Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001393903.1
Sequence Length
549 nt
GC Content
0.4663
AGUGACGGUGGCGUUUCCUUGAGGAAGAGUGAGGGUUCCAACUUUUCUGCUUAUCUGGGAGGUGUUGGGCGCGGACAGUCGAGAUGUCAGAGAAAAAGCAGCCGGUAGACUUAGGUCUGUUAGAGGAAGACGACGAGUUUGAAGAGUUCCCUGCCGAAGACUGGGCUGGCUUAGAUGAAGAUGAAGAUGCACAUGUCUGGGAGGAUAAUUGGGAUGAUGACAAUGUAGAGGAUGACUUCUCUAAUCAGUUACGGUAGACACAGCAUCAUCUCUACCCAUAAAAGAUGGCAUUCUGCAAGACUGAGAAGAUGCCCACCUCCAUUCCCAGAGUCCAGGCCUUCAUUAACUCACACGAGAACUACAGAAGCAUCACCCCUAGUUCUCCUAUUAGUCACUCCUCCUCAACUGCCUCUAAUCCAUCCAUCCAUCUAUCCGGCAUGGGUCAUGUAAAGUUACAGCUGAGAAGGUACUCCCUCUCUUAAACUCAUCGGGGCUCCAUGUGGCUUCAAGAUUGAAAAUAAAACUACUGUGUAUGGUAUAUAAACUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -155.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((..(((((((((((....(((.(((((((...(((((((..(((((.((...((((.(...).)))).)).))))).)))))))......(((((((((....((...((((((((.((..((.(((..(((.(((((.((.(((........))).))..........(((((((..((.....((((((((((....((((............(((((((....))))))).((((((...(((((....((..(((((...........)))))))..)))))..)))))).......))))..)))..)))))))......))))))))))))))....((((((((..(.........)..)))))))).......)))...))).))..)).))))))))....)).....)))).)))))((((((..((((....))))...((((.((....)).))))....)))))).))))))))))....)))))))...))))......)))))))...................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((.(({{(((.(((((..((((...(((.(((((......(((((({((({.{((.{((,(({(({({{.,.,,,,,}},}.}),)).,}}}..,||||((({{{(({....{|,,,||{{((((,{(.,{{.(((,.{{{.({({,,((.(((......,.))).))||{,{,,,..((((({(..{{....,{(((((((((....{((({(({((.,..,,(((((((....})))))}.,{,|||..,{{{{|....,|}}||||}},..........|,,|{{{{|||,|....,}))},,}})})),,..}})..))))))),....,)))))))}}.,}))....((((((((..{.........,..))))))))......}}},.})))),)),,),,)))))}},..|,||,,,,.}}},.,}))}}}}|||..{(((....)))))),)))))).....))))).)))...))))..))))).)))))).))}{{{....,)},.......,{{,{|,.,..,,}}...........
Back