Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001394010.1

Sequence Length

1884 nt

GC Content

0.6571

AGUGGUUCGGCCGCGGCGACCCCACUCCGGCGGCGCGUCCCCCGAGCUUGGUACGGCUCAGCCCGUCUCCCCCGAAGCCGCGCGCCCGCGCCCGCGCCCCUCAGUCGGUGGAGCCCGCAGCCCCCCUUGUGGCCCGCGGCAGCUCCCCGCCCGCUCGGCCCGCGCCCGCCAUGGUCCGUCCGCGCCGUGCCCCGUACCGCUCCGGCGCCGGGGGCCCCCUCGGGGGUCGCGGCCGCCCUCCGCGGCCCCUCGUGGUGCGCGCCGUCCGCUCGCGCUCCUGGCCUGCCAGCCCCCGAGGCCCGCAGCCUCCGCGGAUCCGGGCCCGCUCGGCCCCUCCCAUGGAAGGUGCUCGGGUCUUCGGGGCACUGGGUCCCAUCGGUCCCUCCUCACCUGGGCUCACCCUCGGGGGUCUGGCCGUGAGCGAGCACCGGCUCAGCAACAAGCUGCUGGCUUGGAGCGGCGUCCUCGAGUGGCAGGAGAAGCGCAGACCCUACUCUGACUCCACUGCAAAGCUGAAGCGGACCCUGCCCUGCCAAGCCUACGUGAACCAAGGCGAGAACCUGGAGACCGACCAGUGGCCGCAGAAGCUGAUCAUGCAGCUGAUCCCUCAGCAGCUGCUGACCACCCUGGGCCCCCUGUUCCGGAACUCCCAGUUGGCACAGUUCCACUUCACCAACAGAGACUGCGACUCGCUCAAGGGGCUCUGCCGCAUCAUGGGCAACGGCUUCGCGGGCUGCAUGCUGUUCCCCCACAUCUCCCCCUGUGAGGUGCGCGUGCUCAUGCUCCUGUACUCGUCCAAGAAGAAGAUCUUCAUGGGCCUCAUCCCCUACGACCAGAGCGGCUUCGUCAGUGCCAUCCGGCAGGUCAUCACCACCCGCAAGCAGGCAGUGGGACCUGGUGGUGUCAACUCAGGCCCAGUCCAGAUCGUCAACAACAAGUUUCUGGCAUGGAGUGGUGUCAUGGAGUGGCAGGAGCCCAGGCCUGAGCCCAACAGUCGGUCCAAGAGGUGGCUGCCAUCCCACGUCUACGUGAACCAGGGGGAGAUCCUGAGGACCGAGCAGUGGCCAAGGAAGCUGUACAUGCAGCUCAUCCCGCAGCAGCUGCUGACCACCCUAGUGCCGCUGUUCCGGAACUCGCGCCUGGUCCAGUUCCACUUCACCAAGGACCUGGAGACACUGAAGAGCCUGUGCCGGAUCAUGGACAAUGGCUUCGCCGGCUGCGUGCACUUUUCCUACAAAGCAUCGUGUGAGAUCCGCGUGCUUAUGCUCCUGUACUCUUCAGAGAAGAAAAUCUUCAUUGGCCUCAUCCCCCAUGACCAGGGCAACUUUGUCAACGGCAUCCGGCGUGUCAUUGCCAACCAGCAGCAGGUCCUGCAGCGGAACCUGGAGCAGGAGCAACAGCAACGAGGGAUGGGGGGGUAGUGGUUACCCCGGGCUGGGCCCCUCCAGGAGUCACAGAUGAGGCCCCCGCAGAGACUGGUGAGUGGUGACCCUGUCAUGUACAGGAGGGACCCUGGGGCAUGUGGGGGGGGUGGGGUUGGGAAAGAAGCAGGGCGACCUUGGCCUUGGGGAGAGCAGAGCAGAGGGAGAGGCAGCAGUCCCAGCGGUCCUAGGCUGUCGGGAAACUGCAGCCCAGCCUCAGGGCCAUGGGAGGUGGUAUCCAGGCCUGGGUGGGGCCAGGCCUCUGCUCACAGGGAUGUGGGGUCAGUGCUUGGGAGCCUGUGGCCAGCAGCCCCCACUGCACCCCUGCCCCCAGGUGACACGCUUCUGAGCAGGGGCCCCUGGGGACUUCAACUGCCCAGCAACAUGGAGGAUGGUGUCCUGAGGCCUCCAAGGACGGUCCCCACCCCUCUACGUUUCCCCAAUAAAGCCUUUUAAAAACCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-843.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -874.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 444.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((.((.((((..(((((((((((((((((((((.((((((((...((.((((......))))..((((((.....(((.(((.(((..((((..((..((((((.(((((((((.(((........)))..))))..))))))))...))).))..))))..)))...))).)))..((((((.((........))..)))))))))))).)).)))))))).))).))))))((((((((((......((((((.((.....)).))))))...))))..((((.((((((((((((..(((((((.((....(((((.....)))))...)).))).))))...)))).))))))))..))))((((((..((((((((((((.(.(((.((((((((((((((..((((..((((........))))((((......))))(((((((((.(((((((((.(((.((((..((....((((......))))..))..))))...)))))...))))...))))).)))))))............((((((.((..((((...((.....(.((((.(((((((.(((.(((((((.........)))))))))).......((((((((((((..((((((.((....))...))))))........))))).....(((...)))....)))))))((((........)))).))))))))))).).((((((.((..((.((((........)))).)).))))))))))...)))).)).))))))((.(((((...))))).))))))..))))))....(((((.(((((((((((.(((.(.(((((.(((.(((((((((((((.........)))))...))))))))........((((((((((...((((..((((..((((((((((((((.(.((((....((((((.(((((((((((((.((((.((.......(((((.(((.((((........)))).)))........(((((.....))))).)))))(((((((((((.(((.((((((....)))))).......((((....)))).....))).).)))))))))).))..)))).))))))(((((.(((..........))).))))).........(((((..(((((.....))).))..))))).((((....)).))............(((((.((((.(....))))))))))..)))))))))))))((((.(((((...))))).))))...))))).))))).)))))..))))))))..))))(((((..(((((..((((...((.((..(((((((......)).)))))..)).)).))))..)).)))..)))))..((((((.....))))))))))))))))))))).)))).))).)))))))))...)).....)))))))).)))))))).)...))...)))))))))).))))))..))))))))))))))))))........)).)).)))))..(((.((((((((((.((((..((((..(.(((.((((((((.((((((...)))))).))))..)))).))))..)))).(((((.((((........)))))))))((((((((((.((((((((((((.(((..(((((((((((((...(((.((.(((.....))))))))))))).))))).(((....))).)))..))).))))))))))))(((.(((((.(((.((..(((......))).)).))).))))).)))(((...)))..)).)))))))))))).).)))))))))....))).............

