Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001406782.1
Sequence Length
6109 nt
GC Content
0.5068
AGUCCCGCGACCGAAGCAGGGCGCGCAGCAGCGCUGAGUGCCCCGGAACGUGCGUCGCGCCCCCAGUGUCCGUCGCGUCCGCCGCGCCCCGGGCGGGGAUGGGGCGGCCAGACUGAGCGCCGCACCCGCCAUCCAGACCCGCCGGCCCUAGCCGCAGUCCCUCCAGCCGUGGCCCCAGCGCGCACGGGCGAUGGCGAAGGCGACGUCCGGUGCCGCGGGGCUGCGUCUGCUGUUGCUGCUGCUGCUGCCGCUGCUAGGCAAAGUGGCAUUGGGCCUCUACUUCUCGAGGGAUGCUUACUGGGAGAAGCUGUAUGUGGACCAGGCAGCCGGCACGCCCUUGCUGUACGUCCAUGCCCUGCGGGACGCCCCUGAGGAGGUGCCCAGCUUCCGCCUGGGCCAGCAUCUCUACGGCACGUACCGCACACGGCUGCAUGAGAACAACUGGAUCUGCAUCCAGGAGGACACCGGCCUCCUCUACCUUAACCGGAGCCUGGACCAUAGCUCCUGGGAGAAGCUCAGUGUCCGCAACCGCGGCUUUCCCCUGCUCACCGUCUACCUCAAGGUCUUCCUGUCACCCACAUCCCUUCGUGAGGGCGAGUGCCAGUGGCCAGGCUGUGCCCGCGUAUACUUCUCCUUCUUCAACACCUCCUUUCCAGCCUGCAGCUCCCUCAAGCCCCGGGAGCUCUGCUUCCCAGAGACAAGGCCCUCCUUCCGCAUUCGGGAGAACCGACCCCCAGGCACCUUCCACCAGUUCCGCCUGCUGCCUGUGCAGUUCUUGUGCCCCAACAUCAGCGUGGCCUACAGGCUCCUGGAGGAUGUGGCCGAGGAGGCGGGCUGCCCCCUGUCCUGUGCAGUCAGCAAGAGACGGCUGGAGUGUGAGGAGUGUGGCGGCCUGGGCUCCCCAACAGGCAGGUGUGAGUGGAGGCAAGGAGAUGGCAAAGGGAUCACCAGGAACUUCUCCACCUGCUCUCCCAGCACCAAGACCUGCCCCGACGGCCACUGCGAUGUUGUGGAGACCCAAGACAUCAACAUUUGCCCUCAGGACUGCCUCCGGGGCAGCAUUGUUGGGGGACACGAGCCUGGGGAGCCCCGGGGGAUUAAAGCUGGCUAUGGCACCUGCAACUGCUUCCCUGAGGAGGAGAAGUGCUUCUGCGAGCCCGAAGACAUCCAGGAUCCACUGUGCGACGAGCUGUGCCGCACGGUGAUCGCAGCCGCUGUCCUCUUCUCCUUCAUCGUCUCGGUGCUGCUGUCUGCCUUCUGCAUCCACUGCUACCACAAGUUUGCCCACAAGCCACCCAUCUCCUCAGCUGAGAUGACCUUCCGGAGGCCCGCCCAGGCCUUCCCGGUCAGCUACUCCUCUUCCGGUGCCCGCCGGCCCUCGCUGGACUCCAUGGAGAACCAGGUCUCCGUGGAUGCCUUCAAGAUCCUGGAGGAUCCAAAGUGGGAAUUCCCUCGGAAGAACUUGGUUCUUGGAAAAACUCUAGGAGAAGGCGAAUUUGGAAAAGUGGUCAAGGCAACGGCCUUCCAUCUGAAAGGCAGAGCAGGGUACACCACGGUGGCCGUGAAGAUGCUGAAAGAGAACGCCUCCCCGAGUGAGCUGCGAGACCUGCUGUCAGAGUUCAACGUCCUGAAGCAGGUCAACCACCCACAUGUCAUCAAAUUGUAUGGGGCCUGCAGCCAGGAUGGCCCGCUCCUCCUCAUCGUGGAGUACGCCAAAUACGGCUCCCUGCGGGGCUUCCUCCGCGAGAGCCGCAAAGUGGGGCCUGGCUACCUGGGCAGUGGAGGCAGCCGCAACUCCAGCUCCCUGGACCACCCGGAUGAGCGGGCCCUCACCAUGGGCGACCUCAUCUCAUUUGCCUGGCAGAUCUCACAGGGGAUGCAGUAUCUGGCCGAGAUGAAGCUCGUUCAUCGGGACUUGGCAGCCAGAAACAUCCUGGUAGCUGAGGGGCGGAAGAUGAAGAUUUCGGAUUUCGGCUUGUCCCGAGAUGUUUAUGAAGAGGAUUCCUACGUGAAGAGGAGCCAGGGUCGGAUUCCAGUUAAAUGGAUGGCAAUUGAAUCCCUUUUUGAUCAUAUCUACACCACGCAAAGUGAUGUAUGGUCUUUUGGUGUCCUGCUGUGGGAGAUCGUGACCCUAGGGGGAAACCCCUAUCCUGGGAUUCCUCCUGAGCGGCUCUUCAACCUUCUGAAGACCGGCCACCGGAUGGAGAGGCCAGACAACUGCAGCGAGGAGAUGUACCGCCUGAUGCUGCAAUGCUGGAAGCAGGAGCCGGACAAAAGGCCGGUGUUUGCGGACAUCAGCAAAGACCUGGAGAAGAUGAUGGUUAAGAGGAGAGACUACUUGGACCUUGCGGCGUCCACUCCAUCUGACUCCCUGAUUUAUGACGACGGCCUCUCAGAGGAGGAGACACCGCUGGUGGACUGUAAUAAUGCCCCCCUCCCUCGAGCCCUCCCUUCCACAUGGAUUGAAAACAAACUCUAUGGUAGAAUUUCCCAUGCAUUUACUAGAUUCUAGCACCGCUGUCCCCUUUGCACUAUCCUUCCUCUCUGUGAUGCUUUUUAAAAAUGUUUCUGGUCUGAACAAAACCAAAGUCUGCUCUGAACCUUUUUAUUUGUAAAUGUCUGACUUUGCAUCCAGUUUACAUUUAGGCAUUAUUGCAACUAUGUUUUUCUAAAAGGAUGUGAAAAUAAGUGUAAUUACCACAUUGCCCAGCAACUUAGGAUGGUAGAGGAAAAAACAGAUCAGGGCGGAACUCUCAGGGGAGACCAAGAACAGGUUGAAUAAGGCGCUUCUGGGGUGGGAAUCAAGUCAUAGUACUUCUACUUUAACUAAGUGGAUAAAUAUACAAAUCUGGGGAGGUAUUCAGUUGAGAAAGGAGCCACCAGCACCACUCAGCCUGCACUGGGAGCACAGCCAGGUUCCCCCAGACCCCUCCUGGGCAGGCAGGUGCCUCUCAGAGGCCACCCGGCACUGGCGAGCAGCCACUGGCCAAGCCUCAGCCCCAGUCCCAGCCACAUGUCCUCCAUCAGGGGUAGCGAGGUUGCAGGAGCUGGCUGGCCCUGGGAGGACGCACCCCCACUGCUGUUUUCACAUCCUUUCCCUUACCCACCUUCAGGACGGUUGUCACUUAUGAAGUCAGUGCUAAAGCUGGAGCAGUUGCUUUUUGAAAGAACAUGGUCUGUGGUGCUGUGGUCUUACAAUGGACAGUAAAUAUGGUUCUUGCCAAAACUCCUUCUUUUGUCUUUGAUUAAAUACUAGAAAUUUUUUCUGUUUCCUAACUUCAUCAUUGAUUGUUUGAAAUCUUGGAGUUUCAAGCAUUUUUUUCAAGCUGAGACGGUUCCUUUUGCAUGCCUCCUGACUCACUGACUCCUCACUGGCUUUGUGUCUAGUGCCACACUCCAUUUGUGCUGACGAUGCUAUGAGGCUGGCCCGUGUGCACCCUCGAUUUGGAAGGUCCUCUUCUCCGUUGUAGGCUCAGACAACAGACGAGUGCCUCCUUUACGUUAGAGAAUGUUUUAUAGAACGUUUCCGCUGCAGUAAGCCAUUGAGUGCAGCAGUGUGCUGUUGCCCUACACUGCCUUAGAAAAAGAGUUAAGCAGUUCGACAAAUAUACAUCAGAUUAGAGAGUCUCAAGUUCAUAAAAGUCAAAAUUGGUAGUGUCUGUUAAGUUACAUUUACCAAGAGAGCACAUGAUAUUUCCCCUAACUAUAACAGUGUUUUUGGAAACCUGGAACACAAAACCAUUAAUAUAAUUGGCACAGAAACCACGAGUUUGGUUUGAACAUCAAAGGGAGUUUUGCCAAGGCCUUACUGUCUGCACUUGAAGUUUUGGUUCUUCAGUGCAGAACAAAUGAUCUGUUUUCAUUUUUAGGCAUGUCAGACCCGAACUGGCCUGGAGAGAGUCCUGUACCACUCACGAGAGCUGAUGGCACUAACACUGGGUUUCCAAGAUAUCCAAAUGAUAGUGUAUAUGCUAACUGGAUGCUUUCACCCUCAGCGGCAAAAUUAAUGGACACGUUUGAUAGUUAACAUUUCUUUGUGAAAGGUAAUGGACUCACAAGGGGAAGAAACAUGCUGAGAAUGGAAAGUCUACCGGCCCUUUCUUUGUGAACGUCACAUUGGCCGAGCCGUGUUCAGUUCCCAGGUGGCAGACUCGUUUUUGGUAGUUUGUUUUAACUUCCAAGGUGGUUUUACUUCUGAUAGCCGGUGAUUUUCCCUCCUAGCAGACAUGCCACACCGGGUAAGAGCUCUGAGUCUUAGUGGUUAAGCAUUCCUUUCUCUUCAGUGCCCAGCAGCACCCAGUGUUGGUCUGUGUCCAUCAGUGACCACCAACAUUCUGUGUUCACAUGUGUGGGUCCAACACUUACUACCUGGUGUAUGAAAUUGGACCUGAACUGUUGGAUUUUUCUAGUUGCCGCCAAACAAGGCAAAAAAAUUUAAACAUGAAGCACACACACAAAAAAGGCAGUAGGAAAAAUGCUGGCCCUGAUGACCUGUCCUUAUUCAGAAUGAGAGACUGCGGGGGGGGCCUGGGGGUAGUGUCAAUGCCCCUCCAGGGCUGGAGGGGAAGAGGGGCCCCGAGGAUGGGCCUGGGCUCAGCAUUCGAGAUCUUGAGAAUGAUUUUUUUUAAAUCAUGCAACCUUUCCUUAGGAAGACAUUUGGUUUUCAUCAUGAUUAAGAUGAUUCCUAGAUUUAGCACAAUGGAGAGAUUCCAUGCCAUCUUUACUAUGUGGAUGGUGGUAUCAGGGAAGAGGGCUCACAAGACACAUUUGUCCCCCGGGCCCACCACAUCAUCCUCACGUGUUCGGUACUGAGCAGCCACUACCCCUGAUGAGAACAGUAUGAAGAAAGGGGGCUGUUGGAGUCCCAGAAUUGCUGACAGCAGAGGCUUUGCUGCUGUGAAUCCCACCUGCCACCAGCCUGCAGCACACCCCACAGCCAAGUAGAGGCGAAAGCAGUGGCUCAUCCUACCUGUUAGGAGCAGGUAGGGCUUGUACUCACU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2124.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2237.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 1610.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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