Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001395494.1
Sequence Length
1032 nt
GC Content
0.6231
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACUCUCUCCCAGAAGGAGAUUGGCCUCACAUACCCCACUGACCCCUUCCUAGCAUGCUUUUUGCCAGACCCAUUGAGACUGGCUGAGGACUGGUUGCCAUAGAGAUGGCCUGUUAGGCAGUUCUACGGUGCGGAUGGGGGAUGGGGCAGGAUGGGGCAGGACACCGAUAUGCUAAAUACCUACCAACAGUUGGUUAGGACCCCGUCGGUGCGACCAGGGCAGGACGUGCGGCUCCAGGCUCCAGGAACCAGAACGGGGCUGCUCAAGCUGCUGUCGACCGUCUCUCAGGACAAGCAGGCCUCCAAGCGGAAUGGAAAGGCCUAUGCCUCGGGAUACGAUGAAACUUUCGUGUCUGCCAACCUCCCUAAUCGCACCUUCCACAAACGACAGGAAGCCACCAGGAGCCUGCUGCAGGCCUGGGAGCGGCAGCGGCAGGAGGAGCGGCAGCAGGCCGAGCUGCGGCGGGCCCGGACACAGCAUGUACAGCGGCAGGUGGCCCACUGCCUGGCAGCCUACGCACCCAGAGGGAGCCGGGGCCCUGGGGCGGCCCAGCGCAAGCUGGAGGAGCUGAGGCGCCAGGAGCGACAGCGCUUUGCUGAGUACCAGGCGGAGCUGCAAGGCAUCCAGCACAGGGUGCAGGCCCGGCCCUUCCUGUUCCAGCAGGCUAUGCAGCCCUGGUGCAGAGCAGGAAGCCGUCUUCUCUCUCCUCAGGCCAAUGCCCGGCUCACCGUCACUCGGCGCUUCUCCCAGGUGCUGUCAGCACUGGGGCUGGAUGAGGAGCAGCUGCUGUCUGAGGCAGGAAAGGUGGACAGAGAGGGCACCCCCAGGAAACCCAGGAGCCACAGGUCAAUGGGGGUGAGAAUGGAGCACUCUCCUCAGAGGCCCCCAAGGACAGAACCCACCGGCAGCCAGCCUGACAGGCACUACAACCCCAGCCUGGACCCGGAGUGCAGUCCCUGAGAUAAAAUUAAAGGCUUUAUGGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-435.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -453.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((...(((((((...((.((((((((..(((((.((..((((((.((....))......(((((((...(((((....((((.(((..((((.......(((((...........)))))..(((((((.(((((((....))))).....)).)))))))...))))))).))))..)))))...).)))))).(..((((....((((.....((((((((...)))).))))..(((((((((....((.((((.((((.....).)))..)).)).)).))).).)))))(((.(((..((((((((((.....((((((((...(((((((.(((..((((...(((.((((....))))..((((((((........)))))))).......)))....))))..(((((..........)))))......)))))))))).....))))))))))))))))))..))).)))((((((((((((((..((((.(((((.((.....((((.....(((.(((((((....))))))).).))...(((.(((((.((.........))))))))))..(((((....))))).((..((((((.(...((((.(((.((..((((((..((((((((....((((((((((((((......)))))).(((...)))...(((((....))))))).))))))))))))))..))))))..)).)))..))))).)))))).)).))))))))))).))))..))))))((((((((((((((((...))))).....))))..)))))))..))))))))...)))).....))))..)))))))..))....)))))..)))))))).))...(((..(((((((......((((....))))......)))))))..)))........((((...((((.(((...((........)).))).))))..))))))))))).)))..............)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((((((((...(((((((...{(.((((((((..(((((.{(..((((((((,....)),}....((((({{...(((((,,..((((.(((..((({,,,....(((((.{,,...,.|.}}}}},{((((({(.({(((((....))))),....)),))))))).,}))}}))).)))),.})))).,.}.)))))}.(..((((....((((.....((((((({...})))},))).{(({(({(((.,,,{,.{(((.(((,{.,,,|||||..||||,.},.}}}.}.,})))|{({(((..,(((((({{{.{{{.((((((((...(((((({{(((..((((...((,.((((....)))).,((((((((........)))))))).},....}})}...))))..(((((..........)))))......)))))))))).....)))))))))))),))))),,,,},))){|((((((((((((.,((((.(((((,((.,,..((.{{{...|||||,{{||{|{{.},|||||{|.,(({.{,,..,,.|}||..}}}}}}|},,|}))))||||((((....))))|,{({{{{({(({({{{((,({,.{,({{{{{{(((|.|,.||,||}||,||{||...((((((......)))))).{||.||||,,{{((((({{{{,|||||{.,,.))))))),)),.}))))))}}))}),},,))}.)})))),)))}..,)))}))))).)))),.)))))){{{{{{((((((((((...))))))}}),))))..))))))),.))))))))...)))).....))))..),))))),.)}....)))))..)))))))).)}...(((..(((((((......((((....))))......)))))))..)))........((((...((((.(((...((........)).))).))))..))))))))))).)))..............)))))}.........
Back