Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001394002.1
Sequence Length
1709 nt
GC Content
0.5617
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAGGCGGCGCGGGAAGUGGACACAGGCUCAGAUCUAACUGGACUCUCGCUCCUGCUGGCUGGACAUGGAGGAUUUGGAGGAAGAUGUAAGGUUUAUUGUGGAUGAGACCUUGGACUUUGGGGGGCUGUCACCAUCUGACAGCCGUGAGGAGGAAGACAUAACAGUGUUGGUGACUCCAGAGAAACCACUUCGACGGGGCCUCUCCCACCGAAGUGACCCAAAUGCAGUGGCACCUGCCCCCCAGGGUGUGAGGCUCAGCCUAGGCCCCCUCAGUCCAGAGAAGCUGGAGGAGAUCCUCGAUGAGGCCAACCGGCUGGCCGCUCAGCUGGAGCAGUGUGCCCUGCAGGAUCGGGAGAGCGCAGGCGAGGGCCUGGGGCCUCGCCGAGUGAAGCCCAGUCCUCGGCGGGAGACCUUUGUGCUGAAGGAUAGUCCUGUCCGAGACCUGCUGCCCACUGUGAACUCUUUGACGCGGAGCACCCCCUCCCCAAGCAGCCUGACGCCUCGACUCCGGAGUAAUGAUAGGAAGGGGUCAGUCAGGGCUCUCCGGGCUACAUCUGGAAAGAGGCCCUCCAACAUGAAGAGGGAGUCACCCACUUGCAAUCUGUUCCCUGCAUCCAAAAGCCCAGCAUCUUCUCCUCUUACCCGAUCGACUCCCCCAGUCCGGGGGAGAGCCGGGCCCAGUGGGAGAGCAGCAGCCAGCCCACCCACCCCCAUCAGAUCCGUCCUGGCCCCACAGCCUUCUACCAGCAACUCUCAACGCCUGCCCCGGCCGCAGGGAGCAGCUGCUAAAUCUUCCAGUCAACUGCCCAUUCCCUCGGCCAUCCCCAGGCCUGCCAGCCGAAUGCCACUCACCAGCCGGAGUGUGCCACCUGGCAGAGGUGCCCUACCUCCGGAUUCUCUGUCAACUCGAAAAGGGCUUCCAAGACCAAGCACUGCAGGACACAGAGUGCGGGAAAGUGGACACAAGGUUCCUGUUUCCCAGCGACUAAAUCUUCCUGUCAUGGGUGCCACUCGCAGCAAUCUGCAGCCCCCCAGGAAAGUGGCAGUCCCAGGACCUACCAGGUAAAGAGAUCAGGACAGCAAGCAAGACUUCAGUAGCAAACCACUACAGUCAGUACCUGGACUCGCCUCUACCCAGCAGACCCUGACUCCAGCAGAUUCUGGCCCAGGGACAGGAGGAAGAGAUGCCACCAGGGCUGGUCUCCCAGGAGUAGAGACCAUGGGAAAUGGGGUGGAUUAGGAUUGAGCUGGAGAAGACUUAAACUCUCUGGGUUGAAAGAAGAUUAGGGGAAAAGAGGUCACCUUCCAGCAGUGAAAUGAACAAAUAGAAGAUGAGAAGUACAGGCAAGUGGUUUGUCUUUAUCCACCCCCACUGUUGUGGUCAGCCCCAGAGAAUUUUAUCUUCUUCCUUGGCAUUGGUUCACUGGACAUUUCCACGUGAGCGGCCUCCGUAGCUAACCUCCCUGCCCUCUGAGGAGCCAUCUUCCUGAAUCGCAUUCUCUACUGGACUCUGGCCUGCUUGGAGAGGUGGCAGCAGGCACCUGGUCUUCAGAAAUUGUUUCCUGUGAAUUCUGUGACUCCUAAUAGGCCAGUUUGUGAUAAGCUUACUCUAUGAGUCUUCAUUUUUCUAAAAUAAAGUGAAUGUAUUUUUAUAUUCUCUGUA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-631.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -663.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 443.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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