Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001395493.1

Sequence Length

1756 nt

GC Content

0.6270

UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACUCUCUCCCAGAAGGAGAUUGGCCUCACAUACCCCACUGACCCCUUCCUAGCAUGCUUUUUGCCAGACCCAUUGAGACUGGCUGAGGACUGGUUGCCAUAGAGAUGGCCUGUUAGGCAGUUCUACGGUGCGGAUGGGGGAUGGGGCAGGAUGGGGCAGGACACCGAUAUGCUAAAUACCUACCAACAGUUGGUUAGGACCCCGUCGGUGCGACCAGGGCAGGACGUGCGGCUCCAGGCUCCAGGAACCAGAACGGGGCUGCUCAAGCUGCUGUCGACCGUCUCUCAGGACAAGCAGUCACUUCCCGCUUCUUCCUCGGAAACCCUCCUUCCCCUUCCAGUGGGCCUGGGAGAGCAUCGCCACAGAUGUCCGGGCUGUGCUUCAGCCAAGCUCCCCAACCCCUGGCCACCAAGCCCUGCCCAUGCCCUCCUCGUUCUCCCAGCGUCAGUCCAGGCGCAAGUCCACGGCCAACCUCCCAGAGGCCCAUGGCUGCUGCUGGAAGACAGAGGCGCAAAACCUGAAGGCGAGACAGCAGCUGGGAGCCUGGGGCGGUGUCUCCAUCCCUACUGGCAAAGGGGAGCUAGGAUCAGAGCCCCCCAGUGGUCUCCAGCUGCCUGGGAGGAGGCCAGGAUCAGGAUCGGCGUCCGACAAGCAGGUCCAGCUGCAAAGCCUGGGUGCUGAGGAGGCCGAGAGGGGUCUGAGUUCUGGGGUGCUGCCCCAGCGCCCCAGGAGGGGGUCGAUCUCAGAGGAGGAGCAAUUUUCAGAGGCCACAGAGGAGGCUGAGGAGGGAGAGCACAGGACUCCCUGCAGAAGGAGGGCUGGUUGUCAGAGAAAGGGGCAGAUUUCUGGAGAGGAAGCCUCCGAUGAGGGAGAAGUGCAGGGCCAGAGCCAGGGGAGCAGCCCCAGCUUCAACAACCUCCGAAGGCGACAAUGGAGGAAGACAAGGGCCAAGGAGCUGCAGGGGCCAUGGGACCUGGAGAAGCUGCACAGGCAGCUACAGAGAGACCUGGACUGUGGCCCCCAAAAGCUGCCCUGGAAGACUUUGAGGGCUGCCUUCCAGGCCUCCAAGCGGAAUGGAAAGGCCUAUGCCUCGGGAUACGAUGAAACUUUCGUGUCUGCCAACCUCCCUAAUCGCACCUUCCACAAACGACAGGAAGCCACCAGGAGCCUGCUGCAGGCCUGGGAGCGGCAGCGGCAGGAGGAGCGGCAGCAGGCCGAGCUGCGGCGGGCCCGGACACAGCAUGUACAGCGGCAGGUGGCCCACUGCCUGGCAGCCUACGCACCCAGAGGGAGCCGGGGCCCUGGGGCGGCCCAGCGCAAGCUGGAGGAGCUGAGGCGCCAGGAGCGACAGCGCUUUGCUGAGUACCAGGCGGAGCUGCAAGGCAUCCAGCACAGGGUGCAGGCCCGGCCCUUCCUGUUCCAGCAGGCUAUGCAGGCCAAUGCCCGGCUCACCGUCACUCGGCGCUUCUCCCAGGUGCUGUCAGCACUGGGGCUGGAUGAGGAGCAGCUGCUGUCUGAGGCAGGAAAGGUGGACAGAGAGGGCACCCCCAGGAAACCCAGGAGCCACAGGUCAAUGGGGGUGAGAAUGGAGCACUCUCCUCAGAGGCCCCCAAGGACAGAACCCACCGGCAGCCAGCCUGACAGGCACUACAACCCCAGCCUGGACCCGGAGUGCAGUCCCUGAGAUAAAAUUAAAGGCUUUAUGGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-780.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -807.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 345.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((...(((((((...((.((((((((..(((((........(((((.....))))).((.((((.......(((((....(((.((((((((((((((((((((.(((...((((...(((((((((.(((.(((((....)))))((((((((((((.....(((((((.((((((....((((.(((((((..((...)).............((((((((...)))).)))).)))))))(((.(..(((((((((....(((((((((.(((((.........((((((((((((((..(((((((((.............))).)))))).......(((((((((((((....(((((((((..(((((((.....))))))).(((((......)))))...(((((.....)))))..(((((((...((.(((((.((..((((((....((((((((((...(((((.(((((......)))))........((((..((((((((.((((...))))(((.(((.....))).)))......((....)).......((((((((((.(((((((.(((((((...(((((.........)))))....))))....))))))))).).)).)))))))))))))))).)))).(((((....(((((.(((....((((..(((((((....)).)))))))))