Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001399974.1

Sequence Length

2848 nt

GC Content

0.5590

GGGAGCAACGAACAGCCGCGGAGGCGACAGCUACCGCUUCAGAGGAGGCGGCCGCGGAGGAGGAGGAAGGGGAGGAGGGCGAGGCGGGAGGUGCAGGAGGGACCCUCGCCAUGGGUCCACGGGCCUAGAGUGGCGGAAGAUACCGGCCUGGUGCCAAACUGGCUACUGCUGCUUCCUGUGGCCUCCAUGGCUGAGGACUGGCUGGACUGCCCGGCCCUGGGCCCUGGCUGGAAGCGCCGCGAAGUCUUUCGCAAGUCAGGGGCCACCUGUGGACGCUCAGACACCUAUUACCAGAGGUACUGGCCCCACAGGAGACAGGAUCCGAAGCAAAGUUGAGCUGACUCGAUACCUGGGCCCUGCGUGUGAUCUCACCCUCUUCGACUUCAAACAAGGCAUCUUGUGCUAUCCAGCCCCCAAGGCCCAUCCCGUGGCGGUUGCCAGCAAGAAGCGAAAGAAGCCUUCAAGGCCAGCCAAGACUCGGAAACGUCAGGUUGGACCCCAGAGUGGUGAGGUCAGGAAGGAGGCCCCGAGGGAUGAGACCAAGGCUGACACUGACACAGCCCCAGCUUCAUUCCCUGCUCCUGGGUGCUGUGAGAACUGUGGAAUCAGCUUCUCAGGGGAUGGCACCCAAAGGCAGCGGCUCAAAACGUUGUGCAAAGACUGUCGAGCACAGAGAAUUGCCUUCAACCGGGAACAGAGAAUGUUUAAGCGUGUGGGCUGUGGGGAGUGUGCAGCCUGCCAGGUAACAGAAGACUGUGGGGCCUGCUCCACCUGCCUCCUGCAGCUGCCCCAUGAUGUGGCAUCGGGGCUGUUCUGCAAGUGUGAACGGAGACGCUGCCUCCGGAUUGUGGAAAGGAGCCGAGGGUGUGGAGUAUGCCGGGGCUGUCAGACCCAAGAGGAUUGUGGCCAUUGCCCCAUCUGCCUUCGCCCUCCCCGCCCUGGUCUCAGGCGCCAGUGGAAAUGUGUCCAGCGACGUUGCCUACGGGGUAAACAUGCCCGCCGCAAGGGAGGCUGUGACUCCAAGAUGGCUGCCAGGCGGCGCCCCGGAGCCCAGCCACUGCCUCCACCACCCCCAUCACAGUCCCCAGAGCCCACAGAGCCGCACCCCAGAGCCCUGGCCCCCUCGCCACCUGCCGAGUUCAUCUAUUACUGUGUAGACGAGGACGAGCUAAAGCGGCUGCUGCCCAGUGUCUGGUCAGAGUCUGAGGAUGGGGCAGGAUCGCCCCCACCUUACCGUCGUCGAAAGAGGCCCAGCUCUGCCCGACGGCACCAUCUUGGCCCUACCUUGAAGCCCACCUUGGCUACACGCACAGCCCAACCAGACCAUACCCAGGCUCCAACGAAGCAGGAAGCAGGUGGUGGCUUUGUGCUGCCCCCGCCUGGCACUGACCUUGUGUUUUUACGGGAAGGCGCAAGCAGUCCUGUGCAGGUGCCGGGCCCUGUUGCAGCUUCCACAGAAGCCCUGUUGCAGGAGGCCCAGUGCUCUGGCCUGAGUUGGGUUGUGGCCUUACCCCAGGUGAAGCAAGAGAAGGCGGAUACCCAGGACGAGUGGACACCAGGCACAGCUGUCCUGACUUCUCCCGUAUUGGUGCCUGGCUGCCCUAGCAAGGCAGUAGACCCAGGCCUGCCUUCUGUGAAGCAAGAGCCACCUGACCCAGAGGAGGACAAGGAGGAGAACAAGGAUGAUUCUGCCUCCAAAUUGGCCCCAGAGGAAGAGGCAGGAGGGGCUGGCACACCCGUGAUCACGGAGAUUUUCAGCCUGGGUGGAACCCGCUUCCGAGAUACAGCAGUCUGGUUGCCAAGGUCCAAAGACCUUAAAAAACCUGGAGCUAGAAAGCAGUAGACUGGAGGCUUCUACAGACUGUAGGAUUCAAGUCUGCAGGGCAGGCACUCGGGAAGGGAAGAUGGAUGUAAAGUGUGGGAGACCGAGGACACAGUGGAGCCCACGAGCACGAGCUGGAACCCACGAGGAUGGCCUGGAACCCAUGUCAGUCUCUCACCACCUCCAGCUUCGAUGAUGUGGGUGUCCUGCAGAAGAAGCUGGUGCCCUUCCUCACAGAGUUAAAUAUGCAUCUGGCCCAGGAAUUAGAGAAGCUGAAAGGAUGAUCCUGGGGAAGGUGGAGCAGCUGCAGGCCUGGCUGCAGGCCUGACUACUGCCCACACCAACGAGGUGAUCUAGCAGAUACAUGGCAACGUGUGAACUGCAACAACGCCUGGUGCCCCAGCACCAACCUUCCAAGUGUAAAAACAAUGUGCUGCUGCUUCACUUCCGCCCUCCGGUUAUCAAGCAAAAUGUCUCUUGUGGCCCAUCUUACUGGAAGAGAGUUCCGGGAAACAUAGCCUCACCAAGGUGACACAUUACAAAGCCACCCUACCAUGAAUCCGCUCCCAAGGGUCUCACUGCUCACCUGAGGAUAACUCAAUAUAACUAUGUGGCUGAAAAUGCAAAGCUGAAGACCAUGGAUUUCAUGGUGAUUCCAGCAAGUACAGAGAUUCUAUGAAGCCCACCCAGAAAAAACUUGCUGGUCCUGGCUAUUUUUGUGUCAUUUAUUCAAGUAUUGAGAACCUGGCCUGUGGUAGGCACUGUACUUAAUACUAGGAUACAGAAAUGCAAAAGAUACGGCCCAUGCAAUUUUAUUAAAUGCAUCAAUAUGUAUUACAAAUGGUGAAUGGAUUUCCAACUUUAUCAUGGAAUUUAAUGCUGAAUAUAUAGAAUUCAGAAAAUUGUUGGGAGGACAGCCCUUUUGUGAACCUUGUUUGGGGCACAGUAGGAAUUGGAAAUAAUUUAGUUUCUAUCUCUAAGCUGUUCUAUUUUAAAAUUAUUUUUAAAUUUUUAUUGUCCCACUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1124.