Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001393999.1

Sequence Length

1637 nt

GC Content

0.4551

GUACUUUUUAACUCUCUCGUUAGAGAUGACCAGAGCUGGGGAUGCGGGCACCUGUCUUCCAGGCCCUCUUGCUGUGUGGCCGCAGACUGGUGGUUCAGCCUCUUAACUCGGACAUGAGGAAACUGAAAAACAGAGUAGCAGCUCAGACUGCCAGAGAUCGAAAGAAGGCUCGAAUGAGUGAGCUGGAACAGCAAGUGGUAGAUUUAGAAGAAGAGAACCAAAAACUUUUGCUAGAAAAUCAGCUUUUACGAGAGAAAACUCAUGGCCUUGUAGUUGAGAACCAGGAGUUAAGACAGCGCUUGGGGAUGGAUGCCCUGGUUGCUGAAGAGGAGGCGGAAGCCAAGGGGAAUGAAGUGAGGCCAGUGGCCGGGUCUGCUGAGUCCGCAGCAGGUGCAGGCCCAGUUGUCACCCCUCCAGAACAUCUCCCCAUGGAUUCUGGCGGUAUUGACUCUUCAGAUUCAGAGUCUGAUAUCCUGUUGGGCAUUCUGGACAACUUGGACCCAGUCAUGUUCUUCAAAUGCCCUUCCCCAGAGCCUGCCAGCCUGGAGGAGCUCCCAGAGGUCUACCCAGAAGGACCCAGUUCCUUACCAGCCUCCCUUUCUCUGUCAGUGGGGACGUCAUCAGCCAAGCUGGAAGCCAUUAAUGAACUAAUUCGUUUUGACCACAUAUAUACCAAGCCCCUAGUCUUAGAGAUACCCUCUGAGACAGAGAGCCAAGCUAAUGUGGUAGUGAAAAUCGAGGAAGCACCUCUCAGCCCCUCAGAGAAUGAUCACCCUGAAUUCAUUGUCUCAGUGAAGGAAGAACCUGUAGAAGAUGACCUCGUUCCGGAGCUGGGUAUCUCAAAUCUGCUUUCAUCCAGCCACUGCCCAAAGCCAUCUUCCUGCCUACUGGAUGCUUACAGUGACUGUGGAUACGGGGGUUCCCUUUCCCCAUUCAGUGACAUGUCCUCUCUGCUUGGUGUAAACCAUUCUUGGGAGGACACUUUUGCCAAUGAACUCUUUCCCCAGCUGAUUAGUGUCUAAGGAAUGAUCCAAUACUGUUGCCCUUUUCCUUGACUAUUACACUGCCUGGAGGAUAGCAGAGAAGCCUGUCUGUACUUCAUUCAAAAAGCCAAAAUAGAGAGUAUACAGUCCUAGAGAAUUCCUCUAUUUGUUCAGAUCUCAUAGAUGACCCCCAGGUAUUGUCUUUUGACAUCCAGCAGUCCAAGGUAUUGAGACAUAUUACUGGAAGUAAGAAAUAUUACUAUAAUUGAGAACUACAGCUUUUAAGAUUGUACUUUUAUCUUAAAAGGGUGGUAGUUUUCCCUAAAAUACUUAUUAUGUAAGGGUCAUUAGACAAAUGUCUUGAAGUAGACAUGGAAUUUAUGAAUGGUUCUUUAUCAUUUCUCUUCCCCCUUUUUGGCAUCCUGGCUUGCCUCCAGUUUUAGGUCCUUUAGUUUGCUUCUGUAAGCAACGGGAACACCUGCUGAGGGGGCUCUUUCCCUCAUGUAUACUUCAAGUAAGAUCAAGAAUCUUUUGUGAAAUUAUAGAAAUUUACUAUGUAAAUGCUUGAUGGAAUUUUUUCCUGCUAGUGUAGCUUCUGAAAGGUGCUUUCUCCAUUUAUUUAAAACUACCCAUGCAAUUAAAAGGUACAAUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-509.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -537.97

Frequency: 0.0000

Diversity: 304.94

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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