Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001394377.1
Sequence Length
7214 nt
GC Content
0.5542
ACAGUUGUUCCCCCAGCCCUGGCGGGGCGGGCAGCAUGGUUCACUCCAGCAUGGGGGCUCCAGAAAUAAGAAUGUCUAAGCCCCUGGAGGCCGAGAAGCAAGGUCUGGACUCCCCAUCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAAUGGACCAGACACUAAUCAUCAGAACCCCCAAAAUAAGACCUCCCCAUUCUCCGUGUCCCCAACUGGCCCCAGUACAAAGAUCAAGGCUGAAGACCCCAGUGGCGAUUCAGCCCCAGCAGCACCCCUGCCCCCUCAGCCGGCCCAGCCUCAUCUGCCCCAGGCCCAACUCAUGUUGACGGGCAGCCAGCUAGCUGGGCUCACGGCACUGAUGCCAGCUCAGCAGCAGCUCCUCCUGCAGCAAGCCCAGGCCCAGCUCCUGGCCGCCGCCGUGCAGCAGUCCAGUGCCGCCGCUGCCGCUAACGCCGCUGCCGCCGCCGCCGCCGCCUCCGCCUCCUCCUCUACUUCCUCCUCCUCCUCCUCCUCUGCCUCCUCCUCGACCUCACAGCCCCCAGCCUCCUCUGGGGGGGGUGACCUGCCACCACCACAGCCUGCCAGCCAGCCCCCUGGGACCCCACAGCUCACCUUGUCCCAACCCAUCCAGCUCACAGCACAGGACAUACAGCAGCUCCUCCAGCUCCAGCAGCUGGUGCUUGUGCCAGGCCACCACCUCCAGCCACCUGCUCAGUUCCUGCUACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCUGCUACCGACACCAAAUCUAUUCCAGCUACCUCAGCAAACCCAGGGAGCUCUUCUGACCUCCCAGCCCCGGGCCGGGCUUCCCACACAGGCCGUGACCCGCCCUACGCUGCCCGACCCGCACCUCUCGCACCCGCAGCCCCCCAAAUGCUUGGAGCCACCAUCCCACCCCGAGGAGCCCAGUGAUCUGGAGGAGCUGGAGCAAUUCGCCCGCACCUUCAAGCAACGCCGCAUCAAGCUGGGCUUCACGCAGGGUGAUGUGGGCCUGGCCAUGGGCAAGCUCUACGGCAACGACUUCAGCCAGACGACCAUUUCCCGCUUCGAGGCCCUCAACCUGAGCUUCAAGAACAUGUGCAAACUCAAGCCCCUCCUGGAGAAGUGGCUCAACGAUGCAGAGACUAUGUCUGUGGACUCAAGCCUGCCCAGCCCCAACCAGCUGAGCAGCCCCAGCCUGGGUUUCGACGGCCUGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCAUCGAGACAAACGUCCGCUUCGCCUUAGAGAAGAGUUUUCUAGCGAACCAGAAGCCUACCUCAGAGGAGAUCCUGCUGAUCGCCGAGCAGCUGCACAUGGAGAAGGAAGUGAUCCGCGUCUGGUUCUGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCAUCAACCCCUGCAGUGCGGCCCCCAUGCUGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCUACAGCCCCCAUAUGGUCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCUUACCGUUGUCCCAAGCUUCCAGCAGUCUGAGCACAACAGUUACUACCUUAUCCUCAGCUGUGGGGACGCUCCACCCCAGCCGGACAGCUGGAGGGGGUGGGGGCGGGGGCGGGGCUGCGCCCCCCCUCAAUUCCAUCCCCUCUGUCACUCCCCCACCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCCAGCCCUCAAGGCAGCCACUCGGCUAUCGGCUUGUCAGGCCUGAACCCCAGCACGGGCCCUGGCCUCUGGUGGAACCCUGCCCCUUACCAGCCUUGAUGGCAGCGGGAAUCUGGUGCUGGGGGCAGCCGGUGCAGCCCCGGGGAGCCCUGGCCUGGUGACCUCGCCGCUCUUCUUGAAUCAUGCUGGGCUGCCCCUGCUCAGCACCCCGCCUGGUGUGGGCCUGGUCUCAGCAGCGGCUGCGGCUGUGGCAGCCUCCAUCUCCAGCAAGUCUCCUGGCCUCUCCUCCUCAUCCUCUUCAUCCUCAUCCUCCUCCUCCUCCACUUGCAGCGAGACGGCAGCACAGACCCCUGGAGGUCCAGGGGGGCCCGAGGCAGGGUCCAAACCUGAGUGAGGGCCAGCCAUGCCUCCCCUCCCAUUCCUCUGGUCCCUGCCUUGGUCCCUUGCCUGGGAAGAGGGCGAGGAGGCCAGUGGUGGGGACGCAGAGGGUCCUCAGAGCAGGAGUGACAAGGGAGGAAAGACCAAAAAAACAACCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAACUAACCAACAAAAGAGAAAACCAAAAAUAAUCACAACAGAAACCAGCUGCCCCAAAGGAACCAGAGGUGAAAAACAAACAAAAAAAAACCAAAAACAAACCAAAAAAAAAAAAAACCCACAAAAUCAAACAAACCAAAAAACCAGUCGCGAGCCAGACCUCAGCGUGCUCACCCUCACUGCUACGACGCCAAAUAAAAACCCCAGCCAGGGGCGGAGAAGCCUCCAGCAGGUCAGACCUCAUGCCACCGAGCCCUGGCUGUGGGACCAACCCCCAACCCUGCCUCCCCCGUGGGGGCUACAGAAGGAAAAAGAGAAGAUGCCAGCUUCCUAAUCCCAGCCCCCAGCCCUGGGCCAGCGAAGACAGGGCACAGCCUGGGCAGAUGGGCUGGGGCUUAGCACCACCCACCAAAUGUUCUUUUCCAGAAGGUGAAAGAGAAAGGGCCUGAACAACCUUACACCAAAUAUUCAGUAGCUUCAUCCAAAGGAUGUACAGAAUUUUUAGCAUUGUGCUCAACAGAAUGUGUCCCUACCAUGUGUCCCCUUCUCCCCUGGCCCCCAGCUCUCCCCACCUGGGCAGGGGGUCUUGCUUUAACCUCCUCCCUCCCCCCAGCAGGGGAGAGUUCAAGGGAAGGCCUGCGGACAACUUUUCAUCCCCUGUUCCUCCCUCUUUUCCCCUUUGAAGGGUGGGCUAGGCCAUUUUGCCAAGUUCUAGCUCUCACAAGUCCCUCCUCAACCCUGUCACCCUCCUCUGCUCUGGAACUGACUCCCUCCCCAGCCUAUGGGAAGGUGGAAAUUUCAGGCAAGAGGGGAUGAAGACAUUCAGUUGAGGGCAUUCAGUUGUCUUUUUCCAUCCUGUCUGUUUCCCUGAAAAAAAAAAAAAUUCAUAUUCCAGUGCCUAUCCGUGGGAUCCUUCACGUUCUUUGACAUUAACCAGAAACCAAAAAGAGAACUCACCUCGCUUUUCCCACCCUGUGCCCCUCUGGUACUGGCGAAUGCCUCUCCCUCCCCCCACAUGCACGCACGCACACACCCCAGUGGUGGGGUUCCUCGAGAUGGCAUCCCCAUCAGGGUCCAUGUGGUGGGGACAGUGCCACAGCCUGUGGUCCCCAUCUGAGAGGGCGCGGUGGUGGCCACCACUCCCACAAGACCUCCACAACUCUUGGCUGGACCCUGUGUUUGACCAGCCCCGGACACGUCUCCACUGACGACGGACAGAGGAGAGACACCACUGGGAGCCACCCUGCCCUCCUGCUAUUGUGGAGGCCAACAAAGUUUUGAACCGAAAACCAAAAAAACAGAAACAAACAAACAAUAAAUUUAAACUAGAAAAAAAAUUUAUAUAUAUAUAUAAACAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAAAAGGGAAAGAAGAUGAGGACUCUUCAAGAAUAAGAUGGAACCGCGAGGCGGAGCCAAGCCCCUGCACCGGUGGUCCAGGCCCUUGUUCCCCAAGGCGGAUGGAAGGACGGAUGCUUCUUUCUCUUCACAAAUACCUCAUGGACGUUGUCUUUGGGAAAGCCGGAGGGGGCGGCUGGGGCAGGGCCUGUCCCUCGGCCAGGGCAGAUGGAAGCGGGUGGGCGGGGCUGAGAGAGGGUAUCAGGGACAGGGGUGAAGAGCCCCAAACUCCCCUCCCAAAUCAACUGAAAAAGCUUUAAAAAAAGACAGGAAAAAAAGGAGUAAGAAAGCAAAAAGAACAGAUGAAGGAAAACUUAACAACUUUUGGGUGGUUUGAUUCCUCCUUUGAUUUCUUUUUCGGUUCUCUUUUGUCUGACCUCUCUCCUCCCCUCCUUCCUCUCUCCUCCCCUCCUUCCUCUCUCCUCUCCUCCUUCCUGUCUCCUCUCUCUCCCUUUGCUCUCCUCUCUUCUCUCUCAAUCUUGUUCUUUCUGUGUCUCUCCUCAAACCAAAGUGUUGCAGUGAAGGACACGAGCCAUUGAAAUCAGGGUGGGGCCUGACAGCCGUAGUGUGGCCCCUGCCCCUUGUUGGGCAGGAGCAGAGAGAGAGGAGAGCCCUGAGACCGCAGGGCUUUGGCCUGGGCAGCUUCCACUUUCUGCCGGACACUCUGAGGAGAGGCAGAUGGAGCUCCAGGCCUCAGCGUUCUCUUUUUUCCUUGUCUCCCUUCUCCCACCCGGGAAAUGAAACUGUUGGGCUGGGCGACGGAGGCAGCAGAGACUCGGCCAUUGCAGGGGCCUCUGGGUGCCUUGUCCGGGCAGUGGUGAAGUAGCCGCCCCUCCCACCCCGGCACGAUGGGGCCUGGCACCUCGUCUACCCAACCUCACCGGAAUGUAAGCAUCUCCGCUGAACGACUCCCUGCCCUUACCCUACCUCUGAGUUUGUCCAUGUUUAUUUCCUGAAGAGAGAAGGGACUGGCAAGAGGGCUUGGGCCCCAGCCCAAGGGUGGAGAGGGGGCCAAGGGCUCCUGACCAAAUAGGAAGGACAUUUGAGCAGAGCAAAAUGAAAGGAAUUACAACCAAAAACCCCCUCCGAGAAGACAGGCAGCAUGGAAGGCAUGGUGGAGAUGACUCAAACAAAAACUAUGAUUCUAGACCAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAUCCAGGACUCACCACCACCCACUUCAUCCUGCUUCCUCCCCAUCAAGUCCCACCACCUGGGACCUCUCCCCACCCCAGUAUGUGGGAGUGGGGUAAAGAGGAGAGGAGGAGCAGGGGGCAGGGAUGGGGCAGAUGCCCUGAUGUUGGUGGAGGGACCCCUGUGC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2722.89 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2844.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 1685.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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