Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001407066.1

Sequence Length

2623 nt

GC Content

0.5334

GUGACCCUAGUCGGCCGCUGAGAGGCGCGCGGAGUCUGGGCCGCUGCCGUCUAGGGGUCCCGUCCCGAGGCGUCCCCGGCAUCUCCGGCCCGAAUCCCGGAGUGCCGGGUCGCGCCUGCACCGAAGGUCCCGGCUCCUGUGCCCUCCCUGCAGCCGUCAGGGCCCGUCCCCCAACUCCCCUUUCCGCUCAGGCAGGGUCCUCGCGGCCCAUGCUGGCCGCUGGGGACCCGCGCAGCCCAGACCGUUCCCGGGCCGGGCAGCCGGCCACCAUGGUGGCCCUGAGGCCUGUGCAGCAACUCCAGGGGGGCUAAAGGGCUCAGAGUGCAGGCCGUGGGGCGCGAGGGUCCCGGGCCUGAGCCCCGCGCCAUGGCCGGGGCCAUCGCUUCCCGCAUGAGCUUCAGCUCUCUCAAGAGGAAGCAACCCAAGACGUUCACCGUGAGGAUCGUCACCAUGGACGCCGAGAUGGAGUUCAAUUGCGAGAUGAAGUGGAAAGGGAAGGACCUCUUUGAUUUGGUGUGCCGGACUCUGGGGCUCCGAGAAACCUGGUUCUUUGGACUGCAGUACACAAUCAAGGACACAGUGGCCUGGCUCAAAAUGGACAAGAAGGUACUGGAUCAUGAUGUUUCAAAGGAAGAACCAGUCACCUUUCACUUCUUGGCCAAAUUUUAUCCUGAGAAUGCUGAAGAGGAGCUGGUUCAGGAGAUCACACAACAUUUAUUCUUCUUACAGGUAAAGAAGCAGAUUUUAGAUGAAAAGAUCUACUGCCCUCCUGAGGCUUCUGUGCUCCUGGCUUCUUACGCCGUCCAGGCCAAGUAUGGUGACUACGACCCCAGUGUUCACAAGCGGGGAUUUUUGGCCCAAGAGGAAUUGCUUCCAAAAAGGGUAAUAAAUCUGUAUCAGAUGACUCCGGAAAUGUGGGAGGAGAGAAUUACUGCUUGGUACGCAGAGCACCGAGGCCGAGCCAGGGAUGAAGCUGAAAUGGAAUAUCUGAAGAUAGCUCAGGACCUGGAGAUGUACGGUGUGAACUACUUUGCAAUCCGGAAUAAAAAGGGCACAGAGCUGCUGCUUGGAGUGGAUGCCCUGGGGCUUCACAUUUAUGACCCUGAGAACAGACUGACCCCCAAGAUCUCCUUCCCGUGGAAUGAAAUCCGAAACAUCUCGUACAGUGACAAGGAGUUUACUAUUAAACCACUGGAUAAGAAAAUUGAUGUCUUCAAGUUUAACUCCUCAAAGCUUCGUGUUAAUAAGCUGAUUCUCCAGCUAUGUAUCGGGAACCAUGAUCUAUUUAUGAGGAGAAGGAAAGCCGAUUCUUUGGAAGUUCAGCAGAUGAAAGCCCAGGCCAGGGAGGAGAAGGCUAGAAAGCAGAUGGAGCGGCAGCGCCUCGCUCGAGAGAAGCAGAUGAGGGAGGAGGCUGAACGCACGAGGGAUGAGUUGGAGAGGAGGCUGCUGCAGAUGAAAGAAGAAGCAACAAUGGCCAACGAAGCACUGAUGCGGUCUGAGGAGACAGCUGACCUGUUGGCUGAAAAGGCCCAGAUCACCGAGGAGGAGGCAAAACUUCUGGCCCAGAAGGCCGCAGAGGCUGAGCAGGAAAUGCAGCGCAUCAAGGCCACAGCGAUUCGCACGGAGGAGGAGAAGCGCCUGAUGGAGCAGAAGGUGCUGGAAGCCGAGGUGCUGGCACUGAAGAUGGCUGAGGAGUCAGAGAGGAGGGCCAAAGAGGCAGAUCAGCUGAAGCAGGACCUGCAGGAAGCACGCGAGGCGGAGCGAAGAGCCAAGCAGAAGCUCCUGGAGAUUGCCACCAAGCCCACGUACCCGCCCAUGAACCCAAUUCCAGCACCGUUGCCUCCUGACAUACCAAGCUUCAACCUCAUUGGUGACAGCCUGUCUUUCGACUUCAAAGAUACUGACAUGAAGCGGCUUUCCAUGGAGAUAGAGAAAGAAAAAGUGGAAUACAUGGAAAAGAGCAAGCAUCUGCAGGAGCAGCUCAAUGAACUCAAGACAGAAAUCGAGGCCUUGAAACUGAAAGAGAGGGAGACAGCUCUGGAUAUUCUGCACAAUGAGAACUCCGACAGGGGUGGCAGCAGCAAGCACAAUACCAUUAAAAAGCCUCAAGCCCAAGGCAGAAGACCUAUCUGCAUUUGAGCCCUCAAACUUCCUCUCCAUAGGCUGAGCAGAGAUGUGGUCAGAGUGAACUCACAUUGGAACAGUACACUCACGGCACCCUGGAGAGGAGCGGUCACUGGUUGCUGAGUGAAUUAACCGAAUGUUUGCUGCUUUUCUCCUGCAACAGUUCAUUAUUCCUCCAGCAUGCCUAGGCAGUGGAGAGAAUGUAUUUUGCCCAAUAAUAAAAUGACAUCCUGCCUCUACUUCUCACCUAAUCCCCAGUAGUACCCAUGCCAACAAGCCCCACACCACCUGACAGCAGCAUAGGAUGUGUCCUUUGGAGUCUUCCCUGCAGUUUCUGCUCAUAGAGUGGAAUAAGCUCAUUGGAACCUUUCUAACAAAAAGAGAUCUGGCAUAAGAUAGAUCCUACUUGUGGUCGUUAUCCCAUCAAGAGAGGUCAGCUGUUAAAGUCCCUGAUAGAUCUUAUUAAAAGGUACACUUGAGCUGUCAGUGGUUCCAAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-916.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -964.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 589.80

