Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001407274.1
Sequence Length
3233 nt
GC Content
0.4943
GCAGUAAGUCCCGCUUGGCCCUGGAGUCCACGCGGAUUUUCGAAGCUGGGGCUGGCAAGAGGCCGCUGGACACCACGCUCCAGUCGUCAGCCCACUUCCUAGCUGAACAGCGCGAGGCGGCGGCAGCGAGCCGGGUCCCACCAUGGCCGCGAAUUAUUCCAGUACCAGUACCCGGAGAGAACAUGUCAAAGUUAAAACCAGCUCCCAGCCAGGCUUCCUGGAACGGCUGAGCGAGACCUCGGGUGGGAUGUUUGUGGGGCUCAUGGCCUUCCUGCUCUCCUUCUACCUAAUUUUCACCAAUGAGGGCCGCGCAUUGAAGACGGCAACCUCAUUGGCUGAGGGGCUCUCGCUUGUGGUGUCUCCCGACAGCAUCCACAGUGUGGCUCCGGAGAAUGAAGGAAGGCUGGUGCACAUCAUUGGCGCCUUACGGACAUCCAAGCUUUUGUCUGAUCCAAACUAUGGGGUCCAUCUUCCGGCUGUGAAACUGCGGAGGCACGUGGAGAUGUACCAAUGGGUAGAAACUGAGGAGUCCAGGGAGUACACCGAGGAUGGGCAGGUGAAGAAGGAGACGAGGUAUUCCUACACAGACACUGAAUGGAGGUCAGAAAUCAUCAACAGCAAAAACUUCGACCGAGAGAUUGGCCACAAAAACCCCAGUGCCAUGGCAGUGGAGUCAUUCAUGGCAACAGCCCCCUUUGUCCAAAUUGGCAGGUUUUUCCUCUCGUCAGGCCUCAUCGACAAAGUCGACAACUUCAAGUCCCUGAGCCUAUCCAAGCUGGAGGACCCUCAUGUGGACAUCAUUCGCCGUGGAGACUUUUUCUACCACAGCGAAAAUCCCAAGUAUCCAGAGGUGGGAGACUUGCGUGUCUCCUUUUCCUAUGCUGGACUGAGCGGCGAUGACCCUGACCUGGGCCCAGCUCACGUGGUCACUGUGAUUGCCCGGCAGCGGGGUGACCAGCUAGUCCCAUUCUCCACCAAGUCUGGGGAUACCUUACUGCUCCUGCACCACGGGGACUUCUCAGCAGAGGAGGUGUUUCAUAGAGAACUAAGGAGCAACUCCAUGAAGACCUGGGGCCUGCGGGCAGCUGGCUGGAUGGCCAUGUUCAUGGGCCUCAACCUUAUGACACGGAUCCUCUACACCUUGGUGGACUGGUUUCCUGUUUUCCGAGACCUGGUCAACAUUGGCCUGAAAGCCUUUGCCUUCUGUGUGGCCACCUCGCUGACCCUGCUGACCGUGGCGGCUGGCUGGCUCUUCUACCGACCCCUGUGGGCCCUCCUCAUUGCCGGCCUGGCCCUUGUGCCCAUCCUUGUUGCUCGGACACGGGUGCCAGCCAAAAAGUUGGAGUGAAAAGACCCUGGCACCCGCCCGACACCUGCGUGAGCCCUAGGAUCCAGGUCCUCUCUCACCUCUGACCCAGCUCCAUGCCAGAGCAGGAGCCCCGGUCAAUUUUGGACUCUGCACUCCCUCUCCUCUUCAGGGGCCAGACUUGGCAGCAUGUGCACCAGGUUGGUGUUCACCAGCUCAUGUCUUCCCCACAUCUCUUCUUGCCAGUAAGCAGCUUUGGUGGGCAGCAGCAGCUCAUGAAUGGCAAGCUGACAGCUUCUCCUGCUGUUUCCUUCCUCUCUUGGACUGAGUGGGUACGGCCAGCCACUCAGCCCAUUGGCAGCUGACAACGCAGACACGCUCUACGGAGGCCUGCUGAUAAAGGGCUCAGCCUUGCCGUGUGCUGCUUCUCAUCACUGCACACAAGUGCCAUGCUUUGCCACCACCACCAAGCACAUCUGUGAUCCUGAAGGGCGGCCGUUAGUCAUUACUGCUGAGUCCUGGGUCACCAGCAGACACACUGGGCAUGGACCCCUCAAAGCAGGCACACCCAAAACACAAGUCUGUGGCUAGAACCUGAUGUGGUGUUUAAAAGAGAAGAAACACUGAAGAUGUCCUGAGGAGAAAAGCUGGACAUAUACUGGGCUUCACACUUAUCUUAUGGCUUGGCAGAAUCUUUGUAGUGUGUGGGAUCUCUGAAGGCCCUAUUUAAGUUUUUCUUCGUUACUUUGCUGCUUCAUGUGUACUUUCCUACCCCAAGAGGAAGUUUUCUGAAAUAAGAUUUAAAAACAAAACAAAAAAAACACUUAAUAUUUCAGACUGUUACAGGAAACACCCUUUAGUCUGUCAGUUGAAUUCAGAGCACUGAAAGGUGUUAAAUUGGGGUAUGUGGUUUGAUUGAUAAAAAGUUACCUCUCAGUAUUUUGUGUCACUGAGAAGCUUUACAAUGGAUGCUUUUGAAACAAGUAUCAGCAAAAGGAUUUGUUUUCACUCUGGGAGGAGAGGGUGGAGAAAGCACUUGCUUUCAUCCUCUGGCAUCGGAAACUCCCCUAUGCACUUGAAGAUGGUUUAAAAGAUUAAAGAAACGAUUAAGAGAAAAGGUUGGAAGCUUUAUACUAAAUGGGCUCCUUCAUGGUGACGCCCCGUCAACCACAAUCAAGAACUGAGGCCUGAGGCUGGUUGUACAAUGCCCACGCCUGCCUGGCUGCUUUCACCUGGGAGUGCUUUCGAUGUGGGCACCUGGGCUUCCUAGGGCUGCUUCUGAGUGGUUCUUUCACGUGUUGUGUCCAUAGCUUUAGUCUUCCUAAAUAAGAUCCACCCACACCUAAGUCACAGAAUUUCUAAGUUCCCCAACUACUCUCACACCCUUUUAAAGAUAAAGUAUGUUGUAACCAGGAUGUCUUAAAUGAUUCUUUGUGUACCUUUUCUGUCAUAUUCAGAAACCGUUUUGUGCCUGCUGGGAGUAAUUCCUUUAGCAAUUAAGUAUUUGGUAGCUGAAUAAGGGGUCAGAACUUCUGAAACCAGAGAUCUGUAAUCAUCUCUAUUGGCCUGGGGUGCCUGUGCUAUAAAUGAGUUUCUUCACAUGAAAAACACAGCCAGCCCAAGAUGACUUAUCUGGGUUUAGGAUUCAAUAGUAUUCACUAACUGCUUAUUACAUGAGCAAUUUCAUCAAAUCUCCAAACUCUUAAAGGAUGCUUUCGGAAAACACGCUGUAUACCUAGAUGAUGACUAAAUGCAAAAUCCUUGGGCUUUGGUUUUUUUCUAGUAAGGAUUUUAAAUAACUGCCGACUUCAAAAGUGUUCUUAAAACGAAAGAUAAUGUUAAGAAAAAUUUGAAAGCUUUGGAAAACCAAAUUUGUAAUAUCAUUGUAUUUUUUAUUAAAAGUUUUGUAAUAAAUUUCUAAAUUAUC

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1077.14 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1136.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 771.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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