Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001400925.1

Sequence Length

2514 nt

GC Content

0.3620

GUAUUCAGCGGCGACAGCGGCGACUGCGGCGGCCGCGGGAGGGCAUCCCGUUGGGGAUCCUUCCGCACACUGAAGAGUACGUCUUCGGGUCUACCCCUAAUCACAUAAUGGCUGUGUUUAAUCAGAAGUCUGUCUCGGAUAUGAUUAAAGAGUUUCGAAAAAAUUGGCGUGCUCUUUGUAACUCUGAGAGAACUACUCUAUGUGGUGCAGACUCCAUGCUCUUGGCAUUGCAGCUUUCUAUGGCGGAGAACAACAAACAGGAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACUUCGUGAUCCACCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUAAAAUUACAGGCGUGAACCACCACCACAGUGGAGAAUUUACAGUCUCUCUCAGUGAUGUUUUAUUGACAUGGAAAUACUUGCUCCAUGAGAAAUUGAACUUACCAGUUGAAAACAUGGACGUGACUGACCAUUAUGAGGACGUUAGGAAGAUUUAUGAUGAUUUCUUGAAGAACAGUAAUAUGUUAGAUCUGAUUGAUGUUUAUCAAAAAUGUAGGGCUUUGACUUCUAAUUGUGAAAAUUAUAACACAGUAUCUCCUAGUCAACUACUGGAUUUUCUGUCUGGCAAACAGUAUGCAGUAGGUGAUGAAACUGAUCUUUCUAUACCAACAUCACCAACAAGUAAAUACAACCGUGAUAAUGAAAAGGUGGCCACGUCUUUUAUUAGAACAAUAGAGCUUGGAGGGAAAGGAUAUGCACCACCACCAUCAGAUCCUUUAAGGACACAUGUAAAGGGAUUGUCUAAUUUUAUUAAUUUCAUUGACAAAUUAGAUGAGAUUCUUGGAGAAAUACCAAACCCAAGGUCUCCCACACAGGUGAAUAAUUCGAUAAAACCCCUAAGAGAACGCAUCUGUGUGUCAAUGCAAGAGAAAAAAAUUAAGAGGGUGUAAAUCCAUCUGUUGGAAGAUCAACAAUUGGAACGAGUUUUGGAAAUGUUCAUCUGGACAGAAGUAAAAAUGAAAAAGUAUCAAGAAAAUCAACCAGUCAGACAGGAAAUAAAAGCUCAAAAAGGAAACAGGUGGAUUUGGAUGGUGAAAAUAUUCUCUGUGAUAAUAGAAAUGAACCACCUCAACAUAAAAAUGCUAAAAUACCUAAGAAAUCAAAUGAUUCACAGAAUAGAUUGUACGGCAAACUAGCUAAAGUAGCAAAAAGUAAUAAAUGUACUGCCAAGGACAAGUUGAUUUCUGGCCAGGCAAAGUUAACUCAGUUUUUUAGACUAUAAAUUUGUGUCUUAUAUGCUUUAGGUUUAUGUAUCUAUAAACCAUUCACCAAAGACAUGCUUAAUUUUUAAGAGAUCAAGGUGUAAAUUAUGAUGAUUUAUUAUUUUGGUCUACAGUGUAUGUAAGGUUAGUAUGUUAAGCAUUGUUUAAAAAUACUAGUAAGUCAUAAUUAUGCAGAAUUUUCACAAAGUUUAAUGCACAGAGAAAGCAUAUCAUUUCAGUUACUGAUACAUCUUAACACUACUUUCUUUUAAAACAGACAUUUAACAUACACAAGUUAUAGUAGCAGUAUGGGCUUCUCCUCCCAUUGGCAAUUAAAUGCUUUUAUUUUCUUCUGAAAAGAUGAUGUGGACCAACAGGUAUCAGACUUGCCAACAAGGUCGGUAGACUCUUCCCAGCAUACAUCUGAGCACUGAAGGAAGAAGAAAGUUUAAAUUGUUUAAAGGACUAUAAUUAUCACACAAAAUUUAUUAAGAAAAAAAGAAUGGAUCUAGUAUAACUAAUUCUGAGUAAACCAAAAUGAUAAUAAUUAAUUGUUGCUAUUUAAUCCCACAUUUUUGGCAGGUGUAAUUGAGCCAUGGUCUUAUUUGAUUUUGUUAUGAUUGCAUCCAAAUUCACUUUAACUCAGAGUUCUGUUUAAUGGUGGUAGGAUGUAAGAAUUGAAUUUUGAAAAGACUACUCACUGUCAAAAUCUCUCCUUCCUAUAGGAAAUUUAGCUGAGUUUUCUUCAUCCCCAAUUUCUCUCUUUUCUUGUGUUGAUUCAGUAUUCUGAACUCCAUUCUCAGCUGGGAAAGCUACAGAUCCUUUUAGUGCAAGAUAAGGUUUUAUAGCCAGAUUCAGUGGCAGACCAUGAUUUAAGAAAUUAUGUUUGGAGCCUGUGUUCUGUAAAGAGAAGGUUGAUUUGGUUUUUAGCUAUCGUAUUCGGAGUGGAACUAUAAUACAAUUGUAUAAUAUUCUUGUUGAUCAAUUCAAAGUUACUCUGCACUGUUUUUGACUUUUUAAAAAUACCUUAGAUGCAAAUUUAUAGGAGAAAAAACACUUUCAGAUAAGAGGUGUUUGCUGGGAUGGAAGAACUACCUGGCAUGUAAGAAAUAUCGUCAGUCGUCCUAAUGCAUAUUGUGACUGUUUGCAUAUACUUCUGUUUAUAAAAGUAUCAGUUUUACUUUUCAGAGGAUUUGUAAGAAUCAUUUAAAUUUUCAUUGAAAUAAACGACAAGUCACAUUGCCACUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-606.61 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -659.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 796.10

