Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001389708.1
Sequence Length
3610 nt
GC Content
0.3975
GGCAUCCCCAGGCAGGCUGCAGACUGGGAGGGUGGGAGUGAGCAUGCAGCUGACCCCACCAUGAGGCACAGGGCGUCGCCUUCUCCCCUCAGCACAGAGGAGAGGUGACGAAUGCCACUUGGUCUCUGCAGCGUCUGUAGAGGGAAGUCUGUAAGCGGGAGUGUCAACCCCAAUUGGCAGAUUCUCUGACACUUCAAGUCUGCAAAGGAAAAGCAGCCAGAUCUGCCAGUGAGCCUCAGGCUUUAGGAACUGAAGAGUGUUUCUGAAAGAUCUAUCCAGCACUCCGAUGGCCAGCAACAACACCGCCAGCAUAGCACAAGCCAGGAAGCUGGUAGAGCAGCUUAAGAUGGAAGCCAAUAUCGACAGGAUAAAGGUGUCCAAGGCAGCUGCAGAUUUGAUGGCCUACUGUGAAGCACAUGCCAAGGAAGACCCCCUCCUGACCCCUGUUCCGGCUUCAGAAAACCCGUUUAGGGAGAAGAAGUUUUUCUGUGCCAUCCUUUAAGUCUUUGAGAGGGGCCUGAAGAGCCUCCGGGCUCCUGGGACAUUGAUGUAGAGUUUUUAGUGAAGUGGGCACCUUUCUAGUCCACGGCAUUUGAAGAGAGCGAGGAGAACCAUUCUGGAAACUCUAGGCUAUGCAUGUUUAAAGAUCUGGUCCCCUUUAUGAGAAUGCAAGCCGAUCCACAUCCUGACUUAAGAGAUCUGAUUCUGACGAACUGCCUGGAGGAGGGGAAUAUAUAAAAAUAAAAUUGGUGUCACUUCUUUUCUGCUAUCCCCCAGCCCCCCCCCCAAAAUCCUCAUGUUUCUGCUUCAUAUUUUGAAAAAUAACAAUUAAAACAGACAGCUGUACUGAGGUAAGAUAUGUGUGACCUUCUUGGAAUGAAUAUUGUCUUUAGAAUACCCUUUGAUAAGCUGAGCUGUCCCGUGUAGAUGCAAUUCGGUUUAAUGGCAUUGAUGUAUAGUCACUGUGCCUUUCUUUUUCUUUCUUCCUUCUCCUCUACCCCUCCUUCCACCCCUCCCCAUUAGAGUAGUGUGGAGAUAAGGCUGGACUGGUCUAUCAGAUUGAACUCCAAGAAUGAUCACACAAAAUGUUUAGGGAGAUGUUCCCCGUGGUGUAUCCUCAUGGUAACAACGACAAAAAAUGCCGGUUGUCUGUGUUCUCUUUUCACUAUUCCUAACAUGUGUACAUGAUAGCUUUGAUUCUGCAAGUAAAAGUAAAUCCUGUGUUGUGACUGGUGCUUUCAUAUAUUUGUGACAAUUUUUGAGUAAUAUUGCAUGAAAAUGUCCCUAUGUUACAUCCAUUCAGAAGUUUUGUUGUUUUACUCUAAAGCUGGGAAAGGAAAUGAGAGGGAAAAGACCCCGGAGAGGGAAGAAAAUCUCAGUAUUUUGAAAAUUGAGAUUACUUCAGAGCCUUAGCCACACCUAAAAUACCUCCUAGUUAAUAGUGGUAUAAAUGCCUCUUCAAUACGUUUUCCAGAAUCCAAAGCAUUUUGGUUUAUCCAGGACCCAGGGCAGCACAGCUGUCACCAAGCAGGAGAGUUAAGGAUUCACCAUGAGCUGGGAAAUGCUUUUGCCAUGAGUAUGAGCAAAUUCCCUCUUUCCCUGAAUCAUGGACAUUCUAGAUUAAAAGAACAUUUUUUUGUGCUCUUAACAAGAAAACCAUGGCCCUCCUUUGUUCAAGUAUCAGAAGAAAUAAACCCACAGCUCCAGAGAAGGUGACCAUUCUCAGAACUCCAGCUAUUCACUCUCCAGGGAGAAGGACCUCAAAUCGCCACUCUUUGGGCGGCAGGUGCGGUCCCCACGGCCGGCUCUACGAGGAAGAGUUCUGGCUCUUUUGUCCACUGAGAUGGUCUUGGUUUUUCACUUAACAAAUUUUUUAAUGGAAUCUUUGUUUUUGUUCUCCAUCUUGUUUGUUAGAGUCUCUCGGCCUUUAUUUACAAAUUCCUUGCAACUAGAGCGCUCCUUCCCCAAGAUAUGGUAGUGAGAGUAAUUUUUCAUUGUAGCUGUAGUCUCCAUCAGUAACAGCAGGCCCUGGAAGACUUGAUCACCUUUUUCUGUGUCAUUUUCAGUCAAAGAGGGCCUCUCUUACAUCUUGUUUGCUUUCAAAUCCCCAAAUAUCAUCUCCAUCUCCCAAUUAAUUUUAUUGUCUCUUUCCUCUCUAUUCGCUUUCUCCUGUUUUUUUUUUAAAAAAAAAGCAUGAAAAAGGAAGAGAAAAAGUUUGAUAUGCCAAGGACAGAUUUUGAAACAGACUUGGUAAAUGUUUUCCUUAGCUCCUUCAUGGGCAUGCUGGUGAAAGAAUAAAUACAUCCAAUUAAAGCUCAUGCUGGGGUCGGGGAGAAGAGGAUACUGAAACAUUUGUGAAAUGUAUGAAUGCACUUCUGUAACCAGAUACUUCUGUUCUUCUGUUCAAAUUGUGGGGUUUUUGUUACAGUUAGGACGCCCAUGAAGAUUUAGGGGUGAAAAAAACAGCAGAGUAUUUAUUAAACUACAGCAUUGUACAAUUAGCUUAGUAACACUAUGGAAUAAGCUAAAACAUAUCACAGUUUUUACAUGGGCCAAAACAUGAAUUGAGUAUGUGGUCACAUGAAAACACGGAUGAAUGAAUAAAACACUCUUUGGUGGUGACUGAGGCAUCAUUAGAAGGCCCAGACGAUUUCCACUAUUCACAGCAUUUCCUUUUCUCAGAAGGACUCUUUAUAUUUCCAUGUAAAUCUAGAUCUUUGGAGCAAUUAAGAUGGAAUUACAAUUUCUAGGGAGCAUUUUAAGGAAAAUGUUUUGGCUUUUUCAUAAUUUUAUGUCUUACAGUAUGGAAUUAUAAUACGAAAAUCUUUAUAUGAGUUUUGGCUUCUUGGUAUUUGUACUUAUUCAGGGGAAAAAGUCUUUCGAUUACUUAUGCCUCUAUAGAGCUUAAUUUCUUGAGAAAUUCAACAGUCAUUUUCACCAGCAUAAUUUUAUCUUAAGGAAUAACUAAUAGGAAAAGUCAGCUUAAUUAUUUAAGGCCCUAGUUUCUACAUAUAAUAUAUUCGAUAGAAAUGAAAAUCUGCCGUGGAAUUAACUAAUAAGUAGUAACAAUAAACUUCAUAUUUAGAAUGCAAAGUCUAUAAAGAAUAAUUUUACAUGAUCCUCAAUAUCAACUCCAGUUUAAAAAGUGUUAUUUUUAAAACAUUUGAAACCAAGUACUGUUUAAUUUCAAUCAGAAGAUGCAAAUACAUACUUUGAUCUAUGUUUGAUUUUGCUAAUAAUAUUUGAAGGAGAUUGCCUACCAAGGACAAAACAAUAAAUUUAAAAAUCAAACGAUUUCUCCAUACGCUCAUAGUCACAUAUGGAAUUUUGAGAAAAUAAAGCAUGCUGUCUUUAGGAAUUUUUAUACUUCUUUGUCUUUCUUCCUUAAUAUUUGCUUCUAGCUGCUCUUGGCAAUGAUGAAUUGUUAUGUAUGCAUUAAUGUUUUGCAGCCCAAAAGUUGUUCACAUUUUUCCUAUAUAAGAUCUGUGGAGUGUGUGUUUCAAAGAGAGAACUACAGAAAUGUUAAAGCAGGAAAACCUGAAUGUGAUGUGCACAUUUUCAUCCCACAUGGACAAUGUAUGUGUUUUAAUAAAUGGAAUUUUCAGAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-939.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1010.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 1009.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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