Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001406727.1
Sequence Length
1117 nt
GC Content
0.5640
AGUCCCCGCUGAGACUGAGCAGACGCCUCCAGGAUCUGUCGGCAGCUGCUGUUCUGAGAGACCAUGUCUGACAUAGAAGAGGUGGUGGAAGAGUACGAGGAGGAGGAGCAGGAAGAAGCAGCUGUUGAAGAGCAGGAGGAGGCAGCGGAAGAGGAUGCUGAAGCAGAGGCUGAGACCGAGGAGACCAGGGCAGAAGAAGAUGAAGAAGAAGAGGAAGCAAAGGAGGCUGAAGAUGGCCCAAUGGAGGAGUCCAAACCAAAGCCCAGGUCGUUCAUGCCCAACUUGGUGCCUCCCAAGAUCCCCGAUGGAGAGAGAGUGGACUUUGAUGACAUCCACCGGAAGCGCAUGGAGAAGGACCUGAAUGAGUUGCAGGCGCUGAUCGAGGCUCACUUUGAGAACAGGAAGAAAGAGGAGGAGGAGCUCGUUUCUCUCAAAGACAGGAUCGAGAGACGUCGGGCAGAGCGGGCCGAGCAGCAGCGCAUCCGGAAUGAGCGGGAGAAGGAGCGGCAGAACCGCCUGGCUGAAGAGAGGGCUCGACGAGAGGAGGAGGAGAACAGGAGGAAGGCUGAGGAUGAGGCCCGGAAGAAGAAGGCUUUGUCCAACAUGAUGCAUUUUGGGGGUUACAUCCAGAAGACAGAGCGGAAAAGUGGGAAGAGGCAGACUGAGCGGGAAAAGAAGAAGAAGAUUCUGGCUGAGAGGAGGAAGGUGCUGGCCAUUGACCACCUGAAUGAAGAUCAGCUGAGGGAGAAGGCCAAGGAGCUGUGGCAGAGCAUCUAUAACUUGGAGGCAGAGAAGUUCGACCUGCAGGAGAAGUUCAAGCAGCAGAAAUAUGAGAUCAAUGUUCUCCGAAACAGGAUCAACGAUAACCAGAAAGUCUCCAAGACCCGCGGGAAGGCUAAAGUCACCGGGCGCUGGAAAUAGAGCCUGGCCUCCUUCACCAAAGAUCUGCUCCUCGCUCGCACCUGCCUCCGGCCUGCACUCCCCCAGUUCCCGGGCCCUCCUGGGCACCCCAGGCAGCUCCUGUUUGGAAAUGGGGAGCUGGCCUAGGUGGGAGCCACCACUCCUGCCUGCCCCCACACCCACUCCACACCAGUAAUAAAAAGCCACCACACACUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-378.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -396.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 217.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.((.((..((...(.(((((..(.(((.((((((((((((.(((((....(((((.(((........))).)))))......................)))))...))))))))))))))).).))))).).(((((........)))))..))..)).)).))..)).)).)))....................................((.((((.......((....(((((((((((.......((((.((((.((((.(((((..(((.....(((((.........((((..(..((((....))))..)..))))..(((((.((((.((..(..((.((((......((((.((((((..((((..((..((((((((.......(((((((.........))).))))))))))))..))..)))).)).))))..))))..))))))...)..)))))).))))).......))))))))..).)))))))).)))))))).......)))))).....(((.(((((..(....((.((...(((.((((.(.(((((((.........((((((((............((((((((....).)))))))))))))))....((.((((..(((((((.((.(((.((((.............)))).))).)).(((((.(((((((((((.((..((..((((.......))))....))..)).)))))..((((.(.((((((...(((....(((((((((......(((.((((((..((((((..........((......)).........))))))....)))).)))))............)))))))))......(((((((....((...((((((.(((....))).)))))).))))))).))..))))))))).)..)))))))))).)))))...)))).))).)))).)).)))))))))))).))).))))...)..))))).)))((...(((((.((.(((...(((((......)))))...))).)))))))...)).))))).....)).......)))).)).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((((((.{..,{..{{...,.(((((..,.(((.((((((((((((.(((((....(((((.(((........))).))))).........|............)))))...))))))))))))))).}.))))).},|{||{.....{,,|||||..||.{{{{|,...,{{{{(,.{{|(.((((..............................,{.((((......}}}},..((((,,,,|||,......,|}}},|||},{||.,||{,..|||}}}}}}}}|{|,,.{{{,,,,{|,.|..{{,{,,,.}))}.....))))}.(((((.((((.((..,..((.((((......((((.(((({(..((((..((..((((((({......,{{,,((.(((......))).))))))))))))..))..)))).}).))))..))))..))))))...}..)))))).)))))..,.}})))).)}.|,.{{||,,,,,)}))||||,|{..{{{.||||||.....},|{,(({((,{..{{((,({...(((.((((.(.(((((((.........((((((((............((((((({....}.))))))))))))))).,..,{.((((..(((((((.((.(((.((((.............)))).))).)).(((((.(((((((((((.((..((..((((.......))))..,.))..)).)))))..((((.(.((((((...{{{....(((((((((......{((,({((((..((((((..,....,..{{......)).........))))))....)))).)),,}............)))))))))......(((((((....((...((((((.(((....))).)))))).))))))).))..})})))))).)..)))))))))).)))))...)))).))).)))).)),)))))))))))).))).}}}}{((((((((((.,,......,,)))))))||))}.(((((...}}})).))))))))},))}))...})).))),.}}))})........,}}}.,,.........
Back