Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001400623.1
Sequence Length
5891 nt
GC Content
0.4812
ACUCAUUCUCCGAUCAGCGCGUGAACGCAGCUCGGCUGCCGCUGGCAGGAAACAAUUCUGCAAAAAUAAUCAUACUCAGCCUGGCAAUUGUCUGCCCCUAGGUCUGUCGCUCAGCCGCCGUCCACACUCGCUGCAGGGGGGGGGGCACAGAAUUUACCGCGGCAAGAACAUCCCUCCCAGCCAGCAGAUUACAAUGCUGCAAACUAAGGAUCUCAUCUGGACUUUGUUUUUCCUGGGAACUGCAGUUUCUCUGCAGGUGGAUAUUGUUCCCAGCCAGGGGGAGAUCAGCGUUGGAGAGUCCAAAUUCUUCUUAUGCCAAGUGGCAGGAGAUGCCAAAGAUAAAGACAUCUCCUGGUUCUCCCCCAAUGGAGAAAAGCUCACCCCAAACCAGCAGCGGAUCUCAGUGGUGUGGAAUGAUGAUUCCUCCUCCACCCUCACCAUCUAUAACGCCAACAUCGACGACGCCGGCAUUUACAAGUGUGUGGUUACAGGCGAGGAUGGCAGUGAGUCAGAGGCCACCGUCAACGUGAAGAUCUUUCAGAAGCUCAUGUUCAAGAAUGCGCCAACCCCACAGGAGUUCCGGGAGGGGGAAGAUGCCGUGAUUGUGUGUGAUGUGGUCAGCUCCCUCCCACCAACCAUCAUCUGGAAACACAAAGGCCGAGAUGUCAUCCUGAAAAAAGAUGUCCGAUUCAUAGUCCUGUCCAACAACUACCUGCAGAUCCGGGGCAUCAAGAAAACAGAUGAGGGCACUUAUCGCUGUGAGGGCAGAAUCCUGGCACGGGGGGAGAUCAACUUCAAGGACAUUCAGGUCAUUGUGAAUGUGCCACCUACCAUCCAGGCCAGGCAGAAUAUUGUGAAUGCCACCGCCAACCUCGGCCAGUCCGUCACCCUGGUGUGCGAUGCCGAAGGCUUCCCAGAGCCCACCAUGAGCUGGACAAAGGAUGGGGAACAGAUAGAGCAAGAGGAAGACGAUGAGAAGUACAUCUUCAGCGACGAUAGUUCCCAGCUGACCAUCAAAAAGGUGGAUAAGAACGACGAGGCUGAGUACAUCUGCAUUGCUGAGAACAAGGCUGGCGAGCAGGAUGCGACCAUCCACCUCAAAGUCUUUGCAAAACCCAAAAUCACAUAUGUAGAGAACCAGACUGCCAUGGAAUUAGAGGAGCAGGUCACUCUUACCUGUGAAGCCUCCGGAGACCCCAUUCCCUCCAUCACCUGGAGGACUUCUACCCGGAACAUCAGCAGCGAAGAAAAGACUCUGGAUGGGCACAUGGUGGUGCGUAGCCAUGCCCGUGUGUCGUCGCUGACCCUGAAGAGCAUCCAGUACACUGAUGCCGGAGAGUACAUCUGCACCGCCAGCAACACCAUCGGCCAGGACUCCCAGUCCAUGUACCUUGAAGUGCAAUAUGCCCCAAAGCUACAGGGCCCUGUGGCUGUGUACACUUGGGAGGGGAACCAGGUGAACAUCACCUGCGAGGUAUUUGCCUAUCCCAGUGCCACGAUCUCAUGGUUUCGGGAUGGCCAGCUGCUGCCAAGCUCCAAUUACAGCAAUAUCAAGAUCUACAACACCCCCUCUGCCAGCUAUCUGGAGGUGACCCCAGACUCUGAGAAUGAUUUUGGGAACUACAACUGUACUGCAGUGAACCGCAUUGGGCAGGAGUCCUUGGAAUUCAUCCUUGUUCAAGCAGACACCCCCUCUUCACCAUCCAUCGACCAGGUGGAGCCAUACUCCAGCACAGCCCAGGUGCAGUUUGAUGAACCAGAGGCCACAGGUGGGGUGCCCAUCCUCAAAUACAAAGCUGAGUGGAGAGCAGUUGGUGAAGAAGUAUGGCAUUCCAAGUGGUAUGAUGCCAAGGAAGCCAGCAUGGAGGGCAUCGUCACCAUCGUGGGCCUGAAGCCCGAAACAACGUACGCCGUAAGGCUGGCGGCGCUCAAUGGCAAAGGGCUGGGUGAGAUCAGCGCGGCCUCCGAGUUCAAGACGCAGCCAGUCCAUAGCCCUCCUCCACCGGCAUCUGCUAGCUCGUCUACCCCUGUUCCAUUGUCUCCACCAGAUACAACUUGGCCUCUUCCUGCCCUUGCAACCACAGAACCAGCUAGGGAACCCAGUGCACCUAAGCUCGAAGGGCAGAUGGGAGAGGAUGGAAACUCUAUUAAAGUGAACCUGAUCAAGCAGGAUGACGGCGGCUCCCCCAUCAGACACUAUCUGGUCAGGUACCGAGCGCUCUCCUCCGAGUGGAAACCAGAGAUCAGGCUCCCGUCUGGCAGUGACCACGUCAUGCUGAAGUCCCUGGACUGGAAUGCUGAGUAUGAGGUCUACGUGGUGGCUGAGAACCAGCAAGGAAAAUCCAAGGCGGCUCAUUUUGUGUUCAGGACCUCGGCCCAGCCCACAGCCAUCCCAGCCAACGGCAGCCCCACCUCAGGCCUGAGCACCGGGGCCAUCGUGGGCAUCCUCAUCGUCAUCUUCGUCCUGCUCCUGGUGGUUGUGGACAUCACCUGCUACUUCCUGAACAAGUGUGGCCUGUUCAUGUGCAUUGCGGUCAACCUGUGUGGAAAAGCCGGGCCCGGGGCCAAGGGCAAGGACAUGGAGGAGGGCAAGGCCGCCUUCUCGAAAGAUGAGUCCAAGGAGCCCAUCGUGGAGGUUCGAACGGAGGAGGAGAGGACCCCAAACCAUGAUGGAGGGAAACACACAGAGCCCAACGAGACCACGCCACUGACGGAGCCCGAGAAGGGCCCCGUAGAAGCAAAGCCAGAGUGCCAGGAGACAGAAACGAAGCCAGCGCCAGCCGAAGUCAAGACGGUCCCCAAUGACGCCACACAGACAAAGGAGAACGAGAGCAAAGCAUGAUGGGUGAAGAGAACCGAGCAAAGAUCAAAAUAAAAAGUGACACAGCAGCUUCACCAGAGCAUUUCCAACACCACAGACACACACACGCACGCACACACACAAACACACAUGCACACACACACAUCUCAUUUCUCUAGUGUCUUUUGCCUUUAAAAAAAACUAAACAGAUAAAACAUGGGAAUCUCCUUUUUGUAGGUUUAUAGAAAGGGUCCCUUUGUUGCACACUCACUUGUAAGAAAAUGAGACAAAAAGGUUAAACCCACAGCCAAACUAGGACACUCCGUUCCCUGAAACCGUUAAAAAAUCAAACAAAAGGACCCCAAAUUAAGAAUCUAGGAAGCUCAGAAACGAAAUCUAGGUUCAGGAAGACCACACUUGGUGUUACCCGAUUGGCACAGACCAGUUUCAGAGAAAUACUUUCAGGCACUAAGACUAAUCGAAUGAACAAAGUCCACAGUUUAUUUUUAUACUUUCAGUCAAGUUUGAACUCUGUAAAACCUCAUAAAUAAGUUAUAAUUUCUGUUCACUUUGUAUUUGUUCAGUAUGCAAAGUGUGUCACCCUUUCUAGCUGAAUUCAAUUCCCACGUAGACUCUUAUUUUAUAGGACGAAUGCCAAAUUGCAGCUUCUGGGGGUAGAUCUCAAUUUGCAGUAUUCAGACUUCUUUUUCUUUCUUUUACAUUCUUUUUUCUUUCUUUCUUUCUGCCAACUUUGUUUUCCAGUGUUUACAAGGUGACAAAUGUUUGACUUUGGUUGUGUUUAAAUGUCCGUGUAAAAUAGCUGCCUUUUAUUUUUUAAGGUAACAAAUACCACCUAGAGGUAGGUAGGAUCAUCCCACGCUUGCUUUAGCACAGGACAACUUUACAAAACAUGAUUGUUUACAGCUGCUCUUCCCCUCUUUUCUGAUCUGCAGUUUUUGCCUGGGUCCCACUCAGGUGAAAAUCCAUCUCAUUCUGGAAUGGUUUUGCUUUUGAAUUUUUGGUUAUUUUUGUGUUUCUUUGGGGGUUAGACCACUUUCUGAUUAGCCGCCACCUGCCUGCAUCUGUGAAAAGGGAUCUGCUCCCAGGCGUUCUCACCCUUCUUUUGAAGGACUCCUUAGGCUUUGUUGAAUGAAGCAGAGAAGAUUGUAUAGUUGGGGCUGGUCUUGGUGAACACACAUUAUUACCCCACACAUCCCCUUUGUGUAGAAAGCCAAAUAAAAUCUAUACAUACCAUUUCCUUUUGAGCCCAGAAUCUAGAUUUGAGCGGAAGAGCAUGUGUGCUUCAGGGAAUUAGUGUCUUUUUUUGGAAAUCUGUUGAAGUAAAGUAACAUCGGCCUUCUGUUCACUUAGGCAGCAUUUAUAGAAACAAAAGAAGAAAGAAACAACCUACUGUCUGGAGUCAUAACACAACUUUCCUGGAUUGGAAACCAAGUGGGGGAAAAAAUACAGAAACUUUAAGGGGGAUGGGAGGGGGGGGAGAAGGGAAAAGCCAGCCCUUUGUAUAGAAAUUUUGCUUUUUUUUCCCUCAUUCUACUUUAGAACUGCAAGCUUGUGCACUGUGGAUGCGUGAAUAUUUUAGUGUGAAACGUGUUUUUGUCAUAGUAUUGAAAUAAAACUUCAACAUAGUUUGGUUGUGGAAGGUAUAGCAGAUAGUUCAGAAAAAAUAUUCAGGAAACAAAAAUCACUCAAACGGAAUCGAAGCCUUUUAACAAAGAAAAUGAAAUACAGAUGAUGAUGAUGAUGAUGAAGAUGAUGCUAAGUAAACAGAAAUCAGUACUCCGCAUGCGCUCCUCUCCUAAGGUACAAAGCAGCAAGAGGUUAGGGUGGCAAGGCUGCCUCUGGGUCCAUUCUGUGGGCCACUCUCCCCAACGUUCUGACACUUCUGCAGUCUGAUCAGUGGCGAUGCUAGAUUAUAAUUUCAAACUGUGAAGAAUAAUGGUCUUGUCAUUUGCUCAAUGUGGGGUUAUGUUGCAUUUUCUCAGCUCCUGGGGAUGGAAAUGGAGGAUCCCAGAACACACAGCCCUGGCCCCUUUGAUUCUAGGGCCUGCACAGAUCUCUGGUUCAAAUGCACAGGCCCUCAGAAUAGAGGAACAUGAAGAGAGAUCUUAGAGCACACAGUAGAAUGUGAGAGCCUGGGUGUCUGAGACCGGGAGGGCCCAGCAGUGAGGGGCAGGCUCUU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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1839.67 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1949.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 1345.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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