUUUUGAGGAAGUGUCAUCUACCUGGUGAAAAUGCCUCUUCAGGAACAGAGCUUAUAGAGACAAAAGUCAAAGGGAAGGAAAAUGAGUGCAAAGAUAUAUACCAAAAGUCCACGGUUUUGAAAGAUGAUGAAUUGAAAACUAAAUUGUAAUUGUCCUAUUAUAUUACUUUUUUCAGAAUUAGAGAACAUGCUGUACAACUUAAUUGUUUUAAAAAUCAGUAGAGAUAUAAUAGAUAACUUUUUCUUGUCUUUAAGAACCUAAAAAACCUCUUAACUCAAAAUAAUAAAAUGUUCACUAAUGAUAUUUCUAAGGUAUCAGUGACACUUGAGUUUUCCUAGGAGGGACAUCAAUAACAGCCCCCUAAAGAAGAUUCUUAGAGCCAGCUUUAUUUUUAUGUUGAAACAGCAAUUUCCCUUAAUUCAUCGAAGUAAGGGUGUACUUCCUACAUCUCCUUCUACUAAUACUUCUAAAAAUUUUCUGUUAUGAAAACCUAUUUAAUUCCACUAAAUUUGUUCUUUGAUAUUGGAAUUAUUCAGAUGCCUAAAUUCUCAUUCUGUUAUGUGAAGAUUUAAAUAUUUUAUUCAAGUUUAUCGCUUCCAUGUGAGAGAAGCCUACAUCUUCUUAUUCUAUUUAGGAAUCGUUCUUUAACUCUUCUUAUUCAUUCUAGGCAUGACUCCUAUAUAAUAGAUUACUCAUAAAUAUACCCUCCUACUUUCAAUUUUUUCUUUUCUUUAUUACUCAUACAUUUGCUCAAUUUGUACAGAAUACUGACAAACUUAAGCAGGUUAUUAAACAUCAUGAGGCAAAGAUUGUUGGAUUUUUUUUCAGUAAUUCAAAUCCAGUGACUAAAGUUUUUCUUACAAACAAGUGUCUGAAUCAAAGGAUGAAAGGACAAUAUUAUAAAAACUCCAGUUCUUAAAGGCUGUUUGUAAUGUCAGAUAUUGUCAAAGAACCACUUUCUAAGAUUCAGGACUCUUUAGACCGAUGUUUAUAUCACCCAUUGUGUCCUAAGGUAGAACACAAACACUAAUUUUCCCAAAAUAAUCUUAGACAAUAGCUUCUGUUAUGAAACAGAGGUUAGUAAAGGCUAAGGUACAUAUUAAAAGCUAAAUCUACUUAUAUUAUUAUUUUGUAAAUUAUGGAUAAAAUUAAAAAUUGAAGGAUUUUAGACAUAGAAGAGGACUUAUUGAUUAAUAUAGGGCUUCUGGUAAAAGAGAAUAGAAUGAACAGACAAAUACCUGUUUGUCUACUCCUUACUCUCCUUCCUGUUGAAAUGACAGUCAAUAUAUAAGAAUGACAUAAAUCCCUAAUGGAUGAAGAGAAUGGAGUAAGGAAGGGUGGGAGAAGUGGGUGUCAAUACACUAUGGUUAUUUAUGUGUACUAUAAAUGGAGUGAGAGUGUCUGCAGGGAUACAACAGAGUGGAGGAAGCUGAAAUACAGAAUAUACCUAGAAGGAGCCUGGAAUGGAAGUGUGAAACUGAGUUGCCAGUUCAAAGUGUGAGUUGGUAGCUGGACAGAAAGCAGGCCAGUUAACUGAAGGACUUUGUACAGAUGCUUUACAGGUUAAUAUGAUUUCCUAAAUGAUCAGAUGCAUCAUAUGAAAAAAGAAAGCAAAUGAGAAGAGAAAGGCUGUAUAGAACAGGUUUAGGGGGAAGGAUGAAAAGUUAAGUUUCAGUUUCAUGAAGUUUGAGACUUCAACUCUGGGCAUAUAAAAAAUAACCAAGGUUCAAACCAAGACUGGCUUUGAAACAAGAGAGAGGAACUAAAAUCAUUGGAAAGGGGGAGUUUAACUUUGAUGUAGGUAUGACUGCAGCAGUGAGAUAUCGUAUUAAGAUCUGAUGACAUGAAAUUUGGAGCCACUUCCUUUGUGGUGGGAGGAAGUGAGGAGAAUGGCCUGGAAACUAAAACAAGGAGAAGAGACUUACCUAUAUUCACAGAGCAGCAAGAAAAAGUAAACAGCCACUGCAUGAGAAGGUUUCAGGGGAAUCAGAUUUUGCUGAGUGUGCGAUGGUGAAGAGAAUGCUCAUUUCUGAACUGGAAUCUGAGCUAAAAAGAAGCAAAUAGGAUAUAUAUGGAAGUUAGACUUAUGGAAAUUAGAAGAAGGGGAAUGAGAGAUAGUUUGGAAUUCUGUGGCUAUUUAGGUGACUGACAUAAAUGGGGGCAGAGGACAUAAUGAGGUUAGUUCUUACGGAUUCAAGGCAGAUAGUGUUGGUGAAACAGUGAGUGUCAAAAUUAGGCGAGGUGGUGACUGGGCUCCCUGAUGACCUCUUGUCGUGGAGCAAAACUGAAUAAGCAAAAACUUACUCAAGCUCCUGAGGCCCAUUCAUCAUCCCUAUUGAUAGAUUUGAGGUGAUCUGAGAAAGCUGAGUCUUGCUUUGUGGACAAUUCACCCACUUGAACUCCCUCAAUGGAGCAUCAUAGGCCCAGAGAGACAUGGCUAUGGACUUAGUACCUUGGCAUCACUUUUAUCCCCUCAUGGAGGAGAUGGCAUUUUACUCUGAAAACAUAGGGUUCUCCUUUGACACUUCUUGGUGGGAGAAAGCAGGUCAGAGAAAGUGGGUGUUGGAGUGCUUUGGGAUCCCUCAUGACCUCUUUUGUUGGUAUACAUGAAGCCUGGGAGUUUAGUUCUUAUUCUGAGCACUUGUACUACUCUCAUGAGGGUAGAGAUAAUGGCAUAGCGGACAGACAUGGAGAAGAGAAACAAGAGAACAGGUAGUGAGAAGUCGAGAGUCAGUAAUUUUCUUACUUAAUAUUGUGGGGAUCUUACUUAAUACAUAAAGUUAAUGAAACUAGAAAUAGUGGUUUAAUAUAUUACUUAUAAUUCAAAAAUUAACCUAUAUUUACAGAUGCUUACACAGUUUCUUUGUGAAUCCACCUAUGGUUUUAUUUUAAUUAAUUUUUUAUUGCAAAGCAAUGAAAUGUUGCUUUGUGGAGCCAGAUAGCAUUACAGCAGGUAAAUGGGUUUCUGCUAGAUCUCCACAUUAUUGGGGAGAUGCUCGAAGACCUCAGAAUAUACACACCCUUAAGGUUCAAGGGCUGGGGUUGAGCUCUCCAUAAGGAACUUUUCCUCCUCCCAGAAGGGCGAUCAUUGUGUAUAUAGACAUGGAGACAGAACCAGAAU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1804.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1945.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 2095.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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