Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001406666.1

Sequence Length

1589 nt

GC Content

0.4355

GCAUUUUCUUCAACCAGGAGGUGAGGAGGUUUCGACAUGGCGGUGCAGCCGAAGGAGACGCUGCAGUUGGAGAGCGCGGCCGAGGUCGGCUUCGUGCGCUUCUUUCAGGGCAUGCCGGAGAAGCCGACCACCACAGUGCGCCUUUUCGACCGGGGCGACUUCUAUACGGCGCACGGCGAGGACGCGCUGCUGGCCGCCCGGGAGGUGUUCAAGACCCAGGGGGUGAUCAAGUACAUGGGGCCGGCAGGAGCAAAGAAUCUGCAGAGUGUUGUGCUUAGUAAAAUGAAUUUUGAAUCUUUUGUAAAAGAUCUUCUUCUGGUUCGUCAGUAUAGAGUUGAAGUUUAUAAGAAUAGAGCUGGAAAUAAGGCAUCCAAGGAGAAUGAUUGGUAUUUGGCAUAUAAGGCUUCUCCUGGCAAUCUCUCUCAGUUUGAAGACAUUCUCUUUGGUAACAAUGAUAUGUCAGCUUCCAUUGGUGUUGUGGGUGUUAAAAUGUCCGCAGUUGAUGGCCAGAGACAGGUUGGAGUUGGGUAUGUGGAUUCCAUACAGAGGAAACUAGGACUGUGUGAAUUCCCUGAUAAUGAUCAGUUCUCCAAUCUUGAGGCUCUCCUCAUCCAGAUUGGACCAAAGGAAUGUGUUUUACCCGGAGGAGAGACUGCUGGAGACAUGGGGAAACUGAGACAGAUAAUUCAAAGAGGAGGAAUUCUGAUCACAGAAAGAAAAAAAGCUGACUUUUCCACAAAAGACAUUUAUCAGGACCUCAACCGGUUGUUGAAAGGCAAAAAGGGAGAGCAGAUGAAUAGUGCUGUAUUGCCAGAAAUGGAGAAUCAGGUUGCAGUUUCAUCACUGUCUGCGGUAAUCAAGUUUUUAGAACUCUUAUCAGAUGAUUCCAACUUUGGACAGUUUGAACUGACUACUUUUGACUUCAGCCAGUAUAUGAAAUUGGAUAUUGCAGCAGUCAGAGCCCUUAACCUUUUUCAGGGUUCUGUUGAAGAUACCACUGGCUCUCAGUCUCUGGCUGCCUUGCUGAAUAAGUGUAAAACCCCUCAAGGACAAAGACUUGUUAACCAGUGGAUUAAGCAGCCUCUCAUGGAUAAGAACAGAAUAGAGGAGAGAUUGAAUUUAGUGGAAGCUUUUGUAGAAGAUGCAGAAUUGAGGCAGACUUUACAAGAAGAUUUACUUCGUCGAUUCCCAGAUCUUAACCGACUUGCCAAGAAGUUUCAAAGACAAGCAGCAAACUUACAAGAUUGUUACCGACUCUAUCAGGGUAUAAAUCAACUACCUAAUGUUAUACAGGCUCUGGAAAAACAUGAAGGAAAACACCAGAAAUUAUUGUUGGCAGUUUUUGUGACUCCUCUUACUGAUCUUCGUUCUGACUUCUCCAAGUUUCAGGAAAUGAUAGAAACAACUUUAGAUAUGGAUCAGCCUCUUAGGUUCAUUGGAGGAGCUUGGGAAUUCAACUGACACACGACAGAUUUACAGGAGAAAAGUUUUAUUUCAAGUACACAUGAGAGCUUCAUAGAAAAGAAGUGAAGACCUAAAGAAACAGACUGGAGAGUUCAUAUGCCAUUUUAAUAAAGGAUAAUGUAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-455.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -489.30

Frequency: 0.0000

Diversity: 506.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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