Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001395186.1

Sequence Length

2219 nt

GC Content

0.4317

CAUUUCGUCUUAGCCACGCAGAAGUCGCGUGUCUAGGUGAGUCGCGGUGGGUCCUCGCUUGCAGUUCAGCGACCACGUUUGUUUCGACGCCGGACCGCGUAAGAGACGAUGAUGUUGGGCACGGAAGGUGGAGAGGGAUUCGUGGUGAAGGUCCGGGGCUUGCCCUGGUCUUGCUCGGCCGAUGAAGUGCAGAGGUUUUUUUCUGACUGCAAAAUUCAAAAUGGGGCUCAAGGUAUUCGUUUCAUCUACACCAGAGAAGGCAGACCAAGUGGCGAGGCUUUUGUUGAACUUGAAUCAGAAGAUGAAGUCAAAUUGGCCCUGAAAAAAGACAGAGAAACUAUGGGACACAGAUAUGUUGAAGUAUUCAAGUCAAACAACGUUGAAAUGGAUUGGGUGUUGAAGCAUACUGGUCCAAAUAGUCCUGACACGGCCAAUGAUGGCUUUGUACGGCUUAGAGGACUUCCCUUUGGAUGUAGCAAGGAAGAAAUUGUUCAGUUCUUCUCAGGGUUGGAAAUCGUGCCAAAUGGGAUAACAUUGCCGGUGGACUUCCAGGGGAGGAGUACGGGGGAGGCCUUCGUGCAGUUUGCUUCACAGGAAAUAGCUGAAAAGGCUCUAAAGAAACACAAGGAAAGAAUAGGGCACAGGUAUAUUGAAAUCUUUAAGAGCAGUAGAGCUGAAGUUAGAACUCAUUAUGAUCCACCACGAAAGCUUAUGGCCAUGCAGCGGCCAGGUCCUUAUGACAGACCUGGGGCUGGUAGAGGGUAUAACAGCAUUGGCAGAGGAGCUGGCUUUGAGAGGAUGAGGCGUGGUGCUUAUGGUGGAGGCUAUGGAGGCUAUGAUGAUUACAAUGGCUAUAAUGAUGGCUAUGGAUUUGGGUCAGAUAGAUUUGGAAGAGGAAUGUCUGAUCACAGAUACGGGGAUGGUGGCUCUACUUUCCAGAGCACAACAGGACACUGUGUACACAUGCGGGGAUUACCUUACAGAGCUACUGAGAAUGACAUUUAUAAUUUUUUUUCACCGCUCAACCCUGUGAGAGUACACAUUGAAAUUGGUCCUGAUGGCAGAGUAACUGGUGAAGCAGAUGUCGAGUUCGCAACUCAUGAAGAUGCUGUGGCAGCUAUGUCAAAAGACAAAGCAAAUAUGCAACACAGAUAUGUAGAACUCUUCUUGAAUUCUACAGCAGGAGCAAGCGGUGGUGCUUACGAACACAGAUAUGUAGAACUCUUCUUGAAUUCUACAGCAGGAGCAAGCGGUGGUGCUUAUGGUAGCCAAAUGAUGGGAGGCAUGGGCUUGUCAAACCAGUCCAGCUACGGGGGCCCAGCCAGCCAGCAGCUGAGUGGGGGUUACGGAGGCGGCUACGGUGGCCAGAGCAGCAUGAGUGGAUACGACCAAGUUUUACAGGAAAACUCCAGUGAUUUUCAAUCAAACAUUGCAUAGGUAACCAAGGAGCAGUGAACAGCAGCUACUACAGUAGUGGAAGCCGUGCAUCUAUGGGCGUGAACGGAAUGGGAGGGUUGUCUAGCAUGUCCAGUAUGAGUGGUGGAUGGGGAAUGUAAUUGAUCGAUCCUGAUCACUGACUCUUGGUCAACCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUCUUUAAGAAAACUUCAGUUUAACAGUUUCUGCAAUACAAGCUUGUGAUUUAUGCUUACUCUAAGUGGAAAUCAGGAUUGUUAUGAAGACUUAAGGCCCAGUAUUUUUGAAUACAAUACUCAUCUAGGAUGUAACAGUGAAGCUGAGUAAACUAUAACUGUUAAACUUAAGUUCCAGCUUUUCUCAAGUUAGUUAUAGGAUGUACUUAAGCAGUAAGCGUAUUUAGGUAAAAGCAGUUGAAUUAUGUUAAAUGUUGCCCUUUGCCACGUUAAAUUGAACACUGUUUUGGAUGCAUGUUGAAAGACAUGCUUUUAUUUUUUUGUAAAACAAUAUAGGAGCUGUGUCUACUAUUAAAAGUGAAACAUUUUGGCAUGUUUGUUAAUUCUAGUUUCAUUUAAUAACCUGUAAGGCACGUAAGUUUAAGCUUUUUUUUUUUUUAAGUUAAUGGGAAAAAUUUGAGACGCAAUACCAAUACUUAGGAUUUUGGUCUUGGUGUUUGUAUGAAAUUCUGAGGCCUUGAUUUAAAUCUUUCAUUGUAUUGUGAUUUCCUUUUAGGUAUAUUGCGCUAAGUGAAACUUGUCAAAUAAAUCCUCCUUUUAAAAACUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-643.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -690.10

