Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001394285.1

Sequence Length

2016 nt

GC Content

0.5000

AUCCUGUGUCUGAUCCUUGCUGCUGUGCAGGAUUACCGAGAGGAUGGGAUGGAUCUAGGCAGUGACGCCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCGCCAGUUCACAGUCCAACUCCACCAAAGUGACCCCUUGCUCCGAGUGCAAAUCUUCAUCGUCGCCGGGGGGCAGCCUGGACUUGGUGUCUGCCCUGGAGGACUAUGAGGAGCCCUUCCCGGUCUACCAGAAGAAGGUGAUUGAUGAGUGGGCGCCGGAGGAGGACGGGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGAGCGCGACCAGCGAGGGUACCGGGAUGACCGCUCUCCGGCCCGGGAACCGGGGGACGUAAGCGCCAGGACCCGCAGCGGCGGCGGCGGGGGCAGGAGCGCCACCACCGCCAUGCCGCCCCCGGUGCCCAACGGCAACCUCCACCAGCACGACCCCCAGGACCUCAGGCACAAUGGCAACGUGGUGGUGGCUGGCCGGCCGAGCUGUUCCCGGGGCCCCCGCCGGGCGAUCCAAAAGCCCCAGCCGGCUGGGGGCCGGCGCAGUGGCCGCGGCCCGGCGGCUGGGGGGCUCUGCCUUCAGCCCCCAGACGGCGGGACGUGCGUCCCCGAAGAGCCCCCGGUGCCACCUAUGGAUUGGGAGGCGCUGGAGAAGCAUCUGGCCGGGCUGCAGUUCCGGGAGCAGGAGGUACGGAACCAGGGCCAGGCGAGGACCAACUCCACCUCCGCACAGAAAAAUGAGAGAGAGUCUAUCAGACAGAAGUUGGCACUUGGAAGCUUCUUUGAUGAUGGCCCAGGAAUUUAUACCAGCUGUAGCAAAAGUGGGAAGCCAAGCCUUUCCUCCCGACUGCAGAGUGGGAUGAACUUGCAGAUAUGCUUUGUCAACGACAGUGGCAGUGAUAAGGACAGUGAUGCUGAUGACAGUAAGACUGAAACCAGCUUGGACACCCCCUUGUCUCCCAUGAGCAAACAGAGUUCUUCCUAUUCUGAUAGAGACACUACUGAAGAGGAGUCUGAAUCCUUGGAUGACAUGGACUUCCUUACAAGGCAAAAGAAAUUGCAAGCUGAAGCCAAAAUGGCCCUUGCCAUGGCCAAACCAAUGGCCAAAAUGCAAGUAGAAGUGGAGAAACAGAACAGGAAAAAGUCUCCCGUCGCUGAUCUUCUGCCACACAUGCCUCAUAUAAGUGAAUGCUUGAUGAAAAGAAGUUUAAAACCCACCGACCUGAGAGACAUGACUAUUGGGCAGCUACAAGUGAUAGUCAAUGAUCUCCAUUCCCAGAUAGAAAGCUUGAAUGAAGAGUUGGUCCAGCUGCUUCUCAUCCGAGAUGAGCUGCACACAGAGCAGGAUGCCAUGCUGGUGGACAUUGAAGACUUGACCAGACAUGCUGAAAGUCAGCAGAAGCACAUGGCAGAGAAAAUGCCUGCAAAGUGAAAAGAAGCCAUUCAACCAGAGAACAAGCUAGAAUUUAUUUUGCUUCUGUGGUUGUAAAAAUGCUGUUGCUAAAGGUGGCGCAGAAACAAAUAUCAGUGUUAGUCAUUGAUAAUGUCUGAAGCUUAAUGUCCAGUGAUUGGCCUUUGCUUCUUAAUUUAUUUUAAUUUUUUACUUGUGCCACUUAAUAUCAGGCAUUUUAAUAAAAUAUUGUUACAAAAAAUGUACAGUACUGACACCACCACAAAUCAUGGUUAAUAAAAGAGAGUAGUUUUAACUUUAUUUUUAUUUGUUUAGAGAUUUUAAGUUGGAACAGUAUUUUCCCAUUGACUACUUUUCAUUCUUCACUGUAGUUUUAAAGAAGAACUGUAAAUGACGGUGCUAUACAAGUCAAAAAAUACAUGCCUGCCUCGUAGUGAAGUUGUAGCUCUCCGUAAUAUGUAUAUUUUACUCAGUUUUCAACAUUUUGUGAAUGUUGACUACCUGAAGUUCCUUUUUAGAUGUGCUAUUAACAUUCUGUUGGAUUCAGAGGGUUCCUUGAAAGUUUUAUGUAUAAAUAUGUAAAAUAAAAAUUAAAACUUUGUUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-698.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -736.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 565.80

