Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001407077.1

Sequence Length

1814 nt

GC Content

0.6136

AGACGUCCCGGGUCCGGCGCGGGGAAGGCAGCCUGGCGCGCGCUAAUUGCCUAUUGGCCUGUGCUGCCGGCUCGCAGCCCGGGUGGACCCGAGCCACGCCCCCUGGAGUGCGCCGGAAAGCCGGGCGCGCUAGAGCUCGCGGGAGGCCAUCAUGAGGAAGCCACGAGCAGCCGUGGGAAGUGGUCACAGGAAGCAGGCAGCCAGCCAGGAAGGGAGGCAGAAGCAUGCUAAGAACAACAGUCAGGCCAAGCCUUCUGCCUGUGAUGGGAUGAUUGCUGAGUGUCCUGGGGCCCCAGCAGGCCUGGCCAGGCAGCCGGAAGAGGUGGUAUUGCAGGCCUCUGUCUCCUCAUACCAUCUAUUCAGAGACGUAGCUGAAGUCACAGCCUUCCGAGGGAGCCUGCUAAGCUGGUACGACCAAGAGAAACGGGACCUACCAUGGAGAAGACGGGCAGAAGAUGAGAUGGACCUGGACAGGCGGGCAUAUGCUGUGUGGGUCUCAGAGGUCAUGCUGCAGCAGACCCAGGUUGCCACUGUGAUCAACUACUAUACCGGAUGGAUGCAGAAGUGGCCUACACUGCAGGACCUGGCCAGUGCUUCCCUGGAGGAGGUGAAUCAACUCUGGGCUGGCCUGGGCUACUAUUCUCGUGGCCGGCGGCUGCAGGAGGGAGCUCGGAAGGUGGUAGAGGAGCUAGGGGGCCACAUGCCACGUACAGCAGAGACCCUGCAGCAGCUCCUGCCUGGCGUGGGGCGCUACACAGCUGGGGCCAUUGCCUCUAUCGCCUUUGGCCAGGCAACCGGUGUGGUGGAUGGCAACGUAGCACGGGUGCUGUGCCGUGUCCGAGCCAUUGGUGCUGAUCCCAGCAGCACCCUUGUUUCCCAGCAGCUCUGGGGUCUAGCCCAGCAGCUGGUGGACCCAGCCCGGCCAGGAGAUUUCAACCAAGCAGCCAUGGAGCUAGGGGCCACAGUGUGUACCCCACAGCGCCCACUGUGCAGCCAGUGCCCUGUGGAGAGCCUGUGCCGGGCACGCCAGAGAGUGGAGCAGGAACAGCUCUUAGCCUCAGGGAGCCUGUCGGGCAGUCCUGACGUGGAGGAGUGUGCUCCCAACACUGGACAGUGCCACCUGUGCCUGCCUCCCUCGGAGCCCUGGGACCAGACCCUGGGAGUGGUCAACUUCCCCAGAAAGGCCAGCCGCAAGCCCCCCAGGGAGGAGAGCUCUGCCACCUGUGUUCUGGAACAGCCUGGGGCCCUUGGGGCCCAAAUUCUGCUGGUGCAGAGGCCCAACUCAGGUCUGCUGGCAGGACUGUGGGAGUUCCCGUCCGUGACCUGGGAGCCCUCAGAGCAGCUUCAGCGCAAGGCCCUGCUGCAGGAACUACAGCGUUGGGCUGGGCCCCUCCCAGCCACGCACCUCCGGCACCUUGGGGAGGUUGUCCACACCUUCUCUCACAUCAAGCUGACAUAUCAAGUAUAUGGGCUGGCCUUGGAAGGGCAGACCCCAGUGACCACCGUACCACCAGGUGCUCGCUGGCUGACGCAGGAGGAAUUUCACACCGCAGCUGUUUCCACCGCCAUGAAAAAGGUUUUCCGUGUGUAUCAGGGCCAACAGCCAGGGACCUGUAUGGGUUCCAAAAGGUCCCAGGUGUCCUCUCCGUGCAGUCGGAAAAAGCCCCGCAUGGGCCAGCAAGUCCUGGAUAAUUUCUUUCGGUCUCACAUCUCCACUGAUGCACACAGCCUCAACAGUGCAGCCCAGUGACACCUCUGAAAGCCCCCAUUCCCUGAGAAUCCUGUUGUUAGUAAAGUGCUUAUUUUUGUAGUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-769.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -800.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 585.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((((((.(.((((....((((((.((((.((((.....(((....)))..)))))))))))).))..)))).))))))))).(((((..(((.(((((((((((((....)).))))))))...(((((.((....((.......))...)).)))))..))).)))..))))).(((((((..(((((((.((((((((((((((((((((((..(((..((.......)).)))...).)))))))))..((((((....((...((((((((((((((....))..(((((...((((.(((((((((((((((((.(.((((....)))).)..))))))))(((((((.(((...((((......)))).((((((((((((..((..((.((((((..(((........((((((......))....(((((((...........(((..(((.((((..((((....((((((.((((......((((.(((....)))))))......(((((((((.....((((((((((((.((..((((...(((.....)))))))...((((((((..(((..(((((((..(......)..)))))))..)))(((((((.((.((((.((((((...)))))))))).)))))))))(((((((((((((((((..((.(((.(((((((......((((.....)))).((((...)))).))))))).))).))....))))