Frequency: 0.0000

Diversity: 722.96

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((.(((((.(((((.......))))).)))))))))(((.(((((((((((.((((.((((((.((((((((..(.((((..((((...(((.((....(((......)))..)).)))..))))..)))).)..))))))..(((.((((((....)))))).)))((((.(....((((.(((((.((.......))..)))))...))))...).))))....(((((..(((((....((.((.(((((((((..(((((.((.((((((((((.............((..((((((((((.(((((((.((........(((.((..((((.((((.(((.((((((..(((((((((.(((..((....))...))).)))))))))..)))))))))))))..))))))))).)).)))))))..))))))))).)..)))))))).))))))))))).)))(((((........))))).....)))))).))))..))))).))))).((((......))))..)).))))))..)))).)))).(((((((((...)))))))))(((((((((((.........(((......((((((((((....(((.......................)))...))))).))))).....)))))))))..))))).......))))))).)))((((((((((((.(((((.(.(((((((.........)))))))((((((((((((((((((((((.(((..((((((((((((((.(((((((.((((((((((..(((((((....)))))))..)))))).........((((((((....))))))))..((((((((((((((..(((....)))...))))))))).)))))....(((.((((....)))).)))...((.((.((((((..(((((((.(.(((((((...........((((...((((((................))))))..))))..))))))).).))))))).........)))))).)))).((((..((.(((((((....((((.((((...(((((((....((((.((((.(((.((((....)))).)))..................(((((((.((.....)).)))))))((....))(((((....))))).............(((((((.((.....)).)))))))((....))..((.(((((((((.(.((((((...........(((.((((((.((...)).))))))))).......((((..((((.....))))..)))))))))).))))).))))).)).)))).)))).))))))))))).))))...))))))).))...))))(((((.(((......))))))))...((((.(((((((..((((((.(((..(((.((((....)))).)))(((((.....((((((((...(.(((......))).)....)))))))))))))...(((.(((.((........)).))).)))))).))))))..)))))))..))))............)))).))))))).)))..(((((.(((((((((((((((.((..((((..((.((((((..(((((...)))))..)))))).))))))..)).)))...........(((((....)))))..((((((.((....((...))....)).))))))......)))))))))))).)))))))))))))))))))))).)))))((......))..((((...(((((((((((.(......).))))).))))))...))))))))))))))).)))...((.((((.(((.......))))))).))((((((((((((((.((.((....)).)).)))))))).))))))..((((((..(((((((...((((((....)))))).....))))))))))))).)))))).))).)))))))))............((((((((.....((((...((((((.(((((((((.(((....(((((((.((((((((.((((.....)))).)))))))).......)))))))..))))))))))).((((..((((((((...))).))))).))))..).))))))...))))...)))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

...{(((.(((((.(((((.......))))).))))))))}..((((({(((((((,{{,({(((((((((((((((..(.((((..((((...(((.((....(((.....,)))..)).)))..))))..)))).)..))))))...,..,,(((,((((((|(((((||(((.({((.,((((.(((((,((......,))..)))))...}))}...,.})}}|...{{{....,{{{{.{{{...,,,}}}}}))))))))},}.)))))).))}.}))))))))...,,{....}||(((((((.((((((({({........{{{.(,.{((((.((((.(((.((((((..(((((((((.{((..{,....}}...))}.)))))))))..)))))))))))))..)))))}))}.,,.)))))))..)))))))))..,))...)))))))}((((..({{{,.(((((........))))),.}}))}}},.)))),{((((.((,{(((.((((......))))..,)))})).)))))|((((((((((((((((...))))))))).(((((((({,{{(,,,,,,{(({....}||((({,,,,.....,,({{{{{,,{{{{{(,{,{,{.{{{{{...|||,,.,||{|,{|,,|||||.,{|{|||,{{{,.,,,,,(((((((...,,((({,((((((({{{{(,((((({(({{,.,,..,|,}||||,(((({{,..{{{|,,,.||||.{{|,|||}}}|,}|||||{{{.,{{{,,}..|||||||||||.|||||||{{{|,{,|,||||||,||.....,.((((((((....))))))))|.((((((((((((((..(((....,)),..))))))))).))))).}....}}.}}}})))))))})))}}}||,|{,((({{{.}|||{{{{.|,|||{{{{.,..,,,,.,,||||.,,{({({{,{,..........,,.)}}}||,,|||}..}|||||}.|,||||}||,,,...,,{}|||||.||,|{,{{{..||.|||||||,||}{{{{.{{|{||.,{||||{....|||{.((((,(((.((((....)))).))).....|,,..........(((((((.((.....)).))))))).|}}}},)||,||}|},}))}}.............(((((((.((.....)).)))))))||,,}.}}.}))}})},||||(((,{({{((,.....||}..|,|}||||||,||,..})}))))),|||.{{,.{,(((.{{((((.....)))).)),))),),.),..))),)))}).))})))).))),.)}))})))))).}}}},,||||||||.(((....))).,{({{{...}}}}}..,,,||,..((((.((((((({{((((((.(,{{.,(({((({..|})))).,}}(({{(,,...((((((((...{,{{{......}}}.}},..)))))))),}}}}.,,||||{((.((,,.,,...,}.,}),}))))}.)))))).))))))))..)))).......,,,,,,||,,,||||,..})))}}}|}}}}}}},.,|,|||}}||||||{,,{||}||||..,||,||}|{{.(((({.((((((((.(((....(((((((.(((((((((((.(((((...{((((({({{{((({{{|,,,.{((((((..((((((((..(((((((({...,{{{,{(({....}}}}..,,.}}}})))))))))....))))),}))....(((((.,,,,((({{{.(({,||||,..,.,)),|,||})||..}}}))})))))........)))))))}}}}}}|{(((((....)))))||{{{(({..,.{{||,.,}.,,.}}}}||||{(((((((({((((,,{(((((((...((((((....)))))).....)))))))))))))....)),,))))),..,||....}}|||,,(((((((({......}))))))))...|||{{,{(({((({{.,,,..|}.,.},)))})))))))}}))))))))}.))).))))))))......))})))))...))).)))))))).}))))))}}}}}})},.,,}}}}}))))),........)))))))}......))))).