Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001393995.1
Sequence Length
1369 nt
GC Content
0.6589
ACUUCUUCCUCCCUGGGGAUGGAUCCAAGCUAUUGUCCUGCCCAUGGCUUCCCAUCUCAGGACCCUCUCUGGCCGCUAUCAUCCCAGCAGUGGAGUUCAGCCCACUACUCUGAACCAGGCCUCCAGGCCCAAGGUCAGCAUCCCACUGUCAGCCAUCAUUGAGGUCCGCACCACCAUGCCCCUGGAAAUGCCAGAGAAGGAUAACACAUUCGUCCUCAAGGUAGAGAAUGGAGCCGAAUACAUCUUGGAGACCAUCGACUCUCUGCAGAAGCACUCGUGGGUAGCUGACAUCCAGGGCUGCGUGGACCCCGGUGACAGUGAGGAAGACACCGAGCUCUCCUGUACCCGAGGAGGCUGUCUGGCCAGCCGCGUGGCCUCCUGCAGCUGUGAGCUCCUGACUGAUGCAGUCGACCUGCCCCGCCCCCCAGAGACGACAGCCGUGGGUGCAGUGGUGACAGCCCCCCACAGCCGAGGUCGAGAUGCCGUCAGAGAAUCCCUGAUCCACGUCCCGCUAGAGACCUUUCUGCAGACCCUGGAAUCCCCGGGCGGCAGCGGCAGUGACAGCAAUAACACAGGGGAACAGGGUGCAGAGACGGAUCCCGAGGCUGAACCCGAGCUGGAGCUAUCCGACUACCCAUGGUUCCACGGGACACUGUCCCGGGUCAAGGCUGCUCAACUGGUUCUGGCAGGGGGGCCCCGGAACCACGGCCUCUUCGUGAUCCGCCAAAGUGAGACUCGGCCUGGGGAGUACGUGCUGACCUUCAACUUCCAGGGCAAGGCCAAGCACCUGCGCCUGUCCCUGAACGGCCACGGCCAGUGUCACGUACAGCAUCUGUGGUUCCAGUCUGUGCUUGACAUGCUCCGCCACUUCCACACACACCCCAUCCCACUGGAGUCAGGGGGCUCGGCCGACAUCACCCUUCGCAGCUAUGUGCGGGCCCAGGACCCCCCACCAGAGCCGGGCCCCACGCCCCCUGCCGCGCCCGCGUCCCCGGCCUGCUGGAGCGACUCGCCCGGCCAGCACUACUUCUCCAGCCUCGCCGCGGCCGCCUGCCCGCCUGCCUCGCCCUCCGACGCCGCCGGCGCCUCCUCGUCUUCCGCCUCGUCGUCCUCUGCCGCGUCGGGGCCCGCCCCCCCGCGCCCCGUCGAGGGCCAGCUCAGCGCGCGGAGCCGCAGCAACAGCGCCGAGCGCCUGCUGGAGGCCGUGGCCGCCACCGCCGCCGAGGAGCCCCCGGAGGCCGCGCCCGGCCGCGCGCGCGCCGUGGAGAACCAGUACUCCUUCUACUAGCCCGCGGCGCCGCCCGGGUGGGACACGCCAAGCUCUUCAGUGAAGACACGAUGUUAUUAAAAGCCUGUUUUAGGGACUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-558.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -579.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 411.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((((((((((((......((((..((((((...((((....))))..))))))......)))).....))))))).((.((((.((((((.........))))))..((((....)))).(((((((((.(((((((((((.((......(.(((((((.((((..(((..((((.....))))...(((((.........)))))....(((((((((((..((((.......))))...))))....)))))))....)))...))))((((((.........))))))))))))).))))))))))).)))(((((....((.(((((.......))))))))))))(((((......)))))..(((((.((.((..((((((.....(((.((((..(((((((((((.((((.(((..(.((.(((((.((.((....)).))..))))).)).)..)))(.((((..(((((.......)))))...)))).)((.((((....)))))).....)))).......))))))....))))))))).)))......))))))..)).)))))))..(((..((((.(((((((.((((...(((((((((..........))))))))))))).((((....(((((((((((((......(((((((((..((....))))))))))))))))).....)))))))....))))....))))))).))))...)))))))))))).......(((((..((((((......)).))))..)))))..(((((((((((.((((((.((((((...(((......))).)))))).))))))(((((((...........................(((.((((((((.((((((............((((...((((.((((((.((..(........)..))))))))))))....))))(((....)))....((((..(((((((......((.......)).......)))))))...))))))))))...)))).)))).)))((((((.((((.....(((((......((.....((((((.(((........))).))))))..))......))))).))))))))))..((.....)))))))))..(((((...((((...)))).)))))..))))))))))))))).))(((.(((((((.(((((.(((((....)))))..(((.(((((((((.(....((((.......))))..))))))))))))))))))(((......))).))))))).)))..((((...))))...............)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........(((((((((((((..,...({{{..((((((...((((....))))..))))))......)))}....,))))))),{|{((((.{{,,,|,}},},.,.||||||,.((((....|||}..,((|||((.(((((((((((.({......(.(((((((.((((..(((..((((.....)))).{.(((((.......,.)))))}...(((((((((((..((((.......))))...))))....)))))))....))}.,.))))((((((.........))))))))))))).})))))))))).)))((((,...{((.(((((.......))))))))))))((({,{{{{{.,||||{(({((({((,((.,((((((,,{{.{{|,||||..{(((((((({{,{(,{.(((,,(.((.(((((.({.(({,,.,},}}..))})).}|,}.,|}|{.((((..(((((.{....,)))))...}})).,{{.{({{.,..||||||.,,{{{|||..,,,|{}}}|}},.},)})})}}}}.)),......)}))))..))})))))))|}|{(,.{||(,((((|((.,,((.|.{((((((({..,....,,,))))))))}||||{(,,,}}}}||(((,,,(((,({,,...,(((,,,(({{((.{{{|,,|||,,||,||||||.....||}}|||....,))).,..}}|||||{||||{{{,||||||,,,,,.......(((((,.((((({......)).)))),.)))))..,((((,((({,.((((((.((((((...(((......))).)))))).)))))){{{|||{................,,,......}))}|,{{((((((.((((((............((((...{(((.((((((.((..(........)..))))))))))))....))))|||}.,,)}),}},||||}.(((((,({{...}|}}}})}}}))}}}}},,)))))))}..)))).)))))...)))).))))}),.|||{,..||,|}.}}}(({(|.....,|......||||||,|||,,}}}}..}||.||||||.,{,.....,)}))}})),))}))))..|{.,.},)})})))))}}||||,...((((...)))).)))}))}))))))))),))),,.}}{|||{,{|,||,,,,}}.||||({(((((.(((.(((.(((((((((.(....((((.......))))..))))))))))))).))).))))...)}),..|}|||||.}})||||{{.,..|||......,}}.}}}}})))))}.....
Back