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((.(.((((.((.(.((((.((((((((((.(((((..(((.......(((......))).((((((.(((((((.((((((........)))))))))))))..))))))))).....))))).)))))).)))))))).).)).)))).)))))..((((((....((((((((((((((((.((.((((((((((((((......)))))).))))))))))((.((((.(.(((....))).).)))).))..(((.(((((((.((((((((.(((....(((..((....))..)))..))).))))).).))..))))))))))((((.((((((((.((((.((.....)))).)))))))))).)))).((.(((((((((((((.(((........((.......))....((((((..((((......))))..))))))..))).)))))))))..)))).)))).)))))))))))..((.((((..((.(((.(((((((((((.((((((.((..((..(((((((...((((((.((.(((........(((((((((.((((((((.(((...(((...(((((((((((.((.................)).))))).))))))...)))))))))........(((((((...(((.......)))...))))))).........................((((...((..((((....(((((......))))))))).))))))))))).))))).)))).......))))).)))))))))).....)))..))..)))))))).))))..((((((..((((((.((((....((((....)))).....)))).....(((((...)))))..((((.........))))..))))))..))))))))))))).)))))..)))))))))...)))))).........((((((..((((...(((((((((..(((((..((((.((((.....)))).)))).))))).....((((((((((..(((((((.((((.((((.((...((((((((.............(((....))).......(((....((((((.(((.(((..((...(((((....(((((((((.(((((.(((((((....((((((....(((((..........)))))....)))))).......))))))).)))))...(((((......))))).)))).)))))..(((((.....)))))((((...((....))..)))))))))..((((.....))))....))..))))))))))))..(((....))).......(((.((((.((((.(((.............))).))))..))))..)))....)))....(((((...((..(((((((..(((...(((((..(((.((.((..........)).)).)))((((((.((...(((((((....)))))))......))))))))...(((((((((((((((((((((...))))))(((.....)))((.((((((.((.(((.((.((((((((....(((((..(((.((.((((.(((((.......(((((((..((((((((((..((.(((((.(((........(((((....))))).((..((..(((.....)))...))..))...((((...((.(((((.((..((..(((..........)))..))....))))))).)).))))......)))...))))))).............)))))))))).))).))))...........)))))..)))).)).))).....(((((((..((.((((.((...(((.((.((.((.((((((((((..........................))))))...))))..)).)))))))......))...)))).))))))))).))))).))))))))..((.......)).......)).))).)).)))))).))....(((((....((((((.((.(((((((((((......................((.(((((((((.......))))).)))).))........((((((((((..(((((....(((.((((.((((.(((....))).)))....).))))))).)))).)..))))))))))((((((((........))))).....)))..))))))))))))).))))))....)))))..((((((((((.(.(((....))))))))).)))))..)))))))................)))).))))..)))))......)))..)))))))..))...))))))))))))))))))))))))))))))......))))))))))(((....)))..((...((((((((...))))))))...))........((((((((.((((..((.((((((........))))))))..))))((........))....))))))))...((((((.......))))))(((((.....)))))...)))))))))))))..))