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1171.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 669.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((.(((...((((((.(((....))).(((((((....))))))))))))).((..((((..((((.(((((..(((((((..((((((((((((..((((((((((((.(((((((....(((((((((.((...((((..((....))..)))))).)))))))))))))))).).))))))).))))...((((((.....)))))).(((.((((((((((.....))(((((....))))).)))))))).)))(((((((..((.(((..((((........)))).))))).)))))))...(((((((.....(....((.((((..((((((.((((((((.((((((((((((((((((((............(((((.((((.((((.(((((((.(((.((......)).))).))))).......)))))).)))).)))))...((((((((..(((........))).)))))).))..)))).)))))))))(((((((((((((((.((..((..(((.(((((((((((..(((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((((((......))).)))))).....)))))))).((((((....(((.......(((((...((...))..))))))))...)))))).....)))).))).)))))...)))).)).))))))))...))))).))))))....)))..)).....)).))))))))(((((...((((.(((((((((((((((((......))).))))).((((.((....))))))((((.(((.((((((...((((((...((.(..(((((((.((.(((.(..(((((.((((.(.((....))..).))))....)))))..)))))).))))))))))((((((....)))).))..((((.(((((........)))))..)))).(((((....))))).)))))).)))))).))).)))).....))))).)))).))))....)))))(((((..((((......(((((.(((((..(((((.....((((((.((((((...((((....))))...(((((....((((..(((.........)))..)))).)))))..........)))))).(((.((((...)))).)))....(((((..(((((......)))))..)))))..(((((((..((((......))))...))))))).(((((((..((((.(((((.((((......)))).)).((.(.((((...(((((..((((((((((((.........)))..(((((((.(((........))).)))))))((((.((((((((((((((....)))))))))))..)))..))))..(((((((.((((.((((..(((((........((((...))))(((((.((....)))))))...((((((((((((.(((((...))))).((.(.(((((((((....((((.(((.(.(((...((((.((....))))))...))).)))).)))).(((((((((((.......))))).....))))))))))))))).)...))....)))))..))))))).((.((.((((((((((((((....)).)))).)))))...))).))))...)))))..)))).)))).)))))))..((((....)))).........)))))))))......(((((((...(((.((..(((((((.((((((((....))))).........))))))))))..)).)))...)))))))(((((((...))))))).....)))))..)))).)))....))).)))))))))))........)))))).....).))))...((((...)))).....(((((((((......(((((((((.(((...))).)))).)).)))......)))))).))).))))).)))))....)))).....)))))...)))))))...........)))))))...)))))))).))).))).)))).))..)..))))))).((...((((.((((..(((((((((....)))))))).)..)))))))).))....(((((.....((((.((((((....))))))..)))).....)))))(((((....)))))..))))))..((......))..)))))).))))))).))))).))))..(((((.((((..........))))))))).......((((((.....)))))).........)))).))..(((((((((......(((((...(((((((((((((........(((((((..(((....((((.....)))).............((.......))..))))).))))).)))).)))))))))...(((((((((.......((((.((.....))...))))...)))))))))...))))).....)))))))))(((((.(((((((((.((...(((((...)))))...)).))))))))).)))))....................((((.((((((((....(((((((....)))))))....(((((((((((....)))..))))))))...........((((((.......))))))))))))))))))(((((((((((.(((((..((......))