Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001395492.1
Sequence Length
1800 nt
GC Content
0.6272
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACUCUCUCCCAGAAGGAGAUUGGCCUCACAUACCCCACUGACCCCUUCCUAGCAUGCUUUUUGCCAGACCCAUUGAGACUGGCUGAGGACUGGUUGCCAUAGAGAUGGCCUGUUAGGCAGUUCUACGGUGCGGAUGGGGGAUGGGGCAGGAUGGGGCAGGACACCGAUAUGCUAAAUACCUACCAACAGUUGGUUAGGACCCCGUCGGUGCGACCAGGGCAGGACGUGCGGCUCCAGGCUCCAGGAACCAGAACGGGGCUGCUCAAGCUGCUGUCGACCGUCUCUCAGGACAAGCAGGUGAGGGAGGCCCAGUGAGGACACUUCCAGCUGCCUAGAGCCAGUCACUUCCCGCUUCUUCCUCGGAAACCCUCCUUCCCCUUCCAGUGGGCCUGGGAGAGCAUCGCCACAGAUGUCCGGGCUGUGCUUCAGCCAAGCUCCCCAACCCCUGGCCACCAAGCCCUGCCCAUGCCCUCCUCGUUCUCCCAGCGUCAGUCCAGGCGCAAGUCCACGGCCAACCUCCCAGAGGCCCAUGGCUGCUGCUGGAAGACAGAGGCGCAAAACCUGAAGGCGAGACAGCAGCUGGGAGCCUGGGGCGGUGUCUCCAUCCCUACUGGCAAAGGGGAGCUAGGAUCAGAGCCCCCCAGUGGUCUCCAGCUGCCUGGGAGGAGGCCAGGAUCAGGAUCGGCGUCCGACAAGCAGGUCCAGCUGCAAAGCCUGGGUGCUGAGGAGGCCGAGAGGGGUCUGAGUUCUGGGGUGCUGCCCCAGCGCCCCAGGAGGGGGUCGAUCUCAGAGGAGGAGCAAUUUUCAGAGGCCACAGAGGAGGCUGAGGAGGGAGAGCACAGGACUCCCUGCAGAAGGAGGGCUGGUUGUCAGAGAAAGGGGCAGAUUUCUGGAGAGGAAGCCUCCGAUGAGGGAGAAGUGCAGGGCCAGAGCCAGGGGAGCAGCCCCAGCUUCAACAACCUCCGAAGGCGACAAUGGAGGAAGACAAGGGCCAAGGAGCUGCAGGGGCCAUGGGACCUGGAGAAGCUGCACAGGCAGCUACAGAGAGACCUGGACUGUGGCCCCCAAAAGCUGCCCUGGAAGACUUUGAGGGCUGCCUUCCAGGCCUCCAAGCGGAAUGGAAAGGCCUAUGCCUCGGGAUACGAUGAAACUUUCGUGUCUGCCAACCUCCCUAAUCGCACCUUCCACAAACGACAGGAAGCCACCAGGAGCCUGCUGCAGGCCUGGGAGCGGCAGCGGCAGGAGGAGCGGCAGCAGGCCGAGCUGCGGCGGGCCCGGACACAGCAUGUACAGCGGCAGGUGGCCCACUGCCUGGCAGCCUACGCACCCAGAGGGAGCCGGGGCCCUGGGGCGGCCCAGCGCAAGCUGGAGGAGCUGAGGCGCCAGGAGCGACAGCGCUUUGCUGAGUACCAGGCGGAGCUGCAAGGCAUCCAGCACAGGGUGCAGGCCCGGCCCUUCCUGUUCCAGCAGGCUAUGCAGGCCAAUGCCCGGCUCACCGUCACUCGGCGCUUCUCCCAGGUGCUGUCAGCACUGGGGCUGGAUGAGGAGCAGCUGCUGUCUGAGGCAGGAAAGGUGGACAGAGAGGGCACCCCCAGGAAACCCAGGAGCCACAGGUCAAUGGGGGUGAGAAUGGAGCACUCUCCUCAGAGGCCCCCAAGGACAGAACCCACCGGCAGCCAGCCUGACAGGCACUACAACCCCAGCCUGGACCCGGAGUGCAGUCCCUGAGAUAAAAUUAAAGGCUUUAUGGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-793.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -822.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 607.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((...(((((((...((.((((((((..(((((........(((((.....))))).((.((((.......(((((....(((.((((((((((((((((((((.(((...((((...(((((((((.(((.(((((....)))))((((((((((((.....(((((((.((((((....((((.(((((((..((...)).............((((((((...)))).)))).)))))))(((.(..(((((((((....(((((((((.(((((.........((((((((((((((...((((((((.............))).)))))((((.((((((..(((..(((....))).)))))))....))..))))....(((((((((((((....(((((((((..(((((((.....))))))).(((((......)))))...(((((.....)))))..(((((((...((.(((((.((..((((((....((((((((((...(((((.(((((......)))))........((((..((((((((.((((...))))(((.(((.....))).)))......((....)).......((((((((((.(((((((.(((((((...(((((.........)))))....))))....))))))))).).)).)))))))))))))))).)))).(((((....(((((.(((....((((..