..))).)))))....)))))...(((((((((((((...)))))))))))))))))).........))))))).))).....))).)))......)).))))).)).))).)))).((((....))))..)))))))))(((.....))).....(((((...(((((....))))))))))...)))))))))))))(..(((....)))..).)))))))))).).))).....((((((..(....)..)))))).......)))))..)))))))))((((((((((..((.((...((((((....)))))).........)).)).))))))))))......)))))))))..))))((((((...((((((((..((.......))..))).))))).....))))))(((((((........)))))))))))....)))))).)))))))((((..........))))((((((.((.((((((((((((((((...((.((..(.......)..)).))..))))))....)))))))))))).......((.(((...))))).))))))..))))))))))))(((.(.......))))((((((((((.(((((....))))).))..(((((((.((..((((.(((.((.((....((((((((((........)))))))).))...((((((......))))))..))))))))))).)).))))))).((((.....))))....)))))))))))))).))))))...))))...((((((...)))))).))))))).)))))))))..)))).....))).)))...))))).....)))).))....)))))..)))))))).))...(((..(((((((......((((....))))......)))))))..)))........((((...((((.(((...((........)).))).))))..))))))))))).)))..............)))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{((((((((...(((((((...{(.((((((((..(((((..{..{,,(((((.....))))}.{{.,{{|.....,,((,(({.((((((((((((,(((((((((((((.(((...((((...(((((((((.(((.(((((....)))))((((((((((((.....(((((((.({((((,.{{((((,(((((((..{{...,,....|,,......((((((({...})))},))).)))))))(((.(..(((((((((....(((((((((.((({(,........(({,((((((((((..(((((((((.............))),}))))).....,,(((((((((((({....{(((((((,.{(((((.,{(({{{(||({{,(((((......)))))...(((((.....)))))..(((((((..{(((((((..,,..|||,,,{.{{.(((((,((((.((((((((((,,..{((((((||..((((..((((..((((((((.{(((...}})|(((.(((.....))).)))|,....||....}}}......((((((((((.(((((((.((({(((.,.(((((..,......))))},...)))}....))))))))).).)).)))))))))))))))).)))).)))},.{{{(({((.,||.....||{|,|||.,||}}...)))))))))))).))))),)))}.}}))),)}.,{((((((((((((...))))))))))))))))))}........}})),))}))...}}}),,,)})}.},..))})),,))))||||{{,{{.{{{..||||}}.,....))))}}))}}},.}),}.,...||||,...|||||||,|}}}}}}))))}..,)))))))))))),..(((....)))..).)))))))))).,.))).....((((((..(....)..)))))).......)))))..)))))))))((((((((((..((.((.,.((((((....)))))).}.......)).)}.))))))))))......)))))))))..)))),(((((...((((((((..((.......))..)))}}}))).....)))))|{((((((........)))))))))))..}})))))}.)))))))((((..........))))((((((.((.((((((((((((((((...((.((..(.......)..)).))..))))))....)))))))))))).......((.{({...})})).))))))..))))))))))))(((.{.......})))((((((((((.(((((....))))).))..(((((((.((..((((.(((.((.((....((((((((((,.....,.)))))))).))...((((((......))))))..))))))))))).)).))))))).((((.....))))....)))))))))))))).))))))...)))).,,{(((((...)))))))))})))).)))))))))}})|||,....,))}))),,,)),)).,}).)))),},....)))))..)))))))).)}...(((..(((((((......((((....))))......)))))))..)))........((((...((((.(((...((........)).))).))))..))))))))))).)))..............)))))}.........