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(({,((.((((..(((((((((((((((((((((.((((((((...((.((((,...,.))))..((((((..,,,(((,({{.(((..{(((,.{{..,({(((.(((((((((.(((......,.)))..))))..)))))))).,.))}.))..})))..)))...))}.}},..((((((.((........))..)))))))))))),),.)))))))).)))}})))))(((((((((({{..,.((((((.((.....)).)))))).},||}}..(({(.((((((((((((..(((((((.((,...(((((.....))))).,,)}.)))},)))...)))))))))))))..})))((((({..((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((((......)),}))))((((,....}}))}}|(((((({(.(({((((,{.(((.((((..({....((((......)))).,))..))))...)))||.|.)))).,,))}}}.)))}))|,..{,......,||},....,||((((.((({.(((.((((.(((..{.((.(((.(((((((.........)))))))))).))..)))))))..))).},}))..)))),.|||||,..|||,,,,)),,.}}}}}.,...(((.(((((.((..((((((((,(((,,......}))}{(((((((,.,(({{((.(((((,(((,{{,.(((((((((({...(({,({(({(({...(((((((((((((((((.(((((...))))).)))))........,,{(((((.....}}..}))).,}((((....)))}{(.(((((((((((((.........)))))...)))))))).)....{{((((((.((((..(((..(((.....)))..)))..)))).))).))).}})))),})))))))...||}.||.|||,....,|||}|||.{{{,{{{{,,,.....}|||,}}}})))).,})))))))))))..,|.))},|,|||||||||}..,|}}|||||.,,.||||||{......{{|,,}}})))).{{{{|||.|{,,,||||||..,,..,,,((.((((.(((((((((.{{,{.,,..{{{,{||}.|,..({{.,(,((({{(((.({....(((.(((((((..((((((.((((({,{...........(((((.((((.{....}))))))))).{|{.,{{|,.....,{||.(((({...})))).||||..,,,,...,.}})},,}))}}}.....))},}},))).)))))).)))))))))).}).))}.)))))})).,)).))))}})))).)))).))}}}})}.,}.}))).))),((((((|...})))))),))),))))))))..))))))).)))...))))))))).}),,...))))))}))))),,{,{{.....,})))))))))).,))))).,))))))))))))))))))........)).)).)))))..(((.((((((((({.((((..((((..(.(((.((((((((.((((((...)))))).)))}.,)))).))))..)))).(((((.((((........)))))))))((((((((((.((((((((((((.,(({.{{(((((((((((...(((.(,{(((.....))))))))))))).))))),|||}},,|||{,,,},))).))))))))))))(((.(((((.(((.((..(((......))).)).))).))))).)))(((...)))..)).)))))))))))).}.)))))))))....))).............