Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001393549.1

Sequence Length

2175 nt

GC Content

0.4308

AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGUUGCUAUCACUUGGAGGUGAACAGCCUCUUUUGCCGGUAUUCAGUGAAGAAAGCAAGUCUAAAUAUGCAGUUCUCUCACUGGAGUGAAAGAUGUUUUGUUCAUUUCUAAUCAACUAUGCUAGACAGCUGCAAGCUGAAAAGUGCCUGCAAUUUGCCAUUUAUUUGUAAUAAGAAAAUAAUAAACACUGCUGGAACCAGUAAUGCAGAAGUCCCCUUGGCUGAUCCCGGAAUGUACCAGCUGGACAUUACAUUAAGAAGGGGUCAAAGUUUAGCUGCUCGAGAUCGAGGAGGGACGAGUGAUCCAUAUGUGAAGUUUAAAAUCGGAGGAAAAGAAGUUUUUAGAAGUAAGAUAAUACACAAGAACCUCAACCCUGUGUGGGAAGAAAAAGCUUGUAUUCUGGUUGAUCAUCUUAGGGAGCCAUUGUAUAUAAAGGUAUUUGACUAUGAUUUUGGACUACAGGAUGACUUUAUGGGCUCAGCCUUUCUGGAUCUGACACAAUUGGAGUUAAACAGGCCCACAGAUGUGACCCUUACUCUGAAAGAUCCUCAUUAUCCUGACCAUGAUCUUGGAAUCAUUUUGCUCUCAGUCAUCCUUACCCCUAAAGAAGGAGAGUCCAGGGAUGUGACAAUGCUAAUGAGGAAGAGUUGGAAAAGAUCAAGUAAGGAACUUUCAGAAAAUGAAGUGGUUGGAUCUUAUUUCUCUGUGAAGUCUCUCUUUUGGAGGACGUGCGGCAGGCCAGCUCUUCCUGUCCUGGGCUUCUGCAGAGCAGAGCUUCAGAAUCCUUAUUGCAAAAAUGUACAAUUUCAGACCCAAAGUUUACGCCUAUCAGACCUACACAGAAAAUCGCAUCUUUGGAGAGGAAUAGUCAGCAUCACCUUGAUUGAAGGGAGAGACCUCAAGGCCAUGGAUUCCAACGGGUUGAGCGAUCCCUACGUGAAGUUCCGGCUUGGGCAUCAGAAGUACAAGAGCAAGAUUAUGCCAAAAACGUUGAAUCCUCAGUGGAGGGAACAAUUUGAUUUUCACCUUUAUGAAGAAAGAGGAGGAGUCAUUGAUAUCACUGCAUGGGACAAAGAUGCUGGGAAAAGGGAUGAUUUCAUUGGCAGGUGCCAGGUCGACCUGUCAGCCCUCAGUAGGGAACAGACGCACAAGCUGGAGUUGCAGCUGGAAGAGGGUGAGGGACACCUGGUGCUGCUGGUCACUCUGACAGCAUCAGCCACAGUCAGCAUCUCUGACCUGUCUGUCAACUCCCUGGAGGACCAGAAGGAACGAGAGGAGAUAUUAAAGAGAUAUAGCCCAUUGAGGAUAUUUCACAACCUGAAAGAUGUGGGAUUUCUCCAGGUGAAAGUCAUCAGAGCGGAAGGGUUAAUGGCUGCCGACGUCACUGGAAAAAGUGACCCAUUUUGUGUGGUAGAACUGAACAACGAUAGACUGCUAACACAUACUGUCUACAAAAAUCUCAAUCCUGAGUGGAAUAAAGUCUUCACGUUCAACAUUAAAGAUAUCCAUUCAGUUCUUGAAGUGACAGUUUAUGAUGAAGAUCGGGAUCGAAGUGCUGACUUUCUGGGCAAAGUUGCUAUACCAUUGCUGUCUAUUCAAAAUGGUGAACAGAAAGCCUACGUCUUGAAAAACAAGCAGCUGACAGGGCCAACAAAGGGGGUCAUCUAUCUUGAAAUAGAUGUGAUUUUUAAUGCUGUGAAAGCCAGCUUACGAACAUUAAUACCCAAAGAACAGAAGUACAUUGAAGAGGAAAACAGACUCUCUAAACAGCUGCUACUAAGAAACUUUAUCAGAAUGAAACGUUGUGUCAUGGUGCUGGUAAAUGCUGCAUACUACGUUAAUAGUUGCUUUGAUUGGGAUUCACCCCCAAGGAGUCUCGCUGCUUUUGUGGCCUUGUAUGGGACUUUCAUUAAUGUCUGAGCACAUGGAACAAAGAGUGUCUACGUCCCUUUGUGUUGUAAGUUACCAGAAAGUUAGGCAGCCUGCUUCCCAUAGACGUGUUGUUGUCUCCCUAAAGAAAGCAAUUGUCAUUAUCGUUAAGUUUUAGAAAAAAAAUCUCUCUCUCUCUGUCUCUCUCAGUAUUCUUUUUGUAGCUCUUUCUUAUAAUAAAUAUAUGGUGGUACUAUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-606.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -651.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 712.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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