Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001394947.1

Sequence Length

2152 nt

GC Content

0.6413

GGGGCUGGGCCGGGCAGCUCCGAGUGGCGGCGCGCGGGCCAGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCGGAGCCGGAGCCGGGGCCGGGCGGCGCGCCUGUCGCCUGCGAGGCCGCUGGCCAGGCCUGAGCCUCUGCCACCAUGGCCAUUGUGCAGACUCUGCCAGUGCCACUGGAGCCUGCUCCUGAAGCUGCCACUGCCCCACAAGCUCCAGUCAUGGGUAGUGUGAGCAGCCUUAUCUCAGGCCGGCCCUGUCCCGGGGGGCCAGCUCCUCCCCGCCACCACGGCCCUCCUGGGCCCACCUUCUUCCGCCAGCAGGAUGGCCUGCUACGGGGUGGCUAUGAGGCACAGGAGCCGCUGUGCCCAGCUGUGCCCCCUAGGAAGGCUGUCCCUGUCACCAGCUUCACCUACAUCAAUGAGGACUUCCGGACAGAGUCACCCCCCAGCCCAAGCAGUGAUGUUGAGGAUGCCCGAGAGCAGCGGGCACACAAUGCCCACCUCCGCGGCCCACCACCAAAGCUCAUCCCUGUCUCUGGAAAGCUGGAGAAGGCAUACGAGGAGCGGCAGCGGCACUGGCAGCGAGAGCGUGAGGCCCUGCGAGAGGACUGUGCGGCCCAGGCACAGCGGGCACAGCGGGCCCAACAGCUGCUGCAGCUGCAGGUGUUCCAGCUGCAGCAGGAGAAGCGGCAAUUGCAGGACGACUUCGCACAGCUGCUGCAGGAGCGCGAACAGCUGGAGCGGCGCUGCGCCACCUUGGAGCGGGAGCAGCGGGAGCUCGGGCCGAGGCUUGAGGAGACCAAGUGGGAGGUGUGCCAGAAAUCAGGCGAGAUCUCCCUGCUGAAGCAGCAGCUGAAAGAGUCUCAGGCAGAGCUGGUGCAGAAGGGCAGCGAGCUGGUGGCUCUGCGGGUGGCGCUGCGGGAGGCCCGUGCUACGCUGCGGGUCAGUGAGGGCCGUGCGCGGGGUCUACAGGAGGCCGCCCGAGCUCGGGAGCUGGAGCUGGAAGCCUGUUCCCAGGAGCUGCAGCGACACCGCCAGGAAGCUGAGCAGCUGCGGGAGAAAGCUGGGCAGUUGGAUGCUGAGGCGGCCGGACUCCGGGAGCCCCCUGUGCCACCUGCCACCGCUGACCCAUUCCUCCUGGCAGAGAGUGAUGAGGCCAAAGUGCAGCGGGCAGCAGCCGGGGUUGGGGGCAGCUUGCGGGCCCAGGUGGAGCGAUUGCGGGUGGAGCUGCAGCGGGAGCGGCGGCGGGGUGAGGAGCAGCGGGACAGCUUUGAGGGGGAGCGGCUGGCCUGGCAGGCAGAGAAGGAGCAGGUGAUCCGCUACCAGAAGCAGCUGCAGCACAACUACAUCCAGAUGUACCGGCGCAACCGGCAGCUAGAGCAGGAGCUGCAGCAGCUCAGCCUGGAGCUGGAGGCCCGGGAGCUCGCUGACCUGGGCCUGGCCGAGCAGGCCCCCUGCAUCUGCCUGGAGGAGAUCACUGCUACUGAGAUCUAGGGCCCUCAGCAACCAGCUCUGUAGGGAGCUCUGCCAGAGGGGCAGCAGCUGCAGAUCCACUUAGGCCCCAGGGUCCACGGAUGGCCCCAAAGGCUGAGGGCCCCAAAGCCACUUGUCUCCUAGGAUCCAGGCCUCUGGGCUUCUGCCAAGAACUCAGGGUGGCCCUAUGACUUGGAGGAGCAAGAUCAGACCGCUCAAAGGUCCCCGUGUUCACUGUUACCCAGAGGCUCUUGUUACUACCCACUUCAUUCCCCACCGCUGCCAGUGCCACUGCCAACCCUGUUCACAGGCGCUUCCAGCCCACUCCAGCCAGGGGAGCAGGGAAGAAGAAGGGGCUCCCUCCUCUUCACAUUCCCCCCGACCCCAAAGCCAGAGAAAGCCAGAUGGCACCAGCUGCUCCGGAUGUGCCUGCCCACAUUGGGGGACAGGGCCGGGCCUGGGCUCGGUUCCCAGGUUUGAGCUCUGCAGCCUCUCUCCUGGAGUGAGGGGGCUGAAGUCAGACCAAAGGAAGAACUCAGAAAUGUCUUGUUUAUUUGUGUUUGUGACCAAGCAGCCUCUCCCUUCACCCAGGUUUAUGGCCUCGUUUUCACUUGUAUAUUUUUCACACUGUAAAUUUCUUGUACAAACCCAAAGAAAAAAUUAAAAAAAAUUUUUUUGUUUAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1017.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1050.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 575.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((((.(((.((.(((((....)).))))).))).))))...((((((((((((((((((..((((((((((((((.((((((((((.((((..(....)..))))))))(((.((((....))))..))).(((((((.((((.((((...)))))))))))).))).(((((....(((.(((((((((((((.((........))...))))))))...))))).)))...)))))(((((((((((((((.((((...((((((((((...((((((((((((((.(((.((((((..(((((((.......((((((.(((((((((.....(((...((..(((((((((((.((((((((.....((..((.((.(.(((((...(((((((..........))))).))....))))).).))))..)).(((...(((((..(.((((((.((((((.......))))))......((((((((((((.(((..((.(....((((.(((((.(((((((....)))))))))).....)).))))....).))....))).))).))).))).)))))).))).)..)))))..)))...)))))))))))))))))))..))....((((((.((((((...(((((((.((.(((((.(..((((((............)).))))...).))))).)).)))))))...)))))).)))))))))..))))))))).))))))..((((((...(((((((....)))))))....))....(((((((.((((........))).).)))))))(((((...))))))))).....(((...)))...))))))).))))))((((((((((((.(.