..........))))))))))))))))))))))).))))))))))))(((((..((..((((((........)))))).)).))))).(((((((.......)))))))........(((.((((((((((......))))).))))).))).(((((((((((..((.........)).....)))..)).))).)))..))))))).)))))))))))))))).)))).))))))((((((.(((.((...)).))).)))))).((.(((.(((((((.......)))))..))))).))..)))))))(.(((.((((.......)))).))).))))).....)))...)))))).))..))..).)))))))))))(((.(((......))).))).((((.(((((((((((....((((.(((.((((..(((((((....(((((.(........).))))).......)))))))..)))).)))......(((((....)))))))))......((((..(((((.(((.((.((((.(((((((((...)))..)))))).)))).))......((((((.((..((((...))))..))...))))))(((((((.....))))))).....))))))))))))))))))))))).))))........(((........)))(((((.....))))).((((((((..(..((((.....(((((((.((((.........)))).)))))))(((((((((((((......(((((...(((((((((...((((((.(((....))).)))).))....)))..))))))..(((((((...(((...)))..))))))).)))))..))))).))).))))).....))))..)..))))))))..))))))))))...)))))))))....((((......))))......))))...))).))..))))).)))).)))...))...)))))))))).....)))))..))).))....))))).))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,,....((((((({.(.((((....((((((.((((,((((,{,,.{{{.,,,)))..))))}))))))).))..)))).})))))))).(((((..(((.(((((((((((((....))}))))))))...(((((.((....((.......))...)).)))))..))).)))..))))).(((((((..(((((((,((((((((((((((((((((((.{(((..{,,{....})}.))}.,.),}))))))))..((((((....{,.{.(((((((((((((({{{{{,.,{{||||..{|||.{((((((((((((((((.(.((((....)))).}..))))))))|((((((.(((...((((..,,,.}}||{{(((((((,,(({{(({..,{(((((.{.((..,.....,|||,|.},}}}.|,...,|.|||||.,..{,.{{{{.((..,(({(((,{(((((...{(((,((,(((,(((..{(((({((({{{{(({||{|{{((((((({(((({.{{{.((,{,,,,,,||.||}.|||||.{{((.....)}))||{{{.,,(((({((.((({((((((,({.(({....,..,}}||||{{|||((,(((({(....,,.||||||...||||,|.,{{({{{{|,,{|.((((((((..(,,{{{.{(((((({(.{,((({{{.{{(,{,.{.{{|}{|{(,,({{{|{{{{((((|||((((({|....|}}.{{{((....}))))}},}))))},,))))))),.}}|||||}}}||{{|||,.{{..{{{{{{,,}}},}}}}))))})|,|}||,.(((((((.......)))))))..}}.,},(((.((((((((((......))))).))))).))).....(((((((((((....,,,.........,{{{{((.((,.,|(({{(({{{(,({.,..,,,,),)),)}))))),.})),.,)).)})))),,..)))).))))))),}}||,({(.{{(((((.......))))}..}})}).|)}})))))}.)))}..)}))))}))}),},,))),))))))....})}}.}.,))))))))..,)}.),}))))))),))||(|(((......}}},|||,({||.|,|||||||||}..}||}}}|||.|,.|}}}}}}}||}},,.,|||.|}}}}}}}})}}}}}}},..}}}))))((((((,,,})))}}....(((((....))))))}},...,,..)))))}}}||}||({(,.,(((.,,,||||||}}})))}},,)))))),)).))}}}}}.((((((.((..((((...))))..))...))))))(((((((.....))))))).})),{{{{|,,}...,,},))))))))}))),.}}.}})}}}...,,.,{{|,,{{(({...,,}))))}|||{{|||,,|,,||{{.,,,.(((((((.((((.........)))).)))))))(((((((((((((......(((((...((((((,{(...(((((({((,...,))),}))).))....)))..))))))..(((((((...(((...)))..))))))).))))),,))))).))).))))).....||||..,..))))))))..)))))))))}...))))))))),...,{{(......)}||{,,...}},,...,})))},,))))).))))}})).,.,}...)))))))))).....))))),,)},.)}....))))).))))))).,,,.