..))))).)))...(((((((......))))))).......))))))))..(((((((....)))))))..))).))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.(({.(((((((,{{{{.{||....}}|.}}((((((.(((((((((((,,((,(((({((,.{((,{(((.,((({(((,{((.(((((.{(,(({{{(({{((((((((.(((((((....(((((((((.,,..,{{{{,,,|||{{||..,))))}.)))))))))))))))).},))))))),|,||{((((({{((((((((((...((((((.,(((((((((({,.{,(({({{,|||||({({(.((((((.(((((((..((.(((..((((........)))).))))).)))))))...(((((({,({(((........)))...))))).))))))))))},,||||,...}}}.......))))),..,{|||,,.,)}}))))).))))))).....))))))..))).)))))),,))))}..(((((.......)}})))..((((((((..(((........))).)))))).))...{.(((((((((,{{((..((((((((({.((..((..(((.(((((((((((..(((((((((((((((((((.(((.(((((((((((,(((((((((......))).)))))).|,.,}}}}}))).{((((({,,.{,{....,,|(((((...{,...}}..)))))),}..,))))))...,})))).))).)))))...)))).)).))))))))...))))).))))))....)))..)}.....)).))))))))(((((...((((.((((((((((((((,,(,{{...)))}))))).((((.{{....}}))))((((.(((.((((((...((((((...{(,({,(((((((.((,({{.{..(((((.(({{.,,((....}}.,},}))}....)))))..}))))).)))}))),.}|}|||||.,.}|||{||,.{((({......}}}}.,..})}}}})},|,(((({....})))).)))))).)))))).))).)))).....)))))}}))).))))....)))))))..)).,}))))}})))))........}})))),},,.|{},...}.})})))))||{{.,.,))}))))))))})).}}}((((..(((.(((((......))))).)))..)).))....(((((((.((((..(((((((.((...,..(((((..(((((......)))))..))))}..(((((((..((((......))))...)))))))....{((((({({(.{(((,..{{.(((((.((.,,....((((((((((((((.(((...((..((({....}.})).))...(((((((.(((........))).)))))))((((.((((((((((((((....)))))))))))..)))..)))).(((((.(((((((((.((((((((....)))))..})).)))),.})))).))))).))).))).)))))))))))....,,.)).)))))..}),,}.,,})).))....)))))).)).)))))))..))))))))))))))..))))))),||.,((.(((((.((((...}))).})))).))},})}.)))).))))))).))))))...,|((.(((.......))).))....(((((((((((....)).)))).)))))..{{((((((((((.((.{..(((((((((((((......((((....}))).|,,,,{{{{{({((((((.....(((((({.,.(((.((..(((((((.((((((((....))))).........))))))))))..)).)))..,))))))),{{((((...})))}||,,,,,(({{((,,.|||}||,,{.,((,((({.,,,(({,((({,.{(((({(,(({{((((.{.,((((((((,,{{,{{(((((((((((......(((((((((.(((...))).)))).)),)))......))))))}||}.||.|||||||.,}|.|{.......))})}})}}}||||}},||{{{{....,,,}),)))}.{((((({,{{{......,,,......}}}))))))|{,,{((((.((((..(((((((((....)))))))).)..))))))})}}}....{((((.....((((.((((((....))))))..)))).....))))|(((((....))))),.)))))}.,||||....,}..,))}))},.))))}}}),,,}.))},,))}}.,}..||,...,{{,{||||}(((........((((((.....))))))........))),{{{..,,)})))}}.}}}},...}}}}}}}.}}.}|}}}}}{{|.,..{||||{{{..{|{{,...((((.....)))).,,.....,,}}}||},,.,,,}}...(((({{.((((((,...,))))))..}}||))).|}}}..}}}}|}}}.,|.||||}}}||}|.......,,})))}|{,|}||,(((((((((((.....,,{.(((((((((.((...(((((...)))))...)).))))))))).})))))))))))))....},,,,,.((((.((((((((....(((((({....}))))))....(((((((((((....)))..))))))))...........((((((.......)))))))))))))))))),}},))))))))))))...,,)).)))))))).)))},(((,,(((({{{....,,)))))))..)))..)))))))...(((((((....)))))))......})))))).....