(((((((....)).)))))))))..))).)))))....)))))...(((((((((((((...)))))))))))))))))).........))))))).))).....))).)))......)).))))).)).))).)))).((((....))))..)))))))))(((.....))).....(((((...(((((....))))))))))...)))))))))))))(..(((....)))..).)))))))))).).))).....((((((..(....)..)))))).......)))))..)))))))))((((((((((..((.((...((((((....)))))).........)).)).))))))))))......)))))))))..))))((((((...((((((((..((.......))..))).))))).....))))))(((((((........)))))))))))....)))))).)))))))((((..........))))((((((.((.((((((((((((((((...((.((..(.......)..)).))..))))))....)))))))))))).......((.(((...))))).))))))..))))))))))))(((.(.......))))((((((((((.(((((....))))).))..(((((((.((..((((.(((.((.((....((((((((((........)))))))).))...((((((......))))))..))))))))))).)).))))))).((((.....))))....)))))))))))))).))))))...))))...((((((...)))))).))))))).)))))))))..)))).....))).)))...))))).....)))).))....)))))..)))))))).))...(((..(((((((......((((....))))......)))))))..)))........((((...((((.(((...((........)).))).))))..))))))))))).)))..............)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(.((((((((({(((.(((......(((((.(((.((((.(((.....(((((.....))))).(((((((...........(((((((((((((((.(.(((((((((((.......((((({(((((.(((((.{,.(((.((({,,|,{(((...})))|,})))).})}||,,.((((((({((((,(((,,{(((((((.(((((({..,.......((((((({...})))},)))..,.,)))))))...,,{((((.(((.(((((((((.((((..{.(((({(...((,(((((.(((.{.((((((((.............))),})))).),,)}},}}))).}}..))....)))).}..)))).))))).}.))).))).))||||{{.,,{{{,...,||||,}},{..(({(.(((..{((({(,(((((......))))}...(((((.....)))))..|)}}}}|..})))))|,......,,)))))))..,|)||)}))}}}}|}}}}(((((......))))).})))).)))))}(((,(((,,{(((((..((((((((((.(....({(.(........))))....).)).))))))))|)).}))),))).)))))))}.,,.....))))))))))).)))))))){((({,((({||..{(((((((||(||||||}|.))|)))),}|,,.....{{|{|.|||....,(((,.{{{{{||,,..,))))))))))),.)))}))))},.))))))))}.(((((((((((((...))))))))))))))))))))}..,,,...,)|)||,....,}}}.))))))}))))))).))).))))),,,.})).}})}.((((,{......))))(((((((((((.,.,...{(({,...,(((({,.,,{{..|||||,..{|{|||{{,|{|((.,(((,...|||.,({{|((((({({{{((({.....((((({..(....)..))))))......,||||...,,{|||,,.((((((((((..((.({.,.((((((....)))))).}.......)).)}.))))))))))....}})))))))})}}).},}}},))))})||||||(||(({(({...,,..)))}.,))))}..|}}}||{(((((((........))))))))}}}..{|||}||..||}||||((((..........))}}{({,{{,{|.{(((((((({{((({{,..{|}||.}|}}|,}}.}..||{||,{|,,((((((.|((((.((({{,((.,,..((.((({.{((({({{,,,,....)))))||{,.((....))..}}}(((((.(((((((((((((.(({(((((((....)))))....))}...}).))))).||....((((((((((......,.)))))))).))...((((((......))))))..,)))))))))))((({....))))))}.}))}.)),..,,))}))))).)))),.))))))|||||||{{{{{((({...)))))}}})}})}}.,))))))),}))}))}}},,.))},))..,))})),,}}.)})}.|{{{{{||,|,.,||}.|,,,.,.,.}||{..|||||||}.....{{{|},}}))))}},,,})))))),..}}),,.,,}}.||))))))))))),..(((((............)))))))))))).)).))}.|,|,.............}}|||....}}}...
Back