((((((((......)))).)))).)))).))).))))))))))))).)))))))))).)))))).....)))))))).)))).(((..((((.(((.(((((((((((((((((.(.(((((((((....((....))..)))..)))))).)))))....(((((((((.(((.(((.(.(((..((((...))))..))).)..)))))).))))).((((((((.....((((.(.((.....)).).)))).....)).)))))).))))...(((((((((.((..((..((.(((...(((((.(.((.((.((((((.(..(.(((((((((.....(.((((((((((((..(((((..(((((((.((..(((((((((((...))))(((...(((((((.(((((..((.((((..((((.(((((......(((((....)))))((((.((..(((((..((((.((..((((((...)))))).)))))).)))))..))))))..............(((((((......))))))).))))).))))))))))..)))))))))).))....)))..(.(((((.(((...((((((....)))))).)))..))))).)..)))))))....(((...(((((...((((((..(((.(((......((((..((...))..))))....))))))..)))))).))))).)))((((((.(((((..(..((((...))))..).))))))))))).........)).))))))))))))..))))).))..))))).)..))))))))).)..))))))))).))))))))...))).))))..)).)))))))))...))))))..)))))))))))))))))..((((.(..(((((...(((((((......)))))))...)))))..)..))))..(((.((.....(((....))).....)))))((.((((((......)))))).))))))))))))).)))))).)))))))))..)))))..))))))..)))))...(((((.((((((((((((..(((((((((((.(((.((..((....))..)).))).)))).)))..))))....))))....))))))))))))).....))))))).......(((((((.....................))))))).)))...(((((((((......))))))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((((((((((.{(((((((({(,{{{{{{,{((({((((({{((((,{(((((((.(((,{.(({{{{({((((((((,,,..,)})))))}}..)))).)))))).)))))}.))))).))).)}.,}))}{{((.((((...))))))))))))))))))}})))}),{((.(((((((((((((.((........))...))))))))...))))).)},...(((((((((((((((({((((((((((({..,,...((((((..(((((....))))).........(((..((((((....)))))).)))))))))...{.(((((((......)))))))}))))).))))))).|{..((,((.{.(((((...(((((({..........))))).))....))))).).)},},,}|,,{{,.{{((,,,.}}}},,||.,{,(((.((((((((((((.....)))))......,.||....}}.,....((.((((.((.(((((((...(((((((..(((....{.((((((((((.(((((((((((((.,.{,,((.((((,,((,,{....}}}}}|))))},{||.{(({{(((.{.,..}))))....((((((.((((((...(((((((.((.(((((.(,.((((((,{....,,....)).)))).,.}.))))).)).)))))))...)))))).)))))))))).)))....(((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((((({{(((((((((((.((((........))),}.)))))}((((((...))))))(((..((((((((..(((((((((((((.({,(((({(((((((((.(,({((((((,,,.,.}}}}||}}}.)))).))).))))))(((((((((..(((.((((((((((.((...(((((((((((.(((((.{....,.}}|||.}.(((...(((((.(.(((((({((....{|,,,,|}..})),.)))))).))))))...))).{{|{|,....}))),.)))))))...,))).,.)).}))),)))},))..)))..)))))))))..,(((((.((((((..{{...,.{{({....{((.,{{(,(,{,.||{.{{{({(({(({,((((,((((((({({(..{({,,,{.(((((.(((((((..(((..(((.((({.(((((((..((.((((....(((((..,{{,.(((((.(.(((((.,...,.........,))))).).))))).)).)))))..)))).))....)).))))).,.....))).)))..)))((((((........)))))).))))))).))))).}))),,.}))))).)))}))})),))))})))))).})),)),,)))),}})).)))))).)))))|((((.{.......}.))))}...}))))).)),,)))))))))).}))}}))))..))).(((((.,{{||||}....{{.{{,.{{((...{||,|{,.,,.)})|}},...))))),}}))))}....}))))))))))))......)))))))).))((((((.(((((..{,,((((...)))}..}.)))))))))))..,....((((.......))))....}},}}.,.....))).)})})))))))).)).))).)))))........))))))))))))).)))))...((((....)))).)))))}.)))..)))))))..((((.(..(((((...(((((((......)))))))...)))))..)..))))....))))))).))...))))))....)))))))))){{{|{,,,...)))))}}})))))))))))}}})))))))))))}}))}.||{{{(,{|..,|..(((.....(((((.((((((((((((..(((((((((((.{((.((..((....))..)).))}.)))).)))..))))....))))}...})))))))))))).....)))..,}.....,.{((({{{......,....,.........}))}))),,,.,,,{((((((((......))))))))),}},.....