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.(...(((((((.((......)))))))))...).))))).((.((((....(((.((((.((.(((.((.((.((....)).)).))))).)))))).)))....)))))).(((.((((((((.(((((.((((..((..(((((((((((((.(((((.((.......))))))).))((((.(((((..((((....))))..))))).)))).....))))).))))))))..))))))))).)))((((((((((..((((((.(((((.(((.(((.(((((((..((((((((.....))(((((..((((((((.(((((((.......(((........))).((((((((((.((.(((......))).)).)))))..)))))))))))).)))..((((..((.((((((.((((....((((..((...))..)..)))...)))).))))))..))...))))..((((((((((((((((((((((((.........)))).....))).)))))))(((......)))((((((((((.(((((((((((........)))))))...))))(((((....)))))...(((((.(((((((((.((((.....)))).)))))))).)..)).))).))))))))))....))))))))))..(((.....))).))))).(((..((((((((((.((((((.((........)).).))).))((((((...(((((((..(....)..)))))))....))))))..((((............((((((.......((((((......))))))......)))))).(((((.((((((((((....)))..((((...))))(((((((.....((((((((((((..((.(((...(((.(((....))))))(((((......))))).....((((.......))))(((((.(((((.......((((.((((((.(((((((..(((....))).....)))))))))).....((((......))))........((((...)))).(((((..((((((......))))))....)))))))).))))......))))).)))))...))))).)))))))).))))))))))).......((((.(((((....)))))))))....)))))))...)))))...)))).((((((((((((((..((........))))))))).))).))))(((((..((........)).)))))..)))))))))).)))((..((((((...))))))..))....))))).)).)))).)))))))(((((((((.(.(((...((((((((((((...)))))....(((...((((.......)))))))..((((.........))))((((((.((((((((.((.....)).)))).)))).))))))........((((.((((....)))))))).......((((((((.....)))))))))))))))))))))))))))).))).))).))))).))))))..))............((((......((((......(((((((..((((((....)))))).......((((.(((((((.((.............((((((((....(((((((((((((((((.(((((((......)))))))...))))))))))..)))))))..)))))))).(((.((((((((..((......))..)))))).)).))))).))))))).)))).............)))))))......)))).....)))))))))))).....(((.....)))...((..(((((((((...)))))))))..))(((((..(((....(((((((.......))).))))..)))))))).))))).))).(((((((((........................)))))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((.(,..(((((({{((......))))))))).,.}.}))}|((((,(((...{(((.{(({,(({(((.((.((....)).)).))}||||..||||}}.{(((..((({.((....{..((((((.(((((.((((..{,,,(((((((((((((.(((((,((.......))))))).))((((.(((((..((((....))))..))))).)))).....))))),}))))))}..))))))))).)))..)))}.}},,..)),.}}}..))))..,|||...,.|||.((((((((((....{{(,{{.{|||{,{(({..|||||||.,,...{|{,,.,...,))}.((((((((((.((.(((......))).)).)))))..))))).))))))))))..{(({..{{.((((((.((((....({{{..((...))..)..}))...)))).))))))..))|||}||}..(((((((((((((((((((((({{.........}}}|..,|}))).)))))))(((......)))((((((((((,(((((((((((...,,.,,))))}}).,.}))}(((((....)))))...{{{((|{((((((((.((((.....)))).)))))))).|..}}.})}.))))))))))....))))))))))..((({.|{{.((.((((((.{{((({.....}}}..}||{{,|.,,......}}.}.},}.|||{(((({,.{((((((..{....}..)))))))}))))}.)))))).))..,},.}})).|||,,.,,....,|{(,..,)}..)))),))))))),.|||((((((((((.(((((({{{....|||,{((((..,,,,.||||||{.{,{{(((.((((,.(((((....}}}}}..))))...,}}||,||{,|{...}}})))),,....)))),....}))))).)))))))))).,,|{{{({{..((,..(((((((((({((({..(((.{{,..,{(((((,{{((.(((((...{{{{{|{{,,{.{{{,((({...}))).(((((..((((((......))))))....)))))..,.,(((((((,.|||.|..|||.....||}|}.||||)))..|}})).)))).,,.{{.((((.,{{||,,..))}))}))}..,,}|||||,.....,},,||,.,{.(({{((((((((((,.,{........}))))))))},)).))))}}|||..........,,}},{{{{{{{{{{|||{{{{{{{(,{.{(((....}})).}))}|)||,.,.(((((((..((((..(.(.(((((((({{,(.(((...((((((((((((...))))),...,((,..{(((,......}})))))...|||.........,,|,((((((.((({,,(({.({,......))))})))).))))))....,,,|(((,,((({...,})))))}}.......((((((((.....)))))))),)))))))))))))))))))).}}..)))).))))))),,,,{......,,}},,,,,,....{{(((...........)))))..,...}},,((((({{(((.....)))))))))........{,,,.......}))}........(((((((((((((((((.(((((((......)))))))...))))))))))..)))))))...,,))))))))))))))}}}}}}}}}}}}}}}.....||.|||{{...,,||}}||,,...}..}},,.......,.....))))).)))).)))))),,,},)))))|{(({{.((({{{{,,||(((((..(((((((((...)))))))))..),}))},}}.......,})}}))))}}}},|}},,}}},.))))))))),,,)))))).,,||((((({{({....}}})}}}}},......,,,,,,,,)}}}}}.