Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001407278.1
Sequence Length
3215 nt
GC Content
0.4933
GCAGUAAGUCCCGCUUGGCCCUGGAGUCCACGCGGAUUUUCGAAGCUGGGGCUGGCAAGAGGCCGCUGGACACCACGCUCCAGUCGUCAGCCCACUUCCUAGCUGAACAGCGCGAGGCGGCGGCAGCGAGCCGGGUCCCACCAUGGCCGCGAAUUAUUCCAGUACCAGUACCCGGAGAGAACAUGUCAAAGUUAAAACCAGCUCCCAGCCAGGCUUCCUGGAACGGCUGAGCGAGACCUCGGGUGGGAUGUUUGUGGGGCUCAUGGCCUUCCUGCUCUCCUUCUACCUAAUUUUCACCAAUGAGACGGCAACCUCAUUGGCUGAGGGGCUCUCGCUUGUGGUGUCUCCCGACAGCAUCCACAGUGUGGCUCCGGAGAAUGAAGGAAGGCUGGUGCACAUCAUUGGCGCCUUACGGACAUCCAAGCUUUUGUCUGAUCCAAACUAUGGGGUCCAUCUUCCGGCUGUGAAACUGCGGAGGCACGUGGAGAUGUACCAAUGGGUAGAAACUGAGGAGUCCAGGGAGUACACCGAGGAUGGGCAGGUGAAGAAGGAGACGAGGUAUUCCUACAACACUGAAUGGAGGUCAGAAAUCAUCAACAGCAAAAACUUCGACCGAGAGAUUGGCCACAAAAACCCCAGUGCCAUGGCAGUGGAGUCAUUCAUGGCAACAGCCCCCUUUGUCCAAAUUGGCAGGUUUUUCCUCUCGUCAGGCCUCAUCGACAAAGUCGACAACUUCAAGUCCCUGAGCCUAUCCAAGCUGGAGGACCCUCAUGUGGACAUCAUUCGCCGUGGAGACUUUUUCUACCACAGCGAAAAUCCCAAGUAUCCAGAGGUGGGAGACUUGCGUGUCUCCUUUUCCUAUGCUGGACUGAGCGGCGAUGACCCUGACCUGGGCCCAGCUCACGUGGUCACUGUGAUUGCCCGGCAGCGGGGUGACCAGCUAGUCCCAUUCUCCACCAAGUCUGGGGAUACCUUACUGCUCCUGCACCACGGGGACUUCUCAGCAGAGGAGGUGUUUCAUAGAGAACUAAGGAGCAACUCCAUGAAGACCUGGGGCCUGCGGGCAGCUGGCUGGAUGGCCAUGUUCAUGGGCCUCAACCUUAUGACACGGAUCCUCUACACCUUGGUGGACUGGUUUCCUGUUUUCCGAGACCUGGUCAACAUUGGCCUGAAAGCCUUUGCCUUCUGUGUGGCCACCUCGCUGACCCUGCUGACCGUGGCGGCUGGCUGGCUCUUCUACCGACCCCUGUGGGCCCUCCUCAUUGCCGGCCUGGCCCUUGUGCCCAUCCUUGUUGCUCGGACACGGGUGCCAGCCAAAAAGUUGGAGUGAAAAGACCCUGGCACCCGCCCGACACCUGCGUGAGCCCUAGGAUCCAGGUCCUCUCUCACCUCUGACCCAGCUCCAUGCCAGAGCAGGAGCCCCGGUCAAUUUUGGACUCUGCACUCCCUCUCCUCUUCAGGGGCCAGACUUGGCAGCAUGUGCACCAGGUUGGUGUUCACCAGCUCAUGUCUUCCCCACAUCUCUUCUUGCCAGUAAGCAGCUUUGGUGGGCAGCAGCAGCUCAUGAAUGGCAAGCUGACAGCUUCUCCUGCUGUUUCCUUCCUCUCUUGGACUGAGUGGGUACGGCCAGCCACUCAGCCCAUUGGCAGCUGACAACGCAGACACGCUCUACGGAGGCCUGCUGAUAAAGGGCUCAGCCUUGCCGUGUGCUGCUUCUCAUCACUGCACACAAGUGCCAUGCUUUGCCACCACCACCAAGCACAUCUGUGAUCCUGAAGGGCGGCCGUUAGUCAUUACUGCUGAGUCCUGGGUCACCAGCAGACACACUGGGCAUGGACCCCUCAAAGCAGGCACACCCAAAACACAAGUCUGUGGCUAGAACCUGAUGUGGUGUUUAAAAGAGAAGAAACACUGAAGAUGUCCUGAGGAGAAAAGCUGGACAUAUACUGGGCUUCACACUUAUCUUAUGGCUUGGCAGAAUCUUUGUAGUGUGUGGGAUCUCUGAAGGCCCUAUUUAAGUUUUUCUUCGUUACUUUGCUGCUUCAUGUGUACUUUCCUACCCCAAGAGGAAGUUUUCUGAAAUAAGAUUUAAAAACAAAACAAAAAAAACACUUAAUAUUUCAGACUGUUACAGGAAACACCCUUUAGUCUGUCAGUUGAAUUCAGAGCACUGAAAGGUGUUAAAUUGGGGUAUGUGGUUUGAUUGAUAAAAAGUUACCUCUCAGUAUUUUGUGUCACUGAGAAGCUUUACAAUGGAUGCUUUUGAAACAAGUAUCAGCAAAAGGAUUUGUUUUCACUCUGGGAGGAGAGGGUGGAGAAAGCACUUGCUUUCAUCCUCUGGCAUCGGAAACUCCCCUAUGCACUUGAAGAUGGUUUAAAAGAUUAAAGAAACGAUUAAGAGAAAAGGUUGGAAGCUUUAUACUAAAUGGGCUCCUUCAUGGUGACGCCCCGUCAACCACAAUCAAGAACUGAGGCCUGAGGCUGGUUGUACAAUGCCCACGCCUGCCUGGCUGCUUUCACCUGGGAGUGCUUUCGAUGUGGGCACCUGGGCUUCCUAGGGCUGCUUCUGAGUGGUUCUUUCACGUGUUGUGUCCAUAGCUUUAGUCUUCCUAAAUAAGAUCCACCCACACCUAAGUCACAGAAUUUCUAAGUUCCCCAACUACUCUCACACCCUUUUAAAGAUAAAGUAUGUUGUAACCAGGAUGUCUUAAAUGAUUCUUUGUGUACCUUUUCUGUCAUAUUCAGAAACCGUUUUGUGCCUGCUGGGAGUAAUUCCUUUAGCAAUUAAGUAUUUGGUAGCUGAAUAAGGGGUCAGAACUUCUGAAACCAGAGAUCUGUAAUCAUCUCUAUUGGCCUGGGGUGCCUGUGCUAUAAAUGAGUUUCUUCACAUGAAAAACACAGCCAGCCCAAGAUGACUUAUCUGGGUUUAGGAUUCAAUAGUAUUCACUAACUGCUUAUUACAUGAGCAAUUUCAUCAAAUCUCCAAACUCUUAAAGGAUGCUUUCGGAAAACACGCUGUAUACCUAGAUGAUGACUAAAUGCAAAAUCCUUGGGCUUUGGUUUUUUUCUAGUAAGGAUUUUAAAUAACUGCCGACUUCAAAAGUGUUCUUAAAACGAAAGAUAAUGUUAAGAAAAAUUUGAAAGCUUUGGAAAACCAAAUUUGUAAUAUCAUUGUAUUUUUUAUUAAAAGUUUUGUAAUAAAUUUCUAAAUUAUC

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1064.14 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1124.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 785.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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