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((.(((((..(((((..(....)..))))).((((((.(((((....)))))))))))..((.(((((((.....))))))))).....(((.....(((((((((((........))).(((.(.(((((((......((((((((..((..(....)..)).))))))))....))))))).)))).((((((((((((.......((((((.((((((((........((..(((((.((.((.....(((((((..((((.....(((((.((....)).))))))))).)))))))......)).))...)))))..))........)))))))).......))))))......))))))).)))))......((((((((.(((((((....)))))))...))).......((((((((...(((((.......))))).....)))))).))))))).))))))))))).((((((((.((((.((((((.(((((((.........(((((.((..((((((..(.(((((........(((((((((((((......((((((..........)))))).............((((((.((...((((.......)))).)).))))))((((((.....((....))........))))))(((((((...((((((.(((....)))....(((((.((.(((((((.......(((......))).....))))))).))..))))).......((((((((.............))))))))(((((((((..(((((...))))).)))))))))(((((.(((((.............)))))))))).((((((((((.....(((..............)))....))))))))))((((((((((((((...........(((((....((((..(((((......)))))..))))..(((((((.....((((...((((....................................))))...)))).......)))))))....((((...(((.((((((.((((((((........(((((....)))))..(((......))).........((((((((.........((((....)))).(((........)))..(((......))).(((((((((....((((....(((((((.((((((.(((((((((.((......)))))))))))..))))))...(((((((.(((((((...(((((((((.((((((((....))))))))..........(((.((((..((((((((.((((((((((((((((((...))))))).)))))))))))(((((((...(((.((....)).))).)))))))))))))))...)))).))).......(((((((((((...)))))))..)))).....))))))))).......((((..((....)).)))).......(((........)))..........)))))))))))))).)))))))((......))(((....(((((((....((((((.((((((((((...((((((((((((((....)))......((((....))))(((....))).....))).))).)))))...))..))))))))..))))))...)))))))....))).....(((((((.......((((((.((((..........................)))).))))))......))))))).))))....)))))))))..........))))))))(((........))).(((((((.(((((..((...((..((((((((....(((((......(((....)))......)))))..))))))))..))..))..)))))))))))).)))))))).))))))..)))))))..(((((((((....))))))))).)))))............))))))))))))))(((((....))))).((((((((.((.((.((.((((((((((((((((..((((.((((((((((((..((((.......))))....((((((((...))))))))..)))))))).)))).))))...))))))...))))).....))))).)).)))).))))))))............))))))......)))))))......))))))...))))))).(((((((((....)))))))))((((((((....))))).))).....))))))..))))))..)).)))))(((((((.(((.....))))))))))..))))))))))))).)))).)))))))).....((((((((((((((.((.((((((.....(((((((.......))))))))))))))).)))).(((...........)))............))).)))))))))))).))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