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,.((((.(.((((.((.(.((((.((((((((((.(((((..(((......{(((......))).((((((.(((((((.((((((........)))))))))))))..))))))))}.....))))).)))))).)))))))).}.)).)))).)))))..((((((....((((((((((((((({.((.((((((((((((((......)))))).))))))))))((.((((.{.(((....))).}.)))).)).,(((.({{{{||,(({(((((.(((....(((..((....))..)))..))).))))).}.)).,)))}}||||}((({.(((((({{|({{(.((...,.}}}}.)))))))))).}))).{(.(((((((((((((.{(({{....,.((......,)}..{.((((((..((((......))))..))))))..))).)))))))))..)))).)})),}))))))))))..((.((((..((.(((.(((((((((((.((((((.{{,{((..(((((((,..{(((((.((.(((.....,{.(((((((((.((((((((.(({...(({...(((((((((((.((.,,.....||....,,.)).))))).))))))...}))))))))........(((((((...(((.......)))...))))))),,.......................((((...{{..((((....(((((......))))))))).,}))))))))).))))).))))}}.....))))).)))))))))).....)))..)).,)})))))).))))..((((((.,((((((.((((....((({....}))).....)))).....(((((...)))))..((((.,.....}.))))..)))))),.))))))))))))),)),))..)))))))))...)))))).........((((((..(({,.,{(((((((((..(((((..((((.((((.....)))).)))).))))).....((((((((((..(((((((.((((.((((.((...((((((((,.......,,...(((....)))..,....,,,....((((((((((,(((,.(,...{{{({..{{(({{{,.{{{({.,..{{{(({{....,|||||,,,,|{{{,..,....|..}}}}},,.,|}}}},{{{{{{...|||{|{||||.,,.{((((,...,,|||}}.,|,|{|||,..,(,{,,,,,..,,,}},))},.,||....))}}),},))}},..,|||}}..,)},,.}},}),,)},})))))))}..{{|....})).......(((.((((.((((.((({...........}))).))))..))))..))).}..))),,,.{|(((,..((.,(((((((..(((....,.,{.,{|{.{,.,{{{,......||,.||.}||((((({.{{,,,|{((({,.,,,}}||||}....,,)}}}}}}}...{(((((((({{{,,.{{{{{(|,,,,,,,)|||...,.))}|,.((({{{.{{.{{{.{|.|({{((({....{{|||,,|||,|,,||||.|{(((,,,{..,({{{{{{..((((((((({,,,{.((((({({{.{(,..,.((({(,,,,|||||,,,.{{{{,(((.....)))...|},{|||..((((,,.((.((((,,((..((..(((..........)))..))....))))))).)).,}|||,||..}}},..}},,,,)}............}))))))))).|)},|))},..,,......)))))..}))}.}},)))...,.(((((((,,(,,((((..,...{{{.,,,||,||,{{((((((((..........................))))))},.||||..||.|||}},)||}}.}))}..}},,.}}})))))).,,}}).))))))))..{{......,,}}....,.)).))),)}.}))))).,,...|{{(({....((((((.||.(((((((((((......................((.((({(((((.......))))).}))).))........{(((((((((..(((((....{{{.((({.((((.(((....))).))),..,}.},)}))).}))).}..)))))))))}((((((((........))))}....,)))..))))))))))),,.)))))),...))))).,|{{(((((((.(.(((....))))))))).))}||{{{||||,,......}}}}}},.,,)))).)))),.)))))}..,..)))..))))))).})}.,.))}})}))))))))))))))))))))))))......)))))))))){{{....|||..({{{,((((((((...))))))))...))},...|||{{{{{{|{.,,,...{(,((((((......,.}}|}}|||.{|||{((........))).}})))))))},.,{{|||,..,,...}}}}}}|||||.....}))))...)))))))))))))..))))))....