Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001406765.1
Sequence Length
6871 nt
GC Content
0.5235
AGUCCCGCGACCGAAGCAGGGCGCGCAGCAGCGCUGAGUGCCCCGGAACGUGCGUCGCGCCCCCAGUGUCCGUCGCGUCCGCCGCGCCCCGGGCGGGGAUGGGGCGGCCAGACUGAGCGCCGCACCCGCCAUCCAGACCCGCCGGCCCUAGCCGCAGUCCCUCCAGCCGUGGCCCCAGCGCGCACGGGCGAUGGCGAAGGCGACGUCCGGUGCCGCGGGGCUGCGUCUGCUGUUGCUGCUGCUGCUGCCGCUGCUAGGCAAAGUGGCAUUGGGCCUCUACUUCUCGAGGGAUGCUUACUGGGAGAAGCUGUAUGUGGACCAGGCAGCCGGCACGCCCUUGCUGUACGUCCAUGCCCUGCGGGACGCCCCUGAGGAGGUGCCCAGCUUCCGCCUGGGCCAGCAUCUCUACGGCACGUACCGCACACGGCUGCAUGAGAACAACUGGAUCUGCAUCCAGGAGGACACCGGCCUCCUCUACCUUAACCGGAGCCUGGACCAUAGCUCCUGGGAGAAGCUCAGUGUCCGCAACCGCGGCUUUCCCCUGCUCACCGUCUACCUCAAGGUCUUCCUGUCACCCACAUCCCUUCGUGAGGGCGAGUGCCAGUGGCCAGGCUGUGCCCGCGUAUACUUCUCCUUCUUCAACACCUCCUUUCCAGCCUGCAGCUCCCUCAAGCCCCGGGAGCUCUGCUUCCCAGAGACAAGGCCCUCCUUCCGCAUUCGGGAGAACCGACCCCCAGGCACCUUCCACCAGUUCCGCCUGCUGCCUGUGCAGUUCUUGUGCCCCAACAUCAGCGUGGCCUACAGGCUCCUGGAGGGUGAGGGUCUGCCCUUCCGCUGCGCCCCGGACAGCCUGGAGGUGAGCACGCGCUGGGCCCUGGACCGCGAGCAGCGGGAGAAGUACGAGCUGGUGGCCGUGUGCACCGUGCACGCCGGCGCGCGCGAGGAGGUGGUGAUGGUGCCCUUCCCGGUGACCGUGUACGACGAGGACGACUCGGCGCCCACCUUCCCCGCGGGCGUCGACACCGCCAGCGCCGUGGUGGAGUUCAAGCGGAAGGAGGACACCGUGGUGGCCACGCUGCGUGUCUUCGAUGCAGACGUGGUACCUGCAUCAGGGGAGCUGGUGAGGCGGUACACAAGCACGCUGCUCCCCGGGGACACCUGGGCCCAGCAGACCUUCCGGGUGGAACACUGGCCCAACGAGACCUCGGUCCAGGCCAACGGCAGCUUCGUGCGGGCGACCGUACAUGACUAUAGGCUGGUUCUCAACCGGAACCUCUCCAUCUCGGAGAACCGCACCAUGCAGCUGGCGGUGCUGGUCAAUGACUCAGACUUCCAGGGCCCAGGAGCGGGCGUCCUCUUGCUCCACUUCAACGUGUCGGUGCUGCCGGUCAGCCUGCACCUGCCCAGUACCUACUCCCUCUCCGUGAGCAGGAGGGCUCGCCGAUUUGCCCAGAUCGGGAAAGUCUGUGUGGAAAACUGCCAGGCAUUCAGUGGCAUCAACGUCCAGUACAAGCUGCAUUCCUCUGGUGCCAACUGCAGCACGCUAGGGGUGGUCACCUCAGCCGAGGACACCUCGGGGAUCCUGUUUGUGAAUGACACCAAGGCCCUGCGGCGGCCCAAGUGUGCCGAACUUCACUACAUGGUGGUGGCCACCGACCAGCAGACCUCUAGGCAGGCCCAGGCCCAGCUGCUUGUAACAGUGGAGGGGUCAUAUGUGGCCGAGGAGGCGGGCUGCCCCCUGUCCUGUGCAGUCAGCAAGAGACGGCUGGAGUGUGAGGAGUGUGGCGGCCUGGGCUCCCCAACAGGCAGGUGUGAGUGGAGGCAAGGAGAUGGCAAAGGGAUCACCAGGAACUUCUCCACCUGCUCUCCCAGCACCAAGACCUGCCCCGACGGCCACUGCGAUGUUGUGGAGACCCAAGACAUCAACAUUUGCCCUCAGGACUGCCUCCGGGGCAGCAUUGUUGGGGGACACGAGCCUGGGGAGCCCCGGGGGAUUAAAGCUGGCUAUGGCACCUGCAACUGCUUCCCUGAGGAGGAGAAGUGCUUCUGCGAGCCCGAAGACAUCCAGGCUGAGAUGACCUUCCGGAGGCCCGCCCAGGCCUUCCCGGUCAGCUACUCCUCUUCCGGUGCCCGCCGGCCCUCGCUGGACUCCAUGGAGAACCAGGUCUCCGUGGAUGCCUUCAAGAUCCUGGAGGAUCCAAAGUGGGAAUUCCCUCGGAAGAACUUGGUUCUUGGAAAAACUCUAGGAGAAGGCGAAUUUGGAAAAGUGGUCAAGGCAACGGCCUUCCAUCUGAAAGGCAGAGCAGGGUACACCACGGUGGCCGUGAAGAUGCUGAAAGAGAACGCCUCCCCGAGUGAGCUGCGAGACCUGCUGUCAGAGUUCAACGUCCUGAAGCAGGUCAACCACCCACAUGUCAUCAAAUUGUAUGGGGCCUGCAGCCAGGAUGGCCCGCUCCUCCUCAUCGUGGAGUACGCCAAAUACGGCUCCCUGCGGGGCUUCCUCCGCGAGAGCCGCAAAGUGGGGCCUGGCUACCUGGGCAGUGGAGGCAGCCGCAACUCCAGCUCCCUGGACCACCCGGAUGAGCGGGCCCUCACCAUGGGCGACCUCAUCUCAUUUGCCUGGCAGAUCUCACAGGGGAUGCAGUAUCUGGCCGAGAUGAAGCUCGUUCAUCGGGACUUGGCAGCCAGAAACAUCCUGGUAGCUGAGGGGCGGAAGAUGAAGAUUUCGGAUUUCGGCUUGUCCCGAGAUGUUUAUGAAGAGGAUUCCUACGUGAAGAGGAGCCAGGGUCGGAUUCCAGUUAAAUGGAUGGCAAUUGAAUCCCUUUUUGAUCAUAUCUACACCACGCAAAGUGAUGUAUGGUCUUUUGGUGUCCUGCUGUGGGAGAUCGUGACCCUAGGGGGAAACCCCUAUCCUGGGAUUCCUCCUGAGCGGCUCUUCAACCUUCUGAAGACCGGCCACCGGAUGGAGAGGCCAGACAACUGCAGCGAGGAGAUGUACCGCCUGAUGCUGCAAUGCUGGAAGCAGGAGCCGGACAAAAGGCCGGUGUUUGCGGACAUCAGCAAAGACCUGGAGAAGAUGAUGGUUAAGAGGAGAGACUACUUGGACCUUGCGGCGUCCACUCCAUCUGACUCCCUGAUUUAUGACGACGGCCUCUCAGAGGAGGAGACACCGCUGGUGGACUGUAAUAAUGCCCCCCUCCCUCGAGCCCUCCCUUCCACAUGGAUUGAAAACAAACUCUAUGGUAGAAUUUCCCAUGCAUUUACUAGAUUCUAGCACCGCUGUCCCCUUUGCACUAUCCUUCCUCUCUGUGAUGCUUUUUAAAAAUGUUUCUGGUCUGAACAAAACCAAAGUCUGCUCUGAACCUUUUUAUUUGUAAAUGUCUGACUUUGCAUCCAGUUUACAUUUAGGCAUUAUUGCAACUAUGUUUUUCUAAAAGGAUGUGAAAAUAAGUGUAAUUACCACAUUGCCCAGCAACUUAGGAUGGUAGAGGAAAAAACAGAUCAGGGCGGAACUCUCAGGGGAGACCAAGAACAGGUUGAAUAAGGCGCUUCUGGGGUGGGAAUCAAGUCAUAGUACUUCUACUUUAACUAAGUGGAUAAAUAUACAAAUCUGGGGAGGUAUUCAGUUGAGAAAGGAGCCACCAGCACCACUCAGCCUGCACUGGGAGCACAGCCAGGUUCCCCCAGACCCCUCCUGGGCAGGCAGGUGCCUCUCAGAGGCCACCCGGCACUGGCGAGCAGCCACUGGCCAAGCCUCAGCCCCAGUCCCAGCCACAUGUCCUCCAUCAGGGGUAGCGAGGUUGCAGGAGCUGGCUGGCCCUGGGAGGACGCACCCCCACUGCUGUUUUCACAUCCUUUCCCUUACCCACCUUCAGGACGGUUGUCACUUAUGAAGUCAGUGCUAAAGCUGGAGCAGUUGCUUUUUGAAAGAACAUGGUCUGUGGUGCUGUGGUCUUACAAUGGACAGUAAAUAUGGUUCUUGCCAAAACUCCUUCUUUUGUCUUUGAUUAAAUACUAGAAAUUUUUUCUGUUUCCUAACUUCAUCAUUGAUUGUUUGAAAUCUUGGAGUUUCAAGCAUUUUUUUCAAGCUGAGACGGUUCCUUUUGCAUGCCUCCUGACUCACUGACUCCUCACUGGCUUUGUGUCUAGUGCCACACUCCAUUUGUGCUGACGAUGCUAUGAGGCUGGCCCGUGUGCACCCUCGAUUUGGAAGGUCCUCUUCUCCGUUGUAGGCUCAGACAACAGACGAGUGCCUCCUUUACGUUAGAGAAUGUUUUAUAGAACGUUUCCGCUGCAGUAAGCCAUUGAGUGCAGCAGUGUGCUGUUGCCCUACACUGCCUUAGAAAAAGAGUUAAGCAGUUCGACAAAUAUACAUCAGAUUAGAGAGUCUCAAGUUCAUAAAAGUCAAAAUUGGUAGUGUCUGUUAAGUUACAUUUACCAAGAGAGCACAUGAUAUUUCCCCUAACUAUAACAGUGUUUUUGGAAACCUGGAACACAAAACCAUUAAUAUAAUUGGCACAGAAACCACGAGUUUGGUUUGAACAUCAAAGGGAGUUUUGCCAAGGCCUUACUGUCUGCACUUGAAGUUUUGGUUCUUCAGUGCAGAACAAAUGAUCUGUUUUCAUUUUUAGGCAUGUCAGACCCGAACUGGCCUGGAGAGAGUCCUGUACCACUCACGAGAGCUGAUGGCACUAACACUGGGUUUCCAAGAUAUCCAAAUGAUAGUGUAUAUGCUAACUGGAUGCUUUCACCCUCAGCGGCAAAAUUAAUGGACACGUUUGAUAGUUAACAUUUCUUUGUGAAAGGUAAUGGACUCACAAGGGGAAGAAACAUGCUGAGAAUGGAAAGUCUACCGGCCCUUUCUUUGUGAACGUCACAUUGGCCGAGCCGUGUUCAGUUCCCAGGUGGCAGACUCGUUUUUGGUAGUUUGUUUUAACUUCCAAGGUGGUUUUACUUCUGAUAGCCGGUGAUUUUCCCUCCUAGCAGACAUGCCACACCGG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2498.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2623.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 1799.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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