......{(.(((({..(((((..(....)..))))){((((((.(((((....))))))))))),,.,.{{(((((.....)))))|||.....,||,...,.(((((((({{{,...,.,,||}.{(({({{{{{|||,.,,,,|(((((((..((,......},,}}.))))))))....}))||||,||||.({{{{{((((((,,|.,|.((((({,{(((((({...,....((..(((((.((.((.,...(((((((..((((,....(((((.({....}},})))))))).))))))).....})).}}...)))))..}}........))))))},......})))|||,..,.,|}}}}},})))}}......|,}}|)))}||||||{||||}},}}},||||||.....,|||||||||...,,((,,,{,...})))).,,..)))))).}}}}}}}.)))))))),}}.((((((((.((((.((((({{(((((((,.,{(((.,{{{.||,|..,,|,,|}}|.|}}}|.}||....((((((({{(((({{....((((((..........}}}||}..,,,,.,|||,.((((((,({...((((,,,....}))).}}.)))}}|((((((.....{{....}}........))))))|,{|{{|,..,|||,,..((,.{{|{|{,,.(((({.{{,|||||||,||,..,|,,..,,,.,||{,{,,,,}||}}.}}..))}))....,,.{{((((({..,......,.}.})))}}}}(((((((((..(((((...})))).)))))))))(((({{(((((.............)))))))))).((((((((((.....(((..............)))....))))))))))((((((((((((({........,(,((({{....((((..(((((.....,)))))..))))..(((((((.....((((...((((.............{{{.......}},......,,..))))...)))).......)))))))....{({{,..{((,((((({,((((((({.....,{.(((((....}}}}},,||,..,,.||||...,.....{(({{,,,...,...({((((....))))}.,||..{{{.{{{{..,||},.}},|||,,,,||||,,..,,{{,,...,{{|{{{{,,{{({{.{{{{{{{||,||,,..,})}}}|}}}|||,{||||||.,{(({{{{,,,,{{{|||{{{{{(({,,,.((((((((....)))))))).........,|||,|{(({{{...|||}}((((((((((((((((((...)))))))},)))))))))).,,{{{||||||||{{,{{{||,{{({{|,||||}}}}||}},,|}|||,||,.....,.{(({{((((({...}))))))..)))).,,,|||||,,}}|,,.|{{{{{{,{|,,||{{{||||.||{||}}..,},|,.{{{{||,......,,,,}}}}.|{|||||||,|||,,||(((.....,,,||},}.{((((((,{,.((((((.((((((((((...((((((((((({,.....||{{,,.,{{({|,,....}}|||}}},,,}..,,.)),}))).)))))...)}..)))))))),.)))))),}.))))))}....}}}.,,,.|||,,,,.......{{{{{{..,,.......,,}|,,,,||,|,,,})),,||||||||,}}....,,||}||||.|}},.,},)))}))}}}..........}}})))}}{{{{{{,|||||,,,,((((||.,,,||}},}},,,|,}||||||||....|{{{|,,.|}}|||}}}})))}))},}))))},,))))))))}})},})}.,|||}.,}|}},..})}))))).})))},.,|||}}}}..||||{{{{{....))))))))),})})),,..,,.,,,,,)))))))))))))){((((....))))}.{((({{({,(({({.{{.{{{{{{{{{{(((({{..{(({.{{{{(((((({{..({((.,..,,,)))}.||,((((((({...})))))))..}))))})).)))),)))}...}))))},,||}}}},,,,,))))).}}.},..,)))))})),.||,.{|||..,})))).,},..}}})))}...,,.)))))),..))))))}.{((((((({....})))))))}((((((((....))))).))).....{((((((({|......))))))))|((((((.(((.....)))))))))}..}}))))))))))).)))).)))))))).....((((((((((((((.((.((((((.....(((((((.......))))))))))))))).))))},............,{|,...})},.....})),}))))))})))).)}..