Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001395366.1
Sequence Length
2231 nt
GC Content
0.5267
GCCCGCUGCCGCCGCUGGGGCCCGAGAGAGGCGAGCCGGCGACGGCGGCGCUUCUGCGGCGGCCUCCUCCCUCCCCACCCGGUGCCGCAGGAUUGCAGCUGGCACUGGAGGGUGGGCAAGCUCGAGGGAGGGGCGCGGAGCCCCGGCGCGGAGCCGGGCGCGGGGCUUUGAUGGAUUUAGCUGCUUGCGCGAGCGCGUGUGUGCUCCCUGCCGCGGCGGCGGCGCCCGGGCCCUGCCGGGUCCGCACGAACCCCGAGCGCUUCCGAGGAGACCGGCUGGAGCGCCCGCCCCGCGGCCUCGCCUCUCCUCCGAGCAGCCAGCGCCUCGGGACGCGAUGAGGACCUUGGCUUGCCUGCUGCUCCUCGGCUGCGGAUACCUCGCCCAUGUUCUGGCCGAGGAAGCCGAGAUCCCCCGCGAGGUGAUCGAGAGGCUGGCCCGCAGUCAGAUCCACAGCAUCCGGGACCUCCAGCGACUCCUGGAGAUAGACUCCGUAGGGAGUGAGGAUUCUUUGGACACCAGCCUGAGAGCUCACGGGGUCCAUGCCACUAAGCAUGUGCCCGAGAAGCGGCCCCUGCCCAUUCGGAGGAAGAGAAGCAUCGAGGAAGCUGUCCCCGCUGUCUGCAAGACCAGGACGGUCAUUUACGAGAUUCCUCGGAGUCAGGUCGACCCCACGUCCGCCAACUUCCUGAUCUGGCCCCCGUGCGUGGAGGUGAAACGCUGCACCGGCUGCUGCAACACGAGCAGUGUCAAGUGCCAGCCCUCCCGCGUCCACCACCGCAGCGUCAAGGUGGCCAAGGUGGAAUACGUCAGGAAGAAGCCAAAAUUAAAAGAAGUCCAGGUGAGGUUAGAGGAGCAUUUGGAGUGCGCCUGCGCGACCACAAGCCUGAAUCCGGAUUAUCGGGAAGAGGACACGGAUGUGAGGUGAGGAUGAGCCGCAGCCCUUUCCUGGGACAUGGAUGUACAUGGCGUGUUACAUUCCUGAACCUACUAUGUACGGUGCUUUAUUGCCAGUGUGCGGUCUUUGUUCUCCUCCGUGAAAAACUGUGUCCGAGAACACUCGGGAGAACAAAGAGACAGUGCACAUUUGUUUAAUGUGACAUCAAAGCAAGUAUUGUAGCACUCGGUGAAGCAGUAAGAAGCUUCCUUGUCAAAAAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAAAACAAAACCACAAAUGACAAAAACAAAACGGACUCACAAAAAUAUCUAAACUCGAUGAGAUGGAGGGUCGCCCCGUGGGAUGGAAGUGCAGAGGUCUCAGCAGACUGGAUUUCUGUCCGGGUGGUCACAGGUGCUUUUUUGCCGAGGAUGCAGAGCCUGCUUUGGGAACGACUCCAGAGGGGUGCUGGUGGGCUCUGCAGGGGCCCGCAGGAAGCAGGAAUGUCUUGGAAACCGCCACGCGAACUUUAGAAACCACACCUCCUCGCUGUAGUAUUUAAGCCCAUACAGAAACCUUCCUGAGAGCCUUAAGUGGUUUUUUUUUUUGUUUUUGUUUUGUUUUUUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUACACCAUAAAGUGAUUAUUAAGCUUUCCUUUUUACUCUUUGGCUAGCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAUUAUCUCUUGGAUGACAUUUACACCGAUAACACACAGGCUGCUGUAACUGUCAGGACAGUGCGACGGUAUUUUUCCUAGCAAGAUGCAAACUAAUGAGAUGUAUUAAAAUAAACAUGGUAUACCUACCUAUGCAUCAUUUCCUAAAUGUUUCUGGCUUUGUGUUUCUCCCUUACCCUGCUUUAUUUGUUAAUUUAAGCCAUUUUGAAAGAACUAUGCGUCAACCAAUCGUACGCCGUCCCUGCGGCACCUGCCCCAGAGCCCGUUUGUGGCUGAGUGACAACUUGUUCCCCGCAGUGCACACCUAGAAUGCUGUGUUCCCACGCGGCACGUGAGAUGCAUUGCCGCUUCUGUCUGUGUUGUUGGUGUGCCCUGGUGCCGUGGUGGCGGUCACUCCCUCUGCUGCCAGUGUUUGGACAGAACCCAAAUUCUUUAUUUUUGGUAAGAUAUUGUGCUUUACCUGUAUUAACAGAAAUGUGUGUGUGUGGUUUGUUUUUUUGUAAAGGUGAAGUUUGUAUGUUUACCUAAUAUUACCUGUUUUGUAUACCUGAGAGCCUGCUAUGUUCUUUUUUUGUUGAUCCAAAAUUAAAAAAAAAAAUACCACCAACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-801.